SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-87401"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-87401" > Association analysi...

  • Teerlink, Craig C. (författare)

Association analysis of 9,560 prostate cancer cases from the International Consortium of Prostate Cancer Genetics confirms the role of reported prostate cancer associated SNPs for familial disease

  • Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Springer,2014
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-87401
  • urn:nbn:se:umu:diva-87401urn
  • https://doi.org/10.1007/s00439-013-1384-2DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:128383618URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • gratis
  • Previous GWAS studies have reported significant associations between various common SNPs and prostate cancer risk using cases unselected for family history. How these variants influence risk in familial prostate cancer is not well studied. Here, we analyzed 25 previously reported SNPs across 14 loci from prior prostate cancer GWAS. The International Consortium for Prostate Cancer Genetics (ICPCG) previously validated some of these using a family-based association method (FBAT). However, this approach suffered reduced power due to the conditional statistics implemented in FBAT. Here, we use a case-control design with an empirical analysis strategy to analyze the ICPCG resource for association between these 25 SNPs and familial prostate cancer risk. Fourteen sites contributed 12,506 samples (9,560 prostate cancer cases, 3,368 with aggressive disease, and 2,946 controls from 2,283 pedigrees). We performed association analysis with Genie software which accounts for relationships. We analyzed all familial prostate cancer cases and the subset of aggressive cases. For the familial prostate cancer phenotype, 20 of the 25 SNPs were at least nominally associated with prostate cancer and 16 remained significant after multiple testing correction (p a parts per thousand currency sign 1E (-3)) occurring on chromosomal bands 6q25, 7p15, 8q24, 10q11, 11q13, 17q12, 17q24, and Xp11. For aggressive disease, 16 of the SNPs had at least nominal evidence and 8 were statistically significant including 2p15. The results indicate that the majority of common, low-risk alleles identified in GWAS studies for all prostate cancer also contribute risk for familial prostate cancer, and that some may contribute risk to aggressive disease.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Thibodeau, Stephen N. (författare)
  • McDonnell, Shannon K. (författare)
  • Schaid, Daniel J. (författare)
  • Rinckleb, Antje (författare)
  • Maier, Christiane (författare)
  • Vogel, Walther (författare)
  • Cancel-Tassin, Geraldine (författare)
  • Egrot, Christophe (författare)
  • Cussenot, Olivier (författare)
  • Foulkes, William D. (författare)
  • Giles, Graham G. (författare)
  • Hopper, John L. (författare)
  • Severi, Gianluca (författare)
  • Eeles, Ros (författare)
  • Easton, Douglas (författare)
  • Kote-Jarai, Zsofia (författare)
  • Guy, Michelle (författare)
  • Cooney, Kathleen A. (författare)
  • Ray, Anna M. (författare)
  • Zuhlke, Kimberly A. (författare)
  • Lange, Ethan M. (författare)
  • FitzGerald, Liesel M. (författare)
  • Stanford, Janet L. (författare)
  • Ostrander, Elaine A. (författare)
  • Wiley, Kathleen E. (författare)
  • Isaacs, Sarah D. (författare)
  • Walsh, Patrick C. (författare)
  • Isaacs, William B. (författare)
  • Wahlfors, Tiina (författare)
  • Tammela, Teuvo (författare)
  • Schleutker, Johanna (författare)
  • Wiklund, FredrikDepartment of Medical Epidemiology and Biostatistics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden,University of Umeå ICPCG Group (författare)
  • Grönberg, HenrikDepartment of Medical Epidemiology and Biostatistics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden,University of Umeå ICPCG Group (författare)
  • Emanuelsson, MonicaUmeå universitet,Onkologi,University of Umeå ICPCG Group (författare)
  • Carpten, John (författare)
  • Bailey-Wilson, Joan (författare)
  • Whittemore, Alice S. (författare)
  • Oakley-Girvan, Ingrid (författare)
  • Hsieh, Chih-Lin (författare)
  • Catalona, William J. (författare)
  • Zheng, S. Lilly (författare)
  • Jin, Guangfu (författare)
  • Lu, Lingyi (författare)
  • Xu, Jianfeng (författare)
  • Camp, Nicola J. (författare)
  • Cannon-Albright, Lisa A. (författare)
  • Hsieh, CL (författare)
  • Lange, EM (författare)
  • Camp, NJ (författare)
  • Cannon-Albright, LA (författare)
  • Rinckleb, A (författare)
  • Tammela, T (författare)
  • Whittemore, AS (författare)
  • Gronberg, HKarolinska Institutet (författare)
  • FitzGerald, LM (författare)
  • Schaid, DJ (författare)
  • Eeles, R (författare)
  • McDonnell, SK (författare)
  • Wiley, KE (författare)
  • Cancel-Tassin, G (författare)
  • Jin, GF (författare)
  • Zheng, SL (författare)
  • Thibodeau, SN (författare)
  • Maier, C (författare)
  • Kote-Jarai, Z (författare)
  • Schleutker, J (författare)
  • Egrot, C (författare)
  • Cooney, KA (författare)
  • Xu, JF (författare)
  • Emanuelsson, M (författare)
  • Wahlfors, T (författare)
  • Bailey-Wilson, J (författare)
  • Ray, AM (författare)
  • Isaacs, WB (författare)
  • Easton, D (författare)
  • Zuhlke, KA (författare)
  • Guy, M (författare)
  • Walsh, PC (författare)
  • Foulkes, WD (författare)
  • Severi, G (författare)
  • Oakley-Girvan, I (författare)
  • Catalona, WJ (författare)
  • Teerlink, CC (författare)
  • Carpten, J (författare)
  • Stanford, JL (författare)
  • Wiklund, FKarolinska Institutet (författare)
  • Lu, LY (författare)
  • Cussenot, O (författare)
  • Vogel, W (författare)
  • Hopper, JL (författare)
  • Giles, GG (författare)
  • Isaacs, SD (författare)
  • Ostrander, EA (författare)
  • Department of Medical Epidemiology and Biostatistics, Karolinska Institutet, Stockholm, SwedenUniversity of Umeå ICPCG Group (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Human Genetics: Springer133:3, s. 347-3560340-67171432-1203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Teerlink, Craig ...
Thibodeau, Steph ...
McDonnell, Shann ...
Schaid, Daniel J ...
Rinckleb, Antje
Maier, Christian ...
visa fler...
Vogel, Walther
Cancel-Tassin, G ...
Egrot, Christoph ...
Cussenot, Olivie ...
Foulkes, William ...
Giles, Graham G.
Hopper, John L.
Severi, Gianluca
Eeles, Ros
Easton, Douglas
Kote-Jarai, Zsof ...
Guy, Michelle
Cooney, Kathleen ...
Ray, Anna M.
Zuhlke, Kimberly ...
Lange, Ethan M.
FitzGerald, Lies ...
Stanford, Janet ...
Ostrander, Elain ...
Wiley, Kathleen ...
Isaacs, Sarah D.
Walsh, Patrick C ...
Isaacs, William ...
Wahlfors, Tiina
Tammela, Teuvo
Schleutker, Joha ...
Wiklund, Fredrik
Grönberg, Henrik
Emanuelsson, Mon ...
Carpten, John
Bailey-Wilson, J ...
Whittemore, Alic ...
Oakley-Girvan, I ...
Hsieh, Chih-Lin
Catalona, Willia ...
Zheng, S. Lilly
Jin, Guangfu
Lu, Lingyi
Xu, Jianfeng
Camp, Nicola J.
Cannon-Albright, ...
Hsieh, CL
Lange, EM
Camp, NJ
Cannon-Albright, ...
Rinckleb, A
Tammela, T
Whittemore, AS
Gronberg, H
FitzGerald, LM
Schaid, DJ
Eeles, R
McDonnell, SK
Wiley, KE
Cancel-Tassin, G
Jin, GF
Zheng, SL
Thibodeau, SN
Maier, C
Kote-Jarai, Z
Schleutker, J
Egrot, C
Cooney, KA
Xu, JF
Emanuelsson, M
Wahlfors, T
Bailey-Wilson, J
Ray, AM
Isaacs, WB
Easton, D
Zuhlke, KA
Guy, M
Walsh, PC
Foulkes, WD
Severi, G
Oakley-Girvan, I
Catalona, WJ
Teerlink, CC
Carpten, J
Stanford, JL
Wiklund, F
Lu, LY
Cussenot, O
Vogel, W
Hopper, JL
Giles, GG
Isaacs, SD
Ostrander, EA
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinska och f ...
och Medicinsk geneti ...
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinska och f ...
Artiklar i publikationen
Human Genetics
Av lärosätet
Umeå universitet
Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy