SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-248468"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-248468" > GROMACS: High perfo...

GROMACS: High performance molecular simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers

Abraham, Mark James, 1977- (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Teoretisk biologisk fysik
Murtola, Teemu (författare)
Schulz, Roland (författare)
visa fler...
Pall, Szilard (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Teoretisk biologisk fysik
Smith, Jeremy C. (författare)
Hess, Berk (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Teoretisk biologisk fysik
Lindahl, Erik, 1972- (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Teoretisk biologisk fysik
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Elsevier, 2015
2015
Engelska.
Ingår i: SoftwareX. - : Elsevier. - 2352-7110. ; 1-2, s. 19-25
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • GROMACS is one of the most widely used open-source and free software codes in chemistry, used primarily for dynamical simulations of biomolecules. It provides a rich set of calculation types, preparation and analysis tools. Several advanced techniques for free-energy calculations are supported. In version 5, it reaches new performance heights, through several new and enhanced parallelization algorithms. These work on every level; SIMD registers inside cores, multithreading, heterogeneous CPU–GPU acceleration, state-of-the-art 3D domain decomposition, and ensemble-level parallelization through built-in replica exchange and the separate Copernicus framework. The latest best-in-class compressed trajectory storage format is supported.

Ämnesord

NATURAL SCIENCES  -- Physical Sciences (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Fysik (hsv//swe)

Nyckelord

Molecular dynamics
GPU
SIMD
Free energy
Kemi
Chemistry

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • SoftwareX (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy