SwePub
Sök i SwePub databas

  Utökad sökning

Träfflista för sökning "WFRF:(Domzal Kacper) "

Sökning: WFRF:(Domzal Kacper)

  • Resultat 1-1 av 1
Sortera/gruppera träfflistan
   
NumreringReferensOmslagsbildHitta
1.
  • Geras, Agnieszka, et al. (författare)
  • Celloscope : a probabilistic model for marker-gene-driven cell type deconvolution in spatial transcriptomics data
  • 2023
  • Ingår i: Genome Biology. - : Springer Nature. - 1465-6906 .- 1474-760X. ; 24:1
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Spatial transcriptomics maps gene expression across tissues, posing the challenge of determining the spatial arrangement of different cell types. However, spatial transcriptomics spots contain multiple cells. Therefore, the observed signal comes from mixtures of cells of different types. Here, we propose an innovative probabilistic model, Celloscope, that utilizes established prior knowledge on marker genes for cell type deconvolution from spatial transcriptomics data. Celloscope outperforms other methods on simulated data, successfully indicates known brain structures and spatially distinguishes between inhibitory and excitatory neuron types based in mouse brain tissue, and dissects large heterogeneity of immune infiltrate composition in prostate gland tissue.
  •  
Skapa referenser, mejla, bekava och länka
  • Resultat 1-1 av 1

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy