Sökning: WFRF:(Thuillier Dorothee) >
A Federated Databas...
A Federated Database for Obesity Research : An IMI-SOPHIA Study
-
- Delfin, Carl (författare)
- Novo Nordisk A/S
-
- Dragan, Iulian (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
- Kuznetsov, Dmitry (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
visa fler...
-
- Tajes, Juan Fernandez (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Genetisk och molekylär epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genetic and Molecular Epidemiology,Lund University Research Groups
-
- Smit, Femke (författare)
- Maastricht University
-
- Coral, Daniel E. (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Genetisk och molekylär epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genetic and Molecular Epidemiology,Lund University Research Groups
-
- Farzaneh, Ali (författare)
- Erasmus University Medical Center
-
- Haugg, André (författare)
- Boehringer Ingelheim GmbH
-
- Hungele, Andreas (författare)
- German Center for Diabetes Research
-
- Niknejad, Anne (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
- Hall, Christopher (författare)
- University of Dundee
-
Jacobs, Daan (författare)
-
- Marek, Diana (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
- Fraser, Diane P. (författare)
- University of Exeter
-
Thuillier, Dorothee (författare)
-
- Ahmadizar, Fariba (författare)
- University Medical Center Utrecht
-
- Mehl, Florence (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
Pattou, Francois (författare)
-
- Burdet, Frederic (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
- Hawkes, Gareth (författare)
- University of Exeter
-
- Arts, Ilja C.W. (författare)
- Maastricht University
-
- Blanch, Jordi (författare)
- Catalan Institute Of Health
-
- Van Soest, Johan (författare)
- Maastricht University,Yukioka Hospital
-
- Fernández-Real, José Manuel (författare)
- Girona Biomedical Research Institute (IDIBGI),Hospital Universitari de Girona Dr. Josep Trueta,University of Girona,CIBER de Fisiopatología Obesidad y Nutricion (CIBEROBN)
-
- Boehl, Juergen (författare)
- Boehringer Ingelheim GmbH
-
- Fink, Katharina (författare)
- German Center for Diabetes Research
-
- van Greevenbroek, Marleen M.J. (författare)
- Maastricht University Medical Centre
-
- Kavousi, Maryam (författare)
- Erasmus University Medical Center
-
- Minten, Michiel (författare)
- Maastricht University
-
- Prinz, Nicole (författare)
- German Center for Diabetes Research
-
- Ipsen, Niels (författare)
- Novo Nordisk A/S
-
- Franks, Paul W. (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Genetisk och molekylär epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genetic and Molecular Epidemiology,Lund University Research Groups
-
- Ramos, Rafael (författare)
- University of Girona,Erasmus University Medical Center
-
- Holl, Reinhard W. (författare)
- University of Ulm,German Center for Diabetes Research
-
- Horban, Scott (författare)
- University of Dundee
-
- Duarte-Salles, Talita (författare)
- Erasmus University Medical Center
-
- Tran, Van Du T. (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
Raverdy, Violeta (författare)
-
- Leal, Yenny (författare)
- Hospital Universitari de Girona Dr. Josep Trueta,CIBER de Fisiopatología Obesidad y Nutricion (CIBEROBN),University of Girona,Girona Biomedical Research Institute (IDIBGI)
-
- Lenart, Adam (författare)
- Novo Nordisk A/S
-
- Pearson, Ewan (författare)
- University of Dundee
-
- Sparsø, Thomas (författare)
- Novo Nordisk A/S
-
- Giordano, Giuseppe N. (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Genetisk och molekylär epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genetic and Molecular Epidemiology,Lund University Research Groups
-
- Ioannidis, Vassilios (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
- Soh, Keng (författare)
- Novo Nordisk A/S
-
- Frayling, Timothy M. (författare)
- University of Geneva Medical School,University of Exeter
-
- Le Roux, Carel W. (författare)
- University College Dublin
-
- Ibberson, Mark (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2024
- 2024
- Engelska.
-
Ingår i: Life. - 0024-3019. ; 14:2
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.3...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Obesity is considered by many as a lifestyle choice rather than a chronic progressive disease. The Innovative Medicines Initiative (IMI) SOPHIA (Stratification of Obesity Phenotypes to Optimize Future Obesity Therapy) project is part of a momentum shift aiming to provide better tools for the stratification of people with obesity according to disease risk and treatment response. One of the challenges to achieving these goals is that many clinical cohorts are siloed, limiting the potential of combined data for biomarker discovery. In SOPHIA, we have addressed this challenge by setting up a federated database building on open-source DataSHIELD technology. The database currently federates 16 cohorts that are accessible via a central gateway. The database is multi-modal, including research studies, clinical trials, and routine health data, and is accessed using the R statistical programming environment where statistical and machine learning analyses can be performed at a distance without any disclosure of patient-level data. We demonstrate the use of the database by providing a proof-of-concept analysis, performing a federated linear model of BMI and systolic blood pressure, pooling all data from 16 studies virtually without any analyst seeing individual patient-level data. This analysis provided similar point estimates compared to a meta-analysis of the 16 individual studies. Our approach provides a benchmark for reproducible, safe federated analyses across multiple study types provided by multiple stakeholders.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)
Nyckelord
- bioinformatics
- federated database system
- obesity
- remote statistical analysis
- risk prediction
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
Life
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Delfin, Carl
-
Dragan, Iulian
-
Kuznetsov, Dmitr ...
-
Tajes, Juan Fern ...
-
Smit, Femke
-
Coral, Daniel E.
-
visa fler...
-
Farzaneh, Ali
-
Haugg, André
-
Hungele, Andreas
-
Niknejad, Anne
-
Hall, Christophe ...
-
Jacobs, Daan
-
Marek, Diana
-
Fraser, Diane P.
-
Thuillier, Dorot ...
-
Ahmadizar, Farib ...
-
Mehl, Florence
-
Pattou, Francois
-
Burdet, Frederic
-
Hawkes, Gareth
-
Arts, Ilja C.W.
-
Blanch, Jordi
-
Van Soest, Johan
-
Fernández-Real, ...
-
Boehl, Juergen
-
Fink, Katharina
-
van Greevenbroek ...
-
Kavousi, Maryam
-
Minten, Michiel
-
Prinz, Nicole
-
Ipsen, Niels
-
Franks, Paul W.
-
Ramos, Rafael
-
Holl, Reinhard W ...
-
Horban, Scott
-
Duarte-Salles, T ...
-
Tran, Van Du T.
-
Raverdy, Violeta
-
Leal, Yenny
-
Lenart, Adam
-
Pearson, Ewan
-
Sparsø, Thomas
-
Giordano, Giusep ...
-
Ioannidis, Vassi ...
-
Soh, Keng
-
Frayling, Timoth ...
-
Le Roux, Carel W ...
-
Ibberson, Mark
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Endokrinologi oc ...
- Artiklar i publikationen
-
Life
- Av lärosätet
-
Lunds universitet