SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-185642"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-185642" > Genome-Wide Associa...

  • Ramasamy, Adaikalavan (författare)

Genome-Wide Association Studies of Asthma in Population-Based Cohorts Confirm Known and Suggested Loci and Identify an Additional Association near HLA

  • Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2012
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-185642
  • urn:nbn:se:uu:diva-185642urn
  • https://doi.org/10.1371/journal.pone.0044008DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • gratis
  • Rationale: Asthma has substantial morbidity and mortality and a strong genetic component, but identification of genetic risk factors is limited by availability of suitable studies. Objectives: To test if population-based cohorts with self-reported physician-diagnosed asthma and genome-wide association (GWA) data could be used to validate known associations with asthma and identify novel associations. Methods: The APCAT (Analysis in Population-based Cohorts of Asthma Traits) consortium consists of 1,716 individuals with asthma and 16,888 healthy controls from six European-descent population-based cohorts. We examined associations in APCAT of thirteen variants previously reported as genome-wide significant (P < 5x10(-8)) and three variants reported as suggestive (P < 5 x 10(-7)). We also searched for novel associations in APCAT (Stage 1) and followed-up the most promising variants in 4,035 asthmatics and 11,251 healthy controls (Stage 2). Finally, we conducted the first genome-wide screen for interactions with smoking or hay fever. Main Results: We observed association in the same direction for all thirteen previously reported variants and nominally replicated ten of them. One variant that was previously suggestive, rs11071559 in RORA, now reaches genome-wide significance when combined with our data (P = 2.4x10(-9)). We also identified two genome-wide significant associations: rs13408661 near IL1RL1/IL18R1 (PStage1+Stage2 = 1.1x10(-9)), which is correlated with a variant recently shown to be associated with asthma (rs3771180), and rs9268516 in the HLA region (PStage1+Stage2 = 1.1x10(-8)), which appears to be independent of previously reported associations in this locus. Finally, we found no strong evidence for gene-environment interactions with smoking or hay fever status. Conclusions: Population-based cohorts with simple asthma phenotypes represent a valuable and largely untapped resource for genetic studies of asthma.

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Kuokkanen, Mikko (författare)
  • Vedantam, Sailaja (författare)
  • Gajdos, Zofia K. (författare)
  • Alves, Alexessander Couto (författare)
  • Lyon, Helen N. (författare)
  • Ferreira, Manuel A. R. (författare)
  • Strachan, David P. (författare)
  • Zhao, Jing Hua (författare)
  • Abramson, Michael J. (författare)
  • Brown, Matthew A. (författare)
  • Coin, Lachlan (författare)
  • Dharmage, Shyamali C. (författare)
  • Duffy, David L. (författare)
  • Haahtela, Tari (författare)
  • Heath, Andrew C. (författare)
  • Janson, ChristerUppsala universitet,Lungmedicin och allergologi(Swepub:uu)chrisjn (författare)
  • Kahonen, Mika (författare)
  • Khaw, Kay-Tee (författare)
  • Laitinen, Jaana (författare)
  • Le Souef, Peter (författare)
  • Lehtimaki, Terho (författare)
  • Madden, Pamela A. F. (författare)
  • Marks, Guy B. (författare)
  • Martin, Nicholas G. (författare)
  • Matheson, Melanie C. (författare)
  • Palmer, Cameron D. (författare)
  • Palotie, Aarno (författare)
  • Pouta, Anneli (författare)
  • Robertson, Colin F. (författare)
  • Viikari, Jorma (författare)
  • Widen, Elisabeth (författare)
  • Wjst, Matthias (författare)
  • Jarvis, Deborah L. (författare)
  • Montgomery, Grant W. (författare)
  • Thompson, Philip J. (författare)
  • Wareham, Nick (författare)
  • Eriksson, Johan (författare)
  • Jousilahti, Pekka (författare)
  • Laitinen, Tarja (författare)
  • Pekkanen, Juha (författare)
  • Raitakari, Olli T. (författare)
  • O'Connor, George T. (författare)
  • Salomaa, Veikko (författare)
  • Jarvelin, Marjo-Riitta (författare)
  • Hirschhorn, Joel N. (författare)
  • Uppsala universitetLungmedicin och allergologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLoS ONE7:9, s. e44008-1932-62031932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • PLoS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy