Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning


Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:fd7bfa85-293c-4ca2-a928-5a0d6628e5ec" > White matter hyperi...

White matter hyperintensity quantification in large-scale clinical acute ischemic stroke cohorts – The MRI-GENIE study

Schirmer, Markus D. (författare)
Massachusetts Institute of Technology,Massachusetts General Hospital,German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE), Bonn
Dalca, Adrian V. (författare)
Massachusetts Institute of Technology,Massachusetts General Hospital
Sridharan, Ramesh (författare)
Massachusetts Institute of Technology
visa fler...
Giese, Anne Katrin (författare)
Broad Institute,Massachusetts General Hospital
Donahue, Kathleen L. (författare)
Massachusetts General Hospital
Nardin, Marco J. (författare)
Massachusetts General Hospital
Mocking, Steven J.T. (författare)
Massachusetts General Hospital
McIntosh, Elissa C. (författare)
Massachusetts General Hospital
Frid, Petrea (författare)
Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Wasselius, Johan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Diagnostisk radiologi, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Neuroradiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diagnostic Radiology, (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Neuroradiology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
Cole, John W. (författare)
Veterans Health Administration
Holmegaard, Lukas (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi,Institute of Neuroscience and Physiology,Sahlgrenska Academy
Jern, Christina (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Institutionen för biomedicin,Institute of Biomedicine
Jimenez-Conde, Jordi (författare)
Autonomous University of Barcelona
Lemmens, Robin (författare)
University Hospitals Leuven,Catholic University of Leuven
Lindgren, Arne G. (författare)
Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Klinisk strokeforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Clinical Stroke Research Group,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
Meschia, James F. (författare)
Mayo Clinic Florida
Roquer, Jaume (författare)
Autonomous University of Barcelona
Rundek, Tatjana (författare)
University of Miami
Sacco, Ralph L. (författare)
University of Miami
Schmidt, Reinhold (författare)
Medical University of Graz
Sharma, Pankaj (författare)
Royal Holloway University of London
Slowik, Agnieszka (författare)
Jagellonian University
Thijs, Vincent (författare)
Woo, Daniel (författare)
University of Cincinnati College of Medicine
Vagal, Achala (författare)
University of Cincinnati College of Medicine
Xu, Huichun (författare)
University of Maryland School of Medicine
Kittner, Steven J. (författare)
Veterans Health Administration
McArdle, Patrick F. (författare)
University of Maryland School of Medicine
Mitchell, Braxton D. (författare)
University of Maryland School of Medicine
Rosand, Jonathan (författare)
Massachusetts General Hospital
Worrall, Bradford B. (författare)
University of Virginia
Wu, Ona (författare)
Massachusetts General Hospital
Golland, Polina (författare)
Massachusetts Institute of Technology
Rost, Natalia S. (författare)
Massachusetts General Hospital
Lemmens, R. (författare)
Schirmer, M. D. (författare)
Mitchell, B. D. (författare)
Jimenez-Conde, J. (författare)
McIntosh, E. C. (författare)
Vagal, A. (författare)
Wu, O. (författare)
Slowik, A. (författare)
Xu, H. C. (författare)
Donahue, K. L. (författare)
Sacco, R. L. (författare)
Lindgren, A. G. (författare)
Worrall, B. B. (författare)
Wasselius, J. (författare)
Dalca, A. V. (författare)
Woo, D. (författare)
Frid, P. (författare)
McArdle, P. F. (författare)
Sharma, P. (författare)
Cole, J. W. (författare)
Kittner, S. J. (författare)
Meschia, J. F. (författare)
Golland, P. (författare)
Giese, A. K. (författare)
Mocking, S. J. T. (författare)
Nardin, M. J. (författare)
Roquer, J. (författare)
Rosand, J. (författare)
Rost, N. S. (författare)
Thijs, V. (författare)
Rundek, T. (författare)
Schmidt, R. (författare)
Sridharan, R. (författare)
visa färre...
visa fler...
visa färre...
Elsevier, 2019
Ingår i: NeuroImage: Clinical. - : Elsevier. - 2213-1582. ; 23
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
  • White matter hyperintensity (WMH) burden is a critically important cerebrovascular phenotype linked to prediction of diagnosis and prognosis of diseases, such as acute ischemic stroke (AIS). However, current approaches to its quantification on clinical MRI often rely on time intensive manual delineation of the disease on T2 fluid attenuated inverse recovery (FLAIR), which hinders high-throughput analyses such as genetic discovery. In this work, we present a fully automated pipeline for quantification of WMH in clinical large-scale studies of AIS. The pipeline incorporates automated brain extraction, intensity normalization and WMH segmentation using spatial priors. We first propose a brain extraction algorithm based on a fully convolutional deep learning architecture, specifically designed for clinical FLAIR images. We demonstrate that our method for brain extraction outperforms two commonly used and publicly available methods on clinical quality images in a set of 144 subject scans across 12 acquisition centers, based on dice coefficient (median 0.95; inter-quartile range 0.94–0.95; p < 0.01) and Pearson correlation of total brain volume (r = 0.90). Subsequently, we apply it to the large-scale clinical multi-site MRI-GENIE study (N = 2783) and identify a decrease in total brain volume of −2.4 cc/year. Additionally, we show that the resulting total brain volumes can successfully be used for quality control of image preprocessing. Finally, we obtain WMH volumes by building on an existing automatic WMH segmentation algorithm that delineates and distinguishes between different cerebrovascular pathologies. The learning method mimics expert knowledge of the spatial distribution of the WMH burden using a convolutional auto-encoder. This enables successful computation of WMH volumes of 2533 clinical AIS patients. We utilize these results to demonstrate the increase of WMH burden with age (0.950 cc/year) and show that single site estimates can be biased by the number of subjects recruited.


TEKNIK OCH TEKNOLOGIER  -- Medicinteknik -- Medicinsk bildbehandling (hsv//swe)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY  -- Medical Engineering -- Medical Image Processing (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Radiologi och bildbehandling (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Radiology, Nuclear Medicine and Medical Imaging (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Neurologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Neurology (hsv//eng)
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER  -- Medicinteknik (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY  -- Medical Engineering (hsv//eng)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)


Neurosciences & Neurology

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Schirmer, Markus ...
Dalca, Adrian V.
Sridharan, Rames ...
Giese, Anne Katr ...
Donahue, Kathlee ...
Nardin, Marco J.
visa fler...
Mocking, Steven ...
McIntosh, Elissa ...
Frid, Petrea
Wasselius, Johan
Cole, John W.
Holmegaard, Luka ...
Jern, Christina
Jimenez-Conde, J ...
Lemmens, Robin
Lindgren, Arne G ...
Meschia, James F ...
Roquer, Jaume
Rundek, Tatjana
Sacco, Ralph L.
Schmidt, Reinhol ...
Sharma, Pankaj
Slowik, Agnieszk ...
Thijs, Vincent
Woo, Daniel
Vagal, Achala
Xu, Huichun
Kittner, Steven ...
McArdle, Patrick ...
Mitchell, Braxto ...
Rosand, Jonathan
Worrall, Bradfor ...
Wu, Ona
Golland, Polina
Rost, Natalia S.
Lemmens, R.
Schirmer, M. D.
Mitchell, B. D.
Jimenez-Conde, J ...
McIntosh, E. C.
Vagal, A.
Wu, O.
Slowik, A.
Xu, H. C.
Donahue, K. L.
Sacco, R. L.
Lindgren, A. G.
Worrall, B. B.
Wasselius, J.
Dalca, A. V.
Woo, D.
Frid, P.
McArdle, P. F.
Sharma, P.
Cole, J. W.
Kittner, S. J.
Meschia, J. F.
Golland, P.
Giese, A. K.
Mocking, S. J. T ...
Nardin, M. J.
Roquer, J.
Rosand, J.
Rost, N. S.
Thijs, V.
Rundek, T.
Schmidt, R.
Sridharan, R.
visa färre...
Om ämnet
och Medicinteknik
och Medicinsk bildbe ...
och Klinisk medicin
och Radiologi och bi ...
och Klinisk medicin
och Neurologi
och Medicinteknik
och Klinisk medicin
och Medicinska och f ...
Artiklar i publikationen
NeuroImage: Clin ...
Av lärosätet
Lunds universitet
Göteborgs universitet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy