SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:23c121b6-9125-4cb3-b5a2-e8aeb852a85b"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:23c121b6-9125-4cb3-b5a2-e8aeb852a85b" > Proteogenomics of n...

Proteogenomics of non-small cell lung cancer reveals molecular subtypes associated with specific therapeutic targets and immune-evasion mechanisms

Lehtiö, Janne (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Arslan, Taner (författare)
Karolinska Institute
Siavelis, Ioannis (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
visa fler...
Pan, Yanbo (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Socciarelli, Fabio (författare)
Karolinska Institute
Berkovska, Olena (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Umer, Husen M. (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Mermelekas, Georgios (författare)
Karolinska Institute
Pirmoradian, Mohammad (författare)
Karolinska Institute
Jönsson, Mats (författare)
Lund University,Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Brunnström, Hans (författare)
Lund University,Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Patologi, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Pathology, Lund,Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Region Skåne
Brustugun, Odd Terje (författare)
Oslo university hospital,Vestre Viken Health Trust
Purohit, Krishna Pinganksha (författare)
University of Edinburgh
Cunningham, Richard (författare)
University of Edinburgh
Foroughi Asl, Hassan (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital
Isaksson, Sofi (författare)
Lund University,Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Arbajian, Elsa (författare)
Lund University,Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Aine, Mattias (författare)
Lund University,Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Karlsson, Anna (författare)
Lund University,Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Kotevska, Marija (författare)
Lund University,Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital
Gram Hansen, Carsten (författare)
University of Edinburgh
Drageset Haakensen, Vilde (författare)
Oslo university hospital
Helland, Åslaug (författare)
University of Oslo,Oslo university hospital
Tamborero, David (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Johansson, Henrik J. (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Branca, Rui M. (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Planck, Maria (författare)
Lund University,Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital
Staaf, Johan (författare)
Lund University,Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Orre, Lukas M. (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2021-11-22
2021
Engelska 19 s.
Ingår i: Nature Cancer. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2662-1347. ; 2:11, s. 1224-1242
Relaterad länk:
http://dx.doi.org/10...
visa fler...
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
http://kipublication...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Despite major advancements in lung cancer treatment, long-term survival is still rare and a deeper understanding of molecular phenotypes would allow the identification of specific cancer dependencies and immune-evasion mechanisms. Here we performed in-depth mass-spectrometry-based proteogenomic analysis of 141 tumors representing all major histologies of non-small cell lung cancer (NSCLC). We identified six distinct proteome subtypes with striking differences in immune cell composition and subtype-specific expression of immune checkpoints. Unexpectedly, high neoantigen burden was linked to global hypomethylation and complex neoantigens mapped to genomic regions, such as endogenous retroviral elements and introns, in immune-cold subtypes. Further, we linked immune evasion with LAG-3 via STK11 mutation-dependent HNF1A activation and FGL1 expression. Finally, we develop a data-independent acquisition mass-spectrometry-based NSCLC subtype classification method, validate it in an independent cohort of 208 NSCLC cases and demonstrate its clinical utility by analyzing an additional cohort of 84 late-stage NSCLC biopsy samples.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy