SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:f935f60b-9c89-4c9b-aefb-689523eabc54"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:f935f60b-9c89-4c9b-aefb-689523eabc54" > Partially methylate...

Partially methylated domains are hypervariable in breast cancer and fuel widespread CpG island hypermethylation

Brinkman, Arie B. (författare)
Radboud University Nijmegen
Nik-Zainal, Serena (författare)
University of Cambridge,Wellcome Trust Sanger Institute
Simmer, Femke (författare)
Radboud University Nijmegen
visa fler...
Rodríguez-González, F. Germán (författare)
Erasmus University Medical Center
Smid, Marcel (författare)
Erasmus University Medical Center
Alexandrov, Ludmil B. (författare)
Los Alamos National Laboratory,Wellcome Trust Sanger Institute
Butler, Adam (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Martin, Sancha (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Davies, Helen (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Glodzik, Dominik (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Zou, Xueqing (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Ramakrishna, Manasa (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Staaf, Johan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Ringnér, Markus (författare)
Lund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science
Sieuwerts, Anieta (författare)
Erasmus University Medical Center
Ferrari, Anthony (författare)
Centre Léon Bérard
Morganella, Sandro (författare)
Wellcome Trust
Fleischer, Thomas (författare)
Norwegian Radium Hospital
Kristensen, Vessela (författare)
Norwegian Radium Hospital,University of Oslo,Akershus University Hospital
Gut, Marta (författare)
University of Barcelona
van de Vijver, Marc J. (författare)
Academic Medical Center of University of Amsterdam (AMC)
Børresen-Dale, Anne Lise (författare)
Norwegian Radium Hospital,University of Oslo
Richardson, Andrea L. (författare)
Dana-Farber Cancer Institute,Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School
Thomas, Gilles (författare)
Centre Léon Bérard
Gut, Ivo G. (författare)
University of Barcelona
Martens, John W.M. (författare)
Erasmus University Medical Center
Foekens, John A. (författare)
Erasmus University Medical Center
Stratton, Michael R. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Stunnenberg, Hendrik G. (författare)
Radboud University Nijmegen
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Nature Publishing Group, 2019
2019
Engelska.
Ingår i: Nature Communications. - : Nature Publishing Group. - 2041-1723. ; 10:1
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Global loss of DNA methylation and CpG island (CGI) hypermethylation are key epigenomic aberrations in cancer. Global loss manifests itself in partially methylated domains (PMDs) which extend up to megabases. However, the distribution of PMDs within and between tumor types, and their effects on key functional genomic elements including CGIs are poorly defined. We comprehensively show that loss of methylation in PMDs occurs in a large fraction of the genome and represents the prime source of DNA methylation variation. PMDs are hypervariable in methylation level, size and distribution, and display elevated mutation rates. They impose intermediate DNA methylation levels incognizant of functional genomic elements including CGIs, underpinning a CGI methylator phenotype (CIMP). Repression effects on tumor suppressor genes are negligible as they are generally excluded from PMDs. The genomic distribution of PMDs reports tissue-of-origin and may represent tissue-specific silent regions which tolerate instability at the epigenetic, transcriptomic and genetic level.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy