Global phylogeography and ancient evolution of the widespread human gut virus crAssphage

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-175024" > Global phylogeograp...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Edwards, Robert A. (författare)

Global phylogeography and ancient evolution of the widespread human gut virus crAssphage

Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2019-07-08
Springer Science and Business Media LLC,2019
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-175024
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-175024URI
https://doi.org/10.1038/s41564-019-0494-6DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Microbiomes are vast communities of microorganisms and viruses that populate all natural ecosystems. Viruses have been considered to be the most variable component of microbiomes, as supported by virome surveys and examples of high genomic mosaicism. However, recent evidence suggests that the human gut virome is remarkably stable compared with that of other environments. Here, we investigate the origin, evolution and epidemiology of crAssphage, a widespread human gut virus. Through a global collaboration, we obtained DNA sequences of crAssphage from more than one-third of the world's countries and showed that the phylogeography of crAssphage is locally clustered within countries, cities and individuals. We also found fully colinear crAssphage-like genomes in both Old-World and New-World primates, suggesting that the association of crAssphage with primates may be millions of years old. Finally, by exploiting a large cohort of more than 1,000 individuals, we tested whether crAssphage is associated with bacterial taxonomic groups of the gut microbiome, diverse human health parameters and a wide range of dietary factors. We identified strong correlations with different clades of bacteria that are related to Bacteroidetes and weak associations with several diet categories, but no significant association with health or disease. We conclude that crAssphage is a benign cosmopolitan virus that may have coevolved with the human lineage and is an integral part of the normal human gut virome.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Vega, Alejandro A. (författare)
Norman, Holly M. (författare)
Ohaeri, Maria (författare)
Levi, Kyle (författare)
Dinsdale, Elizabeth A. (författare)
Cinek, Ondrej (författare)
Aziz, Ramy K. (författare)
McNair, Katelyn (författare)
Barr, Jeremy J. (författare)
Bibby, Kyle (författare)
Brouns, Stan J. J. (författare)
Cazares, Adrian (författare)
de Jonge, Patrick A. (författare)
Desnues, Christelle (författare)
Diaz Munoz, Samuel L. (författare)
Fineran, Peter C. (författare)
Kurilshikov, Alexander (författare)
Lavigne, Rob (författare)
Mazankova, Karla (författare)
McCarthy, David T. (författare)
Nobrega, Franklin L. (författare)
Reyes Munoz, Alejandro (författare)
Tapia, German (författare)
Trefault, Nicole (författare)
Tyakht, Alexander (författare)
Vinuesa, Pablo (författare)
Wagemans, Jeroen (författare)
Zhernakova, Alexandra (författare)
Aarestrup, Frank M. (författare)
Ahmadov, Gunduz (författare)
Alassaf, Abeer (författare)
Anton, Josefa (författare)
Asangba, Abigail (författare)
Billings, Emma K. (författare)
Cantu, Vito Adrian (författare)
Carlton, Jane M. (författare)
Cazares, Daniel (författare)
Cho, Gyu-Sung (författare)
Condeff, Tess (författare)
Cortes, Pilar (författare)
Cranfield, Mike (författare)
Cuevas, Daniel A. (författare)
De la Iglesia, Rodrigo (författare)
Decewicz, Przemyslaw (författare)
Doane, Michael P. (författare)
Dominy, Nathaniel J. (författare)
Dziewit, Lukasz (författare)
Elwasila, Bashir Mukhtar (författare)
Murat Eren, A. (författare)
Franz, Charles (författare)
Fu, Jingyuan (författare)
Garcia-Aljaro, Cristina (författare)
Ghedin, Elodie (författare)
Gulino, Kristen M. (författare)
Haggerty, John M. (författare)
Head, Steven R. (författare)
Hendriksen, Rene S. (författare)
Hill, Colin (författare)
Hyoty, Heikki (författare)
Ilina, Elena N. (författare)
Irwin, Mitchell T. (författare)
Jeffries, Thomas C. (författare)
Jofre, Juan (författare)
Junge, Randall E. (författare)
Kelley, Scott T. (författare)
Mirzaei, Mohammadali Khan (författare)
Kowalewski, Martin (författare)
Kumaresan, Deepak (författare)
Leigh, Steven R. (författare)
Lipson, David (författare)
Lisitsyna, Eugenia S. (författare)
Llagostera, Montserrat (författare)
Maritz, Julia M. (författare)
Marr, Linsey C. (författare)
McCann, Angela (författare)
Molshanski-Mor, Shahar (författare)
Monteiro, Silvia (författare)
Moreira-Grez, Benjamin (författare)
Morris, Megan (författare)
Mugisha, Lawrence (författare)
Muniesa, Maite (författare)
Neve, Horst (författare)
Nam-phuong, Nguyen (författare)
Nigro, Olivia D. (författare)
Nilsson, Anders S.Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut(Swepub:su)annil (författare)
O'Connell, Taylor (författare)
Odeh, Rasha (författare)
Oliver, Andrew (författare)
Piuri, Mariana (författare)
Prussin, Aaron J. (författare)
Qimron, Udi (författare)
Quan, Zhe-Xue (författare)
Rainetova, Petra (författare)
Ramirez-Rojas, Adan (författare)
Raya, Raul (författare)
Reasor, Kim (författare)
Rice, Gillian A. O. (författare)
Rossi, Alessandro (författare)
Santos, Ricardo (författare)
Shimashita, John (författare)
Stachler, Elyse N. (författare)
Stene, Lars C. (författare)
Strain, Ronan (författare)
Stumpf, Rebecca (författare)
Torres, Pedro J. (författare)
Twaddle, Alan (författare)
Ibekwe, MaryAnn Ugochi (författare)
Villagra, Nicolas (författare)
Wandro, Stephen (författare)
White, Bryan (författare)
Whiteley, Andy (författare)
Whiteson, Katrine L. (författare)
Wijmenga, Cisca (författare)
Zambrano, Maria M. (författare)
Zschach, Henrike (författare)
Dutilh, Bas E. (författare)
Stockholms universitetInstitutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature Microbiology: Springer Science and Business Media LLC4:10, s. 1727-17362058-5276

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature Microbiology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Edwards, Robert ...; Vega, Alejandro ...; Norman, Holly M.; Ohaeri, Maria; Levi, Kyle; Dinsdale, Elizab ...; visa fler...; Cinek, Ondrej; Aziz, Ramy K.; McNair, Katelyn; Barr, Jeremy J.; Bibby, Kyle; Brouns, Stan J. ...; Cazares, Adrian; de Jonge, Patric ...; Desnues, Christe ...; Diaz Munoz, Samu ...; Fineran, Peter C ...; Kurilshikov, Ale ...; Lavigne, Rob; Mazankova, Karla; McCarthy, David ...; Nobrega, Frankli ...; Reyes Munoz, Ale ...; Tapia, German; Trefault, Nicole; Tyakht, Alexande ...; Vinuesa, Pablo; Wagemans, Jeroen; Zhernakova, Alex ...; Aarestrup, Frank ...; Ahmadov, Gunduz; Alassaf, Abeer; Anton, Josefa; Asangba, Abigail; Billings, Emma K ...; Cantu, Vito Adri ...; Carlton, Jane M.; Cazares, Daniel; Cho, Gyu-Sung; Condeff, Tess; Cortes, Pilar; Cranfield, Mike; Cuevas, Daniel A ...; De la Iglesia, R ...; Decewicz, Przemy ...; Doane, Michael P ...; Dominy, Nathanie ...; Dziewit, Lukasz; Elwasila, Bashir ...; Murat Eren, A.; Franz, Charles; Fu, Jingyuan; Garcia-Aljaro, C ...; Ghedin, Elodie; Gulino, Kristen ...; Haggerty, John M ...; Head, Steven R.; Hendriksen, Rene ...; Hill, Colin; Hyoty, Heikki; Ilina, Elena N.; Irwin, Mitchell ...; Jeffries, Thomas ...; Jofre, Juan; Junge, Randall E ...; Kelley, Scott T.; Mirzaei, Mohamma ...; Kowalewski, Mart ...; Kumaresan, Deepa ...; Leigh, Steven R.; Lipson, David; Lisitsyna, Eugen ...; Llagostera, Mont ...; Maritz, Julia M.; Marr, Linsey C.; McCann, Angela; Molshanski-Mor, ...; Monteiro, Silvia; Moreira-Grez, Be ...; Morris, Megan; Mugisha, Lawrenc ...; Muniesa, Maite; Neve, Horst; Nam-phuong, Nguy ...; Nigro, Olivia D.; Nilsson, Anders ...; O'Connell, Taylo ...; Odeh, Rasha; Oliver, Andrew; Piuri, Mariana; Prussin, Aaron J ...; Qimron, Udi; Quan, Zhe-Xue; Rainetova, Petra; Ramirez-Rojas, A ...; Raya, Raul; Reasor, Kim; Rice, Gillian A. ...; Rossi, Alessandr ...; Santos, Ricardo; Shimashita, John; Stachler, Elyse ...; Stene, Lars C.; Strain, Ronan; Stumpf, Rebecca; Torres, Pedro J.; Twaddle, Alan; Ibekwe, MaryAnn ...; Villagra, Nicola ...; Wandro, Stephen; White, Bryan; Whiteley, Andy; Whiteson, Katrin ...; Wijmenga, Cisca; Zambrano, Maria ...; Zschach, Henrike; Dutilh, Bas E.; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Mikrobiologi ino ...

Artiklar i publikationen: Nature Microbiol ...

Av lärosätet: Stockholms universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst. Hantera kakor

LIBRIS.kb.se