| 1. |
- Ahrné, Karin, et al.
(författare)
-
Tillstånd och trender för arter och deras livsmiljöer – rödlistade arter i Sverige 2015
- 2015
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- 2015 års upplaga av den svenska rödlistan är den fjärde i ordningen. Den är baserad på IUCN:s rödlistningskriterier och revideras vart femte år. I rödlistan bedöms risken som enskilda arter av djur, växter och svampar löper att försvinna från Sverige. Bedömningen utförs av ArtDatabankens medarbetare i samverkan med över 100 externa experter, indelade i 14 expertkommittéer för olika organismgrupper. Under arbetet med 2015 års rödlista har tillstånd och trender bedömts för 21 600 arter och 1 318 lägre taxa (apomiktiska arter, underarter och varieteter), sammanlagt ca 22 900 taxa. Av de bedömda arterna klassificerades 2 029 som hotade (kategorierna CR, EN och VU) och 4 273 som rödlistade (inkluderar även kategorierna NT, RE och DD). Förhållandet mellan antalet rödlistade och antalet bedömda arter ar 19,8 %, vilket är ungefär samma värde som 2010 och 2005. I denna rapport jämförs antalet och andelen rödlistade arter mellan olika organismgrupper, biotoper, substrat och påverkansfaktorer. Texten ar indelad i en allmän del och åtta kapitel inriktade på olika landskapstyper. Landskapstyperna utgör en grov indelning av landets miljöer enligt följande kategorier: Skog, Jordbrukslandskap, Urbana miljöer, Fjäll, Våtmarker, Sötvatten, Havsstränder och Havsmiljöer. Skogen och jordbrukslandskapet är de artrikaste landskapstyperna med 1 800 respektive 1 400 arter som har en stark anknytning dit, och ytterligare flera hundra arter som förekommer där mer sporadiskt. De faktorer som påverkar flest rödlistade arter i Sverige är skogsavverkning och igenväxning, som båda utgör ett hot mot vardera ca 30 % av de rödlistade arterna. Avverkning minskar arealen av skog där naturliga strukturer och naturlig dynamik upprätthålls, och den orsakar därmed förlust av livsmiljöer. Igenväxning orsakas av ett antal faktorer, bland annat upphörande hävd (bete och slåtter), gödsling, trädplantering och brist på naturliga störningsregimer som t.ex. regelbundna översvämningar kring vattendrag och sjöar. Andra viktiga påverkansfaktorer är fiske, torrläggning av våtmarker, tillbakagång hos värdarter (främst alm och ask som drabbats av invasiva svampsjukdomar), klimatförändringar och konkurrens från invasiva arter. IUCN:s rödlisteindex beräknas för ett urval av de bedömda organismgrupperna. Rödlisteindex visar att skillnaderna mellan rödlistorna från 2000, 2005, 2010 och 2015 är små. Ett par undantag finns dock. Groddjur och stora däggdjur har fått en något förbättrad situation sedan 2000. Totalt förefaller det ändå som att trycket mot Sveriges artstock har förblivit relativt konstant under de senaste 15 åren.
|
|
| 2. |
- Burgess, S., et al.
(författare)
-
Bayesian methods for meta-analysis of causal relationships estimated using genetic instrumental variables
- 2010
-
Ingår i: Statistics in medicine. - : Wiley. - 1097-0258 .- 0277-6715. ; 29:12, s. 1298-311
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Genetic markers can be used as instrumental variables, in an analogous way to randomization in a clinical trial, to estimate the causal relationship between a phenotype and an outcome variable. Our purpose is to extend the existing methods for such Mendelian randomization studies to the context of multiple genetic markers measured in multiple studies, based on the analysis of individual participant data. First, for a single genetic marker in one study, we show that the usual ratio of coefficients approach can be reformulated as a regression with heterogeneous error in the explanatory variable. This can be implemented using a Bayesian approach, which is next extended to include multiple genetic markers. We then propose a hierarchical model for undertaking a meta-analysis of multiple studies, in which it is not necessary that the same genetic markers are measured in each study. This provides an overall estimate of the causal relationship between the phenotype and the outcome, and an assessment of its heterogeneity across studies. As an example, we estimate the causal relationship of blood concentrations of C-reactive protein on fibrinogen levels using data from 11 studies. These methods provide a flexible framework for efficient estimation of causal relationships derived from multiple studies. Issues discussed include weak instrument bias, analysis of binary outcome data such as disease risk, missing genetic data, and the use of haplotypes.
|
|
| 3. |
- Agnidakis, Paul, 1974-
(författare)
-
Rätten till platsen : Tillhörighet och samhörighet i två lokala industrisamhällen under omvandling
- 2013
-
Doktorsavhandling (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- This thesis is based on the demise of industry that has led to a search for new solutions for the survival of smaller communities traditionally dependent on industrial production. In two local industrial communities in central and northern Sweden, Surahammar and Timrå, industrial dependency has gradually been replaced by a dependency on immigration, largely from the neighboring cities of Västerås and Sundsvall. In the changed order of these local communities, old and new inhabitants have had to negotiate positions in order to co-exist. The objective of the thesis is to present how old and new inhabitants relate to and are attached to the local community as a place in which they reside and live their lives. In focus is an interest in the local identity construction of the inhabitants, i.e. how they identify with the place in which they dwell and live their everyday lives, with and in reference to each other and the outside world. Another concern relates to just how different local options for identification can be for individuals and for collective groups of people.Adopting a phenomenological and constructivist perspective, I regard local place as something that both old and new inhabitants are shaped by and shape in a collective process based on contrasts. The analysis is based on empirical data gathered during several years of fieldwork in the studied communities. The empirical data mainly consists of interviews and participant observations with old and new inhabitants in Surahammar and Timrå. Moreover, biographical literature, newspaper articles and data retrieved from the Internet have contributed important insights into how the local place is experienced and valued among the different groups of inhabitants. The thesis recognises the values and symbols that old and new inhabitants agree upon and that often result in spatial attachments. In addition, ideological, social and cultural differences are depicted as factors that shape a place as old and new inhabitants articulate local attachment and identification based on different grounds, needs and dreams.
|
|
| 4. |
- Aronsson, Mora, et al.
(författare)
-
Sveriges arter och naturtyper i EU:s art- och habitatdirektiv : Resultat från rapportering 2019 till EU av bevarandestatus 2013-2018
- 2020
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Sverige har en variationsrik natur med storslagen fjällmiljö, myllrande våtmarker, vattendrag och sjöar, kust och hav, skogar och odlingslandskap, alla med ett rikt växt och djurliv. Den här fantastiska biologiska mångfalden tas ofta för given och ibland som en lyx, men oavsett vilket är det en förutsättning för vår överlevnad.2019 rapporterade Sverige statusen till EU för perioden 2013–2018 för de naturtyper och arter i Sverige som är listade i art- och habitatdirektivet. Den berättar att 20 procent av naturtyperna och 40 procent av arterna mår bra. Den biologiska mångfalden är hårt trängd i såväl Sverige som i andra EU-länder.Den här rapporten sammanfattar Sveriges rapportering och innehåller beskrivningar av status för naturtyper och arter, påverkan, hot och trender. Rapporten ger kunskap om tillståndet för den biologiska mångfalden i Sverige med hjälp av de arter och naturtyper som är listade i EU:s art- och habitatdirektiv.Rapporten visar hur naturmiljöerna i Sverige förändas, och sammanfattar den senaste kunskapen om vilka faktorer som driver dessa förändringar. Även exempel på hur vi genom restaurerings- och skötselåtgärder kan hejda förlusten av biologisk mångfald tas upp.
|
|
| 5. |
- Barredo, José I., et al.
(författare)
-
Mapping and assessment of forest ecosystems and their services : Applications and guidance for decision making in the framework of MAES
- 2015
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- The aim of this report is to illustrate by means of a series of case studies the implementation of mapping and assessment of forest ecosystem services in different contexts and geographical levels. Methodological aspects, data issues, approaches, limitations, gaps and further steps for improvement are analysed for providing good practices and decision making guidance. The EU initiative on Mappingand Assessment of Ecosystems and their Services (MAES), with the support of all Member States, contributes to improve the knowledge on ecosystem services. MAES is one of the building-block initiatives supporting the EU Biodiversity Strategy to 2020.
|
|
| 6. |
|
|
| 7. |
- Berglund, Björn, et al.
(författare)
-
Clonal spread of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae among patients at admission and discharge at a Vietnamese neonatal intensive care unit
- 2021
-
Ingår i: Antimicrobial Resistance and Infection Control. - : BMC. - 2047-2994. ; 10:1
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background The increasing prevalence of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) is a growing problem globally, particularly in low- to middle-income countries (LMICs). Previous studies have shown high rates of CRE colonisation among patients at hospitals in LMICs, with increased risk of hospital-acquired infections. Methods We isolated carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) from faecal samples collected in 2017 from patients at admission and discharge at a Vietnamese neonatal intensive care unit (NICU). 126 CRKP were whole-genome sequenced. The phylogenetic relationship between the isolates and between clinical CRKP isolates collected in 2012-2018 at the same hospital were investigated. Results NDM-type carbapenemase-(61%) and KPC-2-encoding genes (41%) were the most common carbapenem resistance genes observed among the admission and discharge isolates. Most isolates (56%) belonged to three distinct clonal clusters of ST15, carrying bla(KPC-2), bla(NDM-1) and bla(NDM-4), respectively. Each cluster also comprised clinical isolates from blood collected at the study hospital. The most dominant ST15 clone was shown to be related to isolates collected from the same hospital as far back as in 2012. Conclusions Highly resistant CRKP were found colonising admission and discharge patients at a Vietnamese NICU, emphasising the importance of continued monitoring. Whole-genome sequencing revealed a population of CRKP consisting mostly of ST15 isolates in three clonally related clusters, each related to blood isolates collected from the same hospital. Furthermore, clinical isolates collected from previous years (dating back to 2012) were shown to likely be clonally descended from ST15 isolates in the largest cluster, suggesting a successful hospital strain which can colonise inpatients.
|
|
| 8. |
|
|
| 9. |
- Berglund, Björn, et al.
(författare)
-
Insertion sequence transpositions and point mutations in mgrB causing colistin resistance in a clinical strain of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae from Vietnam
- 2018
-
Ingår i: International Journal of Antimicrobial Agents. - : ELSEVIER SCIENCE BV. - 0924-8579 .- 1872-7913. ; 51:5, s. 789-793
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Resistance among Klebsiella pneumoniae to the last-resort antibiotics carbapenems and colistin is increasing worldwide. In this study, whole-genome sequencing was used to determine the colistin resistance mechanisms in clinical isolates of carbapenem-and colistin-resistant K. pneumoniae from Vietnam. Alterations in the regulatory gene mgrB, via mutations and insertion sequence transpositions, were found in 30 of 31 isolates, emphasising the importance of this resistance mechanism in colistin-resistant K. pneumoniae. (c) 2017 Elsevier B.V. and International Society of Chemotherapy. All rights reserved.
|
|
| 10. |
|
|
