Single-cell meta-analysis of SARS-CoV-2 entry genes across tissues and demographics

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-192186" > Single-cell meta-an...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Single-cell meta-analysis of SARS-CoV-2 entry genes across tissues and demographics

Muus, Christoph (författare)

Luecken, Malte D. (författare)

Eraslan, Gokcen (författare)

visa fler...

Sikkema, Lisa (författare)

Waghray, Avinash (författare)

Heimberg, Graham (författare)

Kobayashi, Yoshihiko (författare)

Vaishnav, Eeshit Dhaval (författare)

Subramanian, Ayshwarya (författare)

Smillie, Christopher (författare)

Jagadeesh, Karthik A. (författare)

Duong, Elizabeth Thu (författare)

Fiskin, Evgenij (författare)

Triglia, Elena Torlai (författare)

Ansari, Meshal (författare)

Cai, Peiwen (författare)

Lin, Brian (författare)

Buchanan, Justin (författare)

Chen, Sijia (författare)

Shu, Jian (författare)

Larsson, Ludvig (författare): KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab

Chung, Hattie (författare)

Montoro, Daniel T. (författare)

Adams, Taylor (författare)

Aliee, Hananeh (författare)

Allon, Samuel J. (författare)

Andrusivova, Zaneta (författare): KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi

Angelidis, Ilias (författare)

Ashenberg, Orr (författare)

Bassler, Kevin (författare)

Becavin, Christophe (författare)

Benhar, Inbal (författare)

Bergenstråhle, Joseph (författare): KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab

Bergenstråhle, Ludvig (författare): KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab

Bolt, Liam (författare)

Braun, Emelie (författare)

Bui, Linh T. (författare)

Callori, Steven (författare)

Chaffin, Mark (författare)

Chichelnitskiy, Evgeny (författare)

Chiou, Joshua (författare)

Conlon, Thomas M. (författare)

Cuoco, Michael S. (författare)

Cuomo, Anna S. E. (författare)

Deprez, Marie (författare)

Duclos, Grant (författare)

Fine, Denise (författare)

Fischer, David S. (författare)

Ghazanfar, Shila (författare)

Gillich, Astrid (författare)

Giotti, Bruno (författare)

Gould, Joshua (författare)

Guo, Minzhe (författare)

Gutierrez, Austin J. (författare)

Habermann, Arun C. (författare)

Harvey, Tyler (författare)

He, Peng (författare)

Hou, Xiaomeng (författare)

Hu, Lijuan (författare)

Hu, Yan (författare)

Jaiswal, Alok (författare)

Ji, Lu (författare)

Jiang, Peiyong (författare)

Kapellos, Theodoros S. (författare)

Kuo, Christin S. (författare)

Larsson, Ludvig (författare)

Leney-Greene, Michael A. (författare)

Lim, Kyungtae (författare)

Litvinukova, Monika (författare)

Ludwig, Leif S. (författare)

Lukassen, Soeren (författare)

Luo, Wendy (författare)

Maatz, Henrike (författare)

Madissoon, Elo (författare)

Mamanova, Lira (författare)

Manakongtreecheep, Kasidet (författare)

Leroy, Sylvie (författare)

Mayr, Christoph H. (författare)

Mbano, Ian M. (författare)

McAdams, Alexi M. (författare)

Nabhan, Ahmad N. (författare)

Nyquist, Sarah K. (författare)

Penland, Lolita (författare)

Poirion, Olivier B. (författare)

Poli, Sergio (författare)

Qi, CanCan (författare)

Queen, Rachel (författare)

Reichart, Daniel (författare)

Rosas, Ivan (författare)

Schupp, Jonas C. (författare)

Shea, Conor (författare)

Shi, Xingyi (författare)

Sinha, Rahul (författare)

Sit, Rene (författare)

Slowikowski, Kamil (författare)

Slyper, Michal (författare)

Smith, Neal P. (författare)

Sountoulidis, Alex (författare): Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut

Strunz, Maximilian (författare)

Sullivan, Travis B. (författare)

Sun, Dawei (författare)

Talavera-Lopez, Carlos (författare)

Tan, Peng (författare)

Tantivit, Jessica (författare)

Travaglini, Kyle J. (författare)

Tucker, Nathan R. (författare)

Vernon, Katherine A. (författare)

Wadsworth, Marc H. (författare)

Waldman, Julia (författare)

Wang, Xiuting (författare)

Xu, Ke (författare)

Yan, Wenjun (författare)

Zhao, William (författare)

Ziegler, Carly G. K. (författare)

visa färre...

(creator_code:org_t)

2021-03-02
2021
Engelska.
Ingår i: Nature Medicine. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1078-8956 .- 1546-170X. ; 27:3, s. 546-559

Relaterad länk:: https://doi.org/10.1...; visa fler...; https://www.nature.c...; https://urn.kb.se/re...; https://doi.org/10.1...; https://urn.kb.se/re...; http://kipublication...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) and accessory proteases (TMPRSS2 and CTSL) are needed for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) cellular entry, and their expression may shed light on viral tropism and impact across the body. We assessed the cell-type-specific expression of ACE2, TMPRSS2 and CTSL across 107 single-cell RNA-sequencing studies from different tissues. ACE2, TMPRSS2 and CTSL are coexpressed in specific subsets of respiratory epithelial cells in the nasal passages, airways and alveoli, and in cells from other organs associated with coronavirus disease 2019 (COVID-19) transmission or pathology. We performed a meta-analysis of 31 lung single-cell RNA-sequencing studies with 1,320,896 cells from 377 nasal, airway and lung parenchyma samples from 228 individuals. This revealed cell-type-specific associations of age, sex and smoking with expression levels of ACE2, TMPRSS2 and CTSL. Expression of entry factors increased with age and in males, including in airway secretory cells and alveolar type 2 cells. Expression programs shared by ACE2(+)TMPRSS2(+) cells in nasal, lung and gut tissues included genes that may mediate viral entry, key immune functions and epithelial-macrophage cross-talk, such as genes involved in the interleukin-6, interleukin-1, tumor necrosis factor and complement pathways. Cell-type-specific expression patterns may contribute to the pathogenesis of COVID-19, and our work highlights putative molecular pathways for therapeutic intervention. An integrated analysis of over 100 single-cell and single-nucleus transcriptomics studies illustrates severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 viral entry gene coexpression patterns across different human tissues, and shows association of age, smoking status and sex with viral entry gene expression in respiratory cell populations.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Immunologi inom det medicinska området (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Immunology in the medical area (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Infektionsmedicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Infectious Medicine (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Nature Medicine (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Muus, Christoph; Luecken, Malte D ...; Eraslan, Gokcen; Sikkema, Lisa; Waghray, Avinash; Heimberg, Graham; visa fler...; Kobayashi, Yoshi ...; Vaishnav, Eeshit ...; Subramanian, Ays ...; Smillie, Christo ...; Jagadeesh, Karth ...; Duong, Elizabeth ...; Fiskin, Evgenij; Triglia, Elena T ...; Ansari, Meshal; Cai, Peiwen; Lin, Brian; Buchanan, Justin; Chen, Sijia; Shu, Jian; Larsson, Ludvig; Chung, Hattie; Montoro, Daniel ...; Adams, Taylor; Aliee, Hananeh; Allon, Samuel J.; Andrusivova, Zan ...; Angelidis, Ilias; Ashenberg, Orr; Bassler, Kevin; Becavin, Christo ...; Benhar, Inbal; Bergenstråhle, ...; Bergenstråhle, L ...; Bolt, Liam; Braun, Emelie; Bui, Linh T.; Callori, Steven; Chaffin, Mark; Chichelnitskiy, ...; Chiou, Joshua; Conlon, Thomas M ...; Cuoco, Michael S ...; Cuomo, Anna S. E ...; Deprez, Marie; Duclos, Grant; Fine, Denise; Fischer, David S ...; Ghazanfar, Shila; Gillich, Astrid; Giotti, Bruno; Gould, Joshua; Guo, Minzhe; Gutierrez, Austi ...; Habermann, Arun ...; Harvey, Tyler; He, Peng; Hou, Xiaomeng; Hu, Lijuan; Hu, Yan; Jaiswal, Alok; Ji, Lu; Jiang, Peiyong; Kapellos, Theodo ...; Kuo, Christin S.; Leney-Greene, Mi ...; Lim, Kyungtae; Litvinukova, Mon ...; Ludwig, Leif S.; Lukassen, Soeren; Luo, Wendy; Maatz, Henrike; Madissoon, Elo; Mamanova, Lira; Manakongtreechee ...; Leroy, Sylvie; Mayr, Christoph ...; Mbano, Ian M.; McAdams, Alexi M ...; Nabhan, Ahmad N.; Nyquist, Sarah K ...; Penland, Lolita; Poirion, Olivier ...; Poli, Sergio; Qi, CanCan; Queen, Rachel; Reichart, Daniel; Rosas, Ivan; Schupp, Jonas C.; Shea, Conor; Shi, Xingyi; Sinha, Rahul; Sit, Rene; Slowikowski, Kam ...; Slyper, Michal; Smith, Neal P.; Sountoulidis, Al ...; Strunz, Maximili ...; Sullivan, Travis ...; Sun, Dawei; Talavera-Lopez, ...; Tan, Peng; Tantivit, Jessic ...; Travaglini, Kyle ...; Tucker, Nathan R ...; Vernon, Katherin ...; Wadsworth, Marc ...; Waldman, Julia; Wang, Xiuting; Xu, Ke; Yan, Wenjun; Zhao, William; Ziegler, Carly G ...; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Cell och molekyl ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Immunologi inom ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Infektionsmedici ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Artiklar i publikationen: Nature Medicine

Av lärosätet: Stockholms universitet; Kungliga Tekniska Högskolan; Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se