SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-157259"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-157259" > Structural Alterati...

Structural Alterations from Multiple Displacement Amplification of a Human Genome Revealed by Mate-Pair Sequencing

Jiao, Xiang (författare)
Uppsala universitet,Genomik
Rosenlund, Magnus (författare)
Uppsala universitet,Genomik
Hooper, Sean D. (författare)
Uppsala universitet,Genomik
visa fler...
Tellgren-Roth, Christian (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
He, Liqun (författare)
Fu, Yutao (författare)
Mangion, Jonathan (författare)
Sjöblom, Tobias (författare)
Uppsala universitet,Genomik
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2011
2011
Engelska.
Ingår i: PLoS ONE. - 1932-6203 .- 1932-6203. ; 6:7, s. e22250-
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Comprehensive identification of the acquired mutations that cause common cancers will require genomic analyses of large sets of tumor samples. Typically, the tissue material available from tumor specimens is limited, which creates a demand for accurate template amplification. We therefore evaluated whether phi29-mediated whole genome amplification introduces false positive structural mutations by massive mate-pair sequencing of a normal human genome before and after such amplification. Multiple displacement amplification led to a decrease in clone coverage and an increase by two orders of magnitude in the prevalence of inversions, but did not increase the prevalence of translocations. While multiple strand displacement amplification may find uses in translocation analyses, it is likely that alternative amplification strategies need to be developed to meet the demands of cancer genomics.

Nyckelord

MEDICINE
MEDICIN

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • PLoS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy