SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-167651"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-167651" > Motifs of Three HLA...

Motifs of Three HLA-DQ Amino Acid Residues (alpha 44, beta 57, beta 135) Capture Full Association With the Risk of Type 1 Diabetes in DQ2 and DQ8 Children

Zhao, Lue Ping (författare)
Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Papadopoulos, George K. (författare)
Technol Educ Inst Epirus, Greece
Kwok, William W. (författare)
Benaroya Res Inst Virginia Mason, WA USA
visa fler...
Moustakas, Antonis K. (författare)
Ionian Univ, Greece
Bondinas, George P. (författare)
Technol Educ Inst Epirus, Greece
Larsson, Helena Elding (författare)
Lund Univ CRC, Sweden
Ludvigsson, Johnny (författare)
Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus
Marcus, Claude (författare)
Karolinska Inst, Sweden
Samuelsson, Ulf, 1951- (författare)
Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus
Wang, Ruihan (författare)
Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Pyo, Chul-Woo (författare)
Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Nelson, Wyatt C. (författare)
Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Geraghty, Daniel E. (författare)
Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Lernmark, Ake (författare)
Lund Univ CRC, Sweden
visa färre...
 (creator_code:org_t)
AMER DIABETES ASSOC, 2020
2020
Engelska.
Ingår i: Diabetes. - : AMER DIABETES ASSOC. - 0012-1797 .- 1939-327X. ; 69:7, s. 1573-1587
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • HLA-DQA1 and -DQB1 are strongly associated with type 1 diabetes (T1D), and DQ8.1 and DQ2.5 are major risk haplotypes. Next-generation targeted sequencing of HLA-DQA1 and -DQB1 in Swedish newly diagnosed 1- to 18 year-old patients (n= 962) and control subjects (n= 636) was used to construct abbreviated DQ haplotypes, converted into amino acid (AA) residues, and assessed for their associations with T1D. A hierarchically organized haplotype (HOH) association analysis allowed 45 unique DQ haplotypes to be categorized into seven clusters. The DQ8/9 cluster included two DQ8.1 risk and the DQ9 resistant haplotypes, and the DQ2 cluster included the DQ2.5 risk and DQ2.2 resistant haplotypes. Within each cluster, HOH found residues alpha 44Q (odds ratio [OR] 3.29,P= 2.38 * 10(-85)) and beta 57A (OR 3.44,P= 3.80 * 10(-84)) to be associated with T1D in the DQ8/9 cluster representing all ten residues (alpha 22, alpha 23, alpha 44, alpha 49, alpha 51, alpha 53, alpha 54, alpha 73, alpha 184, beta 57) due to complete linkage disequilibrium (LD) of alpha 44 with eight such residues. Within the DQ2 cluster and due to LD, HOH analysis found alpha 44C and beta 135D to share the risk for T1D (OR 2.10,P= 1.96 * 10(-20)). The motif "QAD" of alpha 44, beta 57, and beta 135 captured the T1D risk association of DQ8.1 (OR 3.44,P= 3.80 * 10(-84)), and the corresponding motif "CAD" captured the risk association of DQ2.5 (OR 2.10,P= 1.96 * 10(-20)). Two risk associations were related to GAD65 autoantibody (GADA) and IA-2 autoantibody (IA-2A) but in opposite directions. CAD was positively associated with GADA (OR 1.56,P= 6.35 * 10(-8)) but negatively with IA-2A (OR 0.59,P= 6.55 * 10(-11)). QAD was negatively associated with GADA (OR 0.88;P= 3.70 * 10(-3)) but positively with IA-2A (OR 1.64;P= 2.40 * 10(-14)), despite a single difference at alpha 44. The residues are found in and around anchor pockets 1 and 9, as potential T-cell receptor contacts, in the areas for CD4 binding and putative homodimer formation. The identification of three HLA-DQ AAs (alpha 44, beta 57, beta 135) conferring T1D risk should sharpen functional and translational studies.

Ämnesord

MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Diabetes (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy