SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-308904"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-308904" > Genome-wide repress...

Genome-wide repression of eRNA and target gene loci by the ETV6-RUNX1 fusion in acute leukemia

Teppo, Susanna (författare)
Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland.
Laukkanen, Saara (författare)
Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland.
Liuksiala, Thomas (författare)
Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland.;Univ Tampere, Inst Biosci & Med Technol, Tampere 33520, Finland.
visa fler...
Nordlund, Jessica (författare)
Uppsala Univ, Dept Med Sci, Mol Med & Sci Life Lab, S-75105 Uppsala, Sweden.
Oittinen, Mikko (författare)
Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland.
Teittinen, Kaisa (författare)
Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland.
Gronroos, Toni (författare)
Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland.
St-Onge, Pascal (författare)
Univ Montreal, CHU St Justine Res Ctr, Montreal, PQ H3T 1J4, Canada.
Sinnett, Daniel (författare)
Univ Montreal, CHU St Justine Res Ctr, Montreal, PQ H3T 1J4, Canada.;Univ Montreal, Fac Med, Dept Pediat, Montreal, PQ H3T 1J4, Canada.
Syvänen, Ann-Christine (författare)
Uppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Nykter, Matti (författare)
Univ Tampere, Inst Biosci & Med Technol, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Technol, Dept Signal Proc, Tampere 33720, Finland.
Viiri, Keijo (författare)
Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland.
Heinaniemi, Merja (författare)
Univ Eastern Finland, Inst Biomed, Sch Med, Kuopio 70211, Finland.
Lohi, Olli (författare)
Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland.
visa färre...
Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland. Univ Tampere, Tampere Ctr Child Hlth Res, Tampere 33520, Finland.;Tampere Univ Hosp, Tampere 33520, Finland.;Univ Tampere, Inst Biosci & Med Technol, Tampere 33520, Finland. (creator_code:org_t)
2016-09-12
2016
Engelska.
Ingår i: Genome Research. - : Cold Spring Harbor Laboratory. - 1088-9051 .- 1549-5469. ; 26:11, s. 1468-1477
Relaterad länk:
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
visa fler...
http://genome.cshlp....
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Approximately 20%-25% of childhood acute lymphoblastic leukemias carry the ETV6-RUNX1 (E/R) fusion gene, a fusion of two central hematopoietic transcription factors, ETV6 (TEL) and RUNX1 (AML1). Despite its prevalence, the exact genomic targets of E/R have remained elusive. We evaluated gene loci and enhancers targeted by E/R genome-wide in precursor B acute leukemia cells using global run-on sequencing (GRO-seq). We show that expression of the E/R fusion leads to widespread repression of RUNX1 motif-containing enhancers at its target gene loci. Moreover, multiple super-enhancers from the CD19(+)/CD20(+)-lineage were repressed, implicating a role in impediment of lineage commitment. In effect, the expression of several genes involved in B cell signaling and adhesion was down-regulated, and the repression depended on the wild-type DNA-binding Runt domain of RUNX1. We also identified a number of E/R-regulated annotated and de novo noncoding genes. The results provide a comprehensive genome-wide mapping between E/R-regulated key regulatory elements and genes in precursor B cell leukemia that disrupt normal B lymphopoiesis.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinsk bioteknologi -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Medical Biotechnology -- Medical Biotechnology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy