SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-321569"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-321569" > Evolution of bird g...

Evolution of bird genomes-a transposon's-eye view

Kapusta, Aurelie (författare)
Univ Utah, Sch Med, Dept Human Genet, Salt Lake City, UT 84132 USA.
Suh, Alexander (författare)
Uppsala universitet,Evolutionsbiologi
Univ Utah, Sch Med, Dept Human Genet, Salt Lake City, UT 84132 USA Evolutionsbiologi (creator_code:org_t)
WILEY, 2017
2017
Engelska.
Ingår i: Annals of the New York Academy of Sciences. - : WILEY. - 0077-8923 .- 1749-6632. ; 1389:1, s. 164-185
  • Forskningsöversikt (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Birds, the most species-rich monophyletic group of land vertebrates, have been subject to some of the most intense sequencing efforts to date, making them an ideal case study for recent developments in genomics research. Here, we review how our understanding of bird genomes has changed with the recent sequencing of more than 75 species from all major avian taxa. We illuminate avian genome evolution from a previously neglected perspective: their repetitive genomic parasites, transposable elements (TEs) and endogenous viral elements (EVEs). We show that (1) birds are unique among vertebrates in terms of their genome organization; (2) information about the diversity of avian TEs and EVEs is changing rapidly; (3) flying birds have smaller genomes yet more TEs than flightless birds; (4) current second-generation genome assemblies fail to capture the variation in avian chromosome number and genome size determined with cytogenetics; (5) the genomic microcosm of bird-TE "arms races" has yet to be explored; and (6) upcoming third-generation genome assemblies suggest that birds exhibit stability in gene-rich regions and instability in TE-rich regions. We emphasize that integration of cytogenetics and single-molecule technologies with repeat-resolved genome assemblies is essential for understanding the evolution of (bird) genomes.

Ämnesord

NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Nyckelord

bird
transposable element
endogenous virus
genome evolution
chromosome
long-read sequencing

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
for (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Kapusta, Aurelie
Suh, Alexander
Om ämnet
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologiska veten ...
och Evolutionsbiolog ...
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
Artiklar i publikationen
Annals of the Ne ...
Av lärosätet
Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy