SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:e94df8db-3e57-429e-b8a7-ff0f4c84dd14"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:e94df8db-3e57-429e-b8a7-ff0f4c84dd14" > Next Generation HLA...

Next Generation HLA Sequence Analysis Uncovers Seven HLA-DQ Amino Acid Residues and Six Motifs Resistant to Childhood Type 1 Diabetes

Zhao, Lue Ping (författare)
Fred Hutchinson Cancer Research Center,Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Papadopoulos, George K (författare)
Technological Educational Institute of Epirus
Kwok, William W (författare)
Benaroya Research Institute
visa fler...
Moustakas, Antonis K (författare)
Ionian University
Bondinas, George P (författare)
Technological Educational Institute of Epirus
Carlsson, Annelie (författare)
Lund University,Lunds universitet,Pediatrisk celiaki/diabetes,Forskargrupper vid Lunds universitet,PediatricCeliaki/Diabetes,Lund University Research Groups,Lund Univ, Sweden
Larsson, Helena Elding (författare)
Lund University,Lunds universitet,Pediatrisk endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Paediatric Endocrinology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
Ludvigsson, Johnny (författare)
Linköpings universitet,Linköping University,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus
Marcus, Claude (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Inst, Sweden
Samuelsson, Ulf (författare)
Linköpings universitet,Linköping University,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus
Wang, Ruihan (författare)
Fred Hutchinson Cancer Research Center,Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Pyo, Chul-Woo (författare)
Fred Hutchinson Cancer Research Center,Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Nelson, Wyatt C (författare)
Fred Hutchinson Cancer Research Center
Geraghty, Daniel E (författare)
Fred Hutchinson Cancer Research Center
Lernmark, Åke (författare)
Lund University,Lunds universitet,Diabetes och celiaki,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes and Celiac Unit,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
Bondinas, George P. (författare)
Technol Educ Inst Epirus, Greece
Lernmark, Ake (författare)
Lund Univ, Sweden
Nelson, Wyatt C. (författare)
Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Elding Larsson, Helena (författare)
Lund Univ, Sweden
Geraghty, Daniel E. (författare)
Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
Papadopoulos, George K. (författare)
Technol Educ Inst Epirus, Greece
Moustakas, Antonis K. (författare)
Ionian Univ, Greece
Kwok, William W. (författare)
Benaroya Res Inst Virginia Mason, WA USA
Papadopoulos, GK (författare)
Moustakas, AK (författare)
Larsson, HE (författare)
Zhao, LP (författare)
Geraghty, DE (författare)
Ludvigsson, J (författare)
Marcus, C (författare)
Karolinska Institutet
Carlsson, A (författare)
Nelson, WC (författare)
Wang, RH (författare)
Bondinas, GP (författare)
Samuelsson, U (författare)
Kwok, WW (författare)
Lernmark, A (författare)
Pyo, CW (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Arlington, VA, United States : American Diabetes Association Inc. 2020
2020
Engelska.
Ingår i: Diabetes. - Arlington, VA, United States : American Diabetes Association Inc.. - 1939-327X .- 0012-1797. ; 69:11, s. 2523-2535
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • HLA-DQA1 and -DQB1 genes have significant and potentially causal associations with autoimmune type 1 diabetes (T1D). To follow on the earlier analysis on high-risk HLA-DQ2.5 and DQ8.1, the current analysis uncovers seven residues (αa1, α157, α196, β9, β30, β57, β70) that are resistant to T1D among subjects with DQ4, 5, 6 and 7 resistant DQ haplotypes. These seven residues form 13 common motifs; six motifs are significantly resistant, six motifs have modest or no associations (p-values>0.05), and one motif has 7 copies observed among controls only. The motif "DAAFYDG", "DAAYHDG" and "DAAYYDR" have significant resistance to T1D (OR = 0.03, 0.25 and 0.18, p-value = 6.11*10-24, 3.54*10-15 and 1.03*10-21, respectively). Remarkably, a change of a single residue from the motif "DAAYH D G" to "DAAYH S G" (D to S at β57) alters the resistance potential, from resistant motif (OR = 0.15, p-value = 3.54*10-15) to a neutral motif (p-value = 0.183), the change of which was significant (Fisher's p-value = 0.0065). The extended set of linked residues associated with T1D resistance and unique to each cluster of HLA-DQ haplotypes represents facets of all known features and functions of these molecules: antigenic peptide binding, pMHCII complex stability, β167-169 RGD loop, TCR binding, formation of homodimer of alpha-beta heterodimers, and cholesterol binding in the cell membrane rafts. Identifications of these residues is a novel understanding of resistant DQ associations with T1D. Our analyses endow potential molecular approaches to identify immunological mechanisms that control disease susceptibility or resistance to provide novel targets for immunotherapeutic strategies.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Diabetes (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy