SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/184704"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/184704" > Monte Carlo feature...

Monte Carlo feature selection and rule-based models to predict Alzheimer's disease in mild cognitive impairment.

Kruczyk, Marcin (författare)
Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
Zetterberg, Henrik, 1973 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry
Hansson, Oskar (författare)
Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Malmö,Medicinska fakulteten,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Department of Clinical Sciences, Malmö,Faculty of Medicine,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups
visa fler...
Rolstad, Sindre, 1976 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry
Minthon, Lennart (författare)
Lund University,Lunds universitet,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups
Wallin, Anders, 1950 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry
Blennow, Kaj, 1958 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry
Komorowski, Jan (författare)
Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
Andersson, Mats Gunnar (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
visa fler...
 
visa färre...
Springer, 2012
2012
Engelska.
Ingår i: Journal of neural transmission (Vienna, Austria : 1996). - : Springer. - 1435-1463 .- 0300-9564. ; 119:7, s. 821-31
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The objective of the present study was to evaluate a Monte Carlo feature selection (MCFS) and rough set Rosetta pipeline for generating rule-based models as a tool for comprehensive risk estimates for future Alzheimer's disease (AD) in individual patients with mild cognitive impairment (MCI). Risk estimates were generated on the basis of age, gender, Mini-Mental State Examination scores, apolipoprotein E (APOE) genotype and the cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers total tau (T-tau), phospho-tau(181) (P-tau) and the 42 amino acid form of amyloid β (Aβ42) in two sets of longitudinally followed MCI patients (n = 217 in total). The predictive model was created in Rosetta, evaluated with the standard tenfold cross-validation approach and tested on an external set. Features were ranked and selected by the MCFS algorithm. Using the combined pipeline of MCFS and Rosetta, it was possible to predict AD among patients with MCI with an area under the receiver operating characteristics curve of 0.92. Risk estimates were produced for the individual patients and showed good correlation with actual diagnosis in cross validation, and on an external dataset from a new study. Analysis of the importance of attributes showed that the biochemical CSF markers contributed the most to the predictions, and that added value was gained by combining several biochemical markers. Despite a correlation with the biochemical markers, the genetic marker APOE ε4 did not contribute to the predictive power of the model.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)
NATURAL SCIENCES  -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (Computational Biology) (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (beräkningsbiologi) (hsv//swe)
NATURVETENSKAP  -- Data- och informationsvetenskap (Datateknik) (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Computer and Information Sciences (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Neurologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Neurology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Nyckelord

Aged
Alzheimer Disease
cerebrospinal fluid
diagnosis
psychology
Amyloid beta-Peptides
cerebrospinal fluid
Disease Progression
Female
Humans
Male
Mild Cognitive Impairment
cerebrospinal fluid
psychology
Monte Carlo Method
Neuropsychological Tests
Peptide Fragments
cerebrospinal fluid
Phosphorylation
Predictive Value of Tests
tau Proteins
cerebrospinal fluid
Alzheimer's disease
Decision support
Monte Carlo feature selection
Rosetta
Rough sets
Biomarkers
Cerebrospinal fluid

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy