SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:4e4e1060-af63-4d40-ac78-1dc69f05ee99"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:4e4e1060-af63-4d40-ac78-1dc69f05ee99" > HRDetect is a predi...

HRDetect is a predictor of BRCA1 and BRCA2 deficiency based on mutational signatures

Davies, Helen R. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Glodzik, Dominik (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Morganella, Sandro (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
visa fler...
Yates, Lucy R. (författare)
Guy's and St Thomas' NHS Foundation Trust
Staaf, Johan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Zou, Xueqing (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Ramakrishna, Manasa (författare)
AstraZeneca, UK
Martin, Sancha (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Boyault, Sandrine (författare)
Centre Léon Bérard
Sieuwerts, Anieta M. (författare)
Erasmus University Rotterdam
Simpson, Peter T (författare)
University of Queensland
King, Tari A (författare)
Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
Raine, Keiran (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Eyfjord, Jorunn E. (författare)
University of Iceland
Kong, Gu (författare)
Hanyang University
Borg, Åke (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Familjär bröstcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Familial Breast Cancer,Lund University Research Groups
Birney, Ewan (författare)
European Bioinformatics Institute
Stunnenberg, Hendrik G. (författare)
Radboud University Nijmegen
van de Vijver, Marc J (författare)
Academic Medical Center of University of Amsterdam (AMC)
Børresen-Dale, Anne-Lise (författare)
University of Oslo
Martens, John W. M. (författare)
Erasmus University Rotterdam
Span, Paul N. (författare)
Radboud University Medical Center
Lakhani, Sunil R. (författare)
Royal Brisbane and Women's Hospital
Vincent-Salomon, Anne (författare)
Curie Institute, Paris
Sotiriou, Christos (författare)
Université Libre de Bruxelles (ULB)
Tutt, Andrew (författare)
Institute of Cancer Research London
Thompson, Alastair M (författare)
University of Texas
Van Laere, Steven (författare)
HistoGeneX NV
Richardson, Andrea L. (författare)
Dana-Farber Cancer Institute
Viari, Alain (författare)
Centre Léon Bérard
Campbell, Peter J. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Stratton, Michael R. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Nik-Zainal, Serena (författare)
Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2017-03-13
2017
Engelska 9 s.
Ingår i: Nature Medicine. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1546-170X .- 1078-8956. ; 23:4, s. 517-525
Relaterad länk:
http://dx.doi.org/10...
visa fler...
https://europepmc.or...
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Approximately 1-5% of breast cancers are attributed to inherited mutations in BRCA1 or BRCA2 and are selectively sensitive to poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) inhibitors. In other cancer types, germline and/or somatic mutations in BRCA1 and/or BRCA2 (BRCA1/BRCA2) also confer selective sensitivity to PARP inhibitors. Thus, assays to detect BRCA1/BRCA2-deficient tumors have been sought. Recently, somatic substitution, insertion/deletion and rearrangement patterns, or 'mutational signatures', were associated with BRCA1/BRCA2 dysfunction. Herein we used a lasso logistic regression model to identify six distinguishing mutational signatures predictive of BRCA1/BRCA2 deficiency. A weighted model called HRDetect was developed to accurately detect BRCA1/BRCA2-deficient samples. HRDetect identifies BRCA1/BRCA2-deficient tumors with 98.7% sensitivity (area under the curve (AUC) = 0.98). Application of this model in a cohort of 560 individuals with breast cancer, of whom 22 were known to carry a germline BRCA1 or BRCA2 mutation, allowed us to identify an additional 22 tumors with somatic loss of BRCA1 or BRCA2 and 47 tumors with functional BRCA1/BRCA2 deficiency where no mutation was detected. We validated HRDetect on independent cohorts of breast, ovarian and pancreatic cancers and demonstrated its efficacy in alternative sequencing strategies. Integrating all of the classes of mutational signatures thus reveals a larger proportion of individuals with breast cancer harboring BRCA1/BRCA2 deficiency (up to 22%) than hitherto appreciated (∼1-5%) who could have selective therapeutic sensitivity to PARP inhibition.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy