| 1. |
- Fadista, Joao, et al.
(författare)
-
Global genomic and transcriptomic analysis of human pancreatic islets reveals novel genes influencing glucose metabolism.
- 2014
-
Ingår i: Proceedings of the National Academy of Sciences. - : Proceedings of the National Academy of Sciences. - 1091-6490 .- 0027-8424. ; 111:38, s. 13924-13929
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Genetic variation can modulate gene expression, and thereby phenotypic variation and susceptibility to complex diseases such as type 2 diabetes (T2D). Here we harnessed the potential of DNA and RNA sequencing in human pancreatic islets from 89 deceased donors to identify genes of potential importance in the pathogenesis of T2D. We present a catalog of genetic variants regulating gene expression (eQTL) and exon use (sQTL), including many long noncoding RNAs, which are enriched in known T2D-associated loci. Of 35 eQTL genes, whose expression differed between normoglycemic and hyperglycemic individuals, siRNA of tetraspanin 33 (TSPAN33), 5'-nucleotidase, ecto (NT5E), transmembrane emp24 protein transport domain containing 6 (TMED6), and p21 protein activated kinase 7 (PAK7) in INS1 cells resulted in reduced glucose-stimulated insulin secretion. In addition, we provide a genome-wide catalog of allelic expression imbalance, which is also enriched in known T2D-associated loci. Notably, allelic imbalance in paternally expressed gene 3 (PEG3) was associated with its promoter methylation and T2D status. Finally, RNA editing events were less common in islets than previously suggested in other tissues. Taken together, this study provides new insights into the complexity of gene regulation in human pancreatic islets and better understanding of how genetic variation can influence glucose metabolism.
|
|
| 2. |
- Sunesson, Sune, et al.
(författare)
-
Inledning : Om utvärderingens ideal och realiteter
- 1990
-
Ingår i: Den värderande blicken : Om utvärdering i socialt arbete - Om utvärdering i socialt arbete. - 9144315716 ; , s. 5-22
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 3. |
- Ahrné, Karin, et al.
(författare)
-
Rödlista över fjärilar Lepidoptera
- 2015
-
Ingår i: Rödlistade arter i Sverige 2015. - Uppsala : ArtDatabanken SLU. - 9789187853104 ; , s. 98-112
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 4. |
|
|
| 5. |
- Andersson, Sofia A, et al.
(författare)
-
Reduced insulin secretion correlates with decreased expression of exocytotic genes in pancreatic islets from patients with type 2 diabetes.
- 2012
-
Ingår i: Molecular and Cellular Endocrinology. - : Elsevier BV. - 1872-8057 .- 0303-7207. ; 364:1-2, s. 36-45
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Reduced insulin release has been linked to defect exocytosis in β-cells. However, whether expression of genes suggested to be involved in the exocytotic process (exocytotic genes) is altered in pancreatic islets from patients with type 2 diabetes (T2D), and correlate to insulin secretion, needs to be further investigated. Analysing expression levels of 23 exocytotic genes using microarray revealed reduced expression of five genes in human T2D islets (χ(2)=13.25; p<0.001). Gene expression of STX1A, SYT4, SYT7, SYT11, SYT13, SNAP25 and STXBP1 correlated negatively to in vivo measurements of HbA1c levels and positively to glucose stimulated insulin secretion (GSIS) in vitro in human islets. STX1A, SYT4 and SYT11 protein levels correspondingly decreased in human T2D islets. Moreover, silencing of SYT4 and SYT13 reduced GSIS in INS1-832/13 cells. Our data support that reduced expression of exocytotic genes contributes to impaired insulin secretion, and suggest decreased expression of these genes as part of T2D pathogenesis.
|
|
| 6. |
- Barghouth, Mohammad, et al.
(författare)
-
The structure of insulin granule core determines secretory capacity being reduced in type-2 diabetes
- 2022
-
Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Exocytosis in excitable cells is essential for their physiological functions. Although the exocytotic machinery controlling cellular secretion has been well investigated, the function of the vesicular cargo, i.e. secretory granular content remains obscure. Here we combine dSTORM imaging and single-domain insulin antibody, to dissect the in situ structure of insulin granule cores (IGCs) at nano level. We demonstrate that the size and shape of the IGCs can be regulated by the juxta-granular molecules Nucleobindin-2 and Enolase-1, that further contribute to the stimulated insulin secretion. IGCs located at the plasma membrane are larger than those in the cytosol. The IGCs size is decreased by ∼20% after glucose stimulation due to the release of the peripheral part of IGCs through incomplete granule fusion. Importantly, the reduction of the IGCs size is also observed in non-stimulatory pancreatic β-cells from diabetic db/db mice, Akita (Ins2+/-) mice and human Type-2 diabetic donors, in accordance with impaired secretion. These findings overall highlight the structure of exocytotic insulin cores as a novel modality amenable to targeting in the stimulated exocytosis in β-cells with impaired insulin secretion.Competing Interest StatementThe authors have declared no competing interest.
|
|
| 7. |
- Bengtsson, Bengt Å., et al.
(författare)
-
Fjärilar
- 2010. - 1
-
Ingår i: Rödlistade arter i Sverige 2010. - Uppsala : Artdatabanken i samarbete med Naturvårdsverket. - 9789188506351 ; , s. 361-392
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 8. |
- Dayeh, Tasnim, et al.
(författare)
-
Genome-wide DNA methylation analysis of human pancreatic islets from type 2 diabetic and non-diabetic donors identifies candidate genes that influence insulin secretion.
- 2014
-
Ingår i: PLoS Genetics. - : Public Library of Science (PLoS). - 1553-7404. ; 10:3
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Impaired insulin secretion is a hallmark of type 2 diabetes (T2D). Epigenetics may affect disease susceptibility. To describe the human methylome in pancreatic islets and determine the epigenetic basis of T2D, we analyzed DNA methylation of 479,927 CpG sites and the transcriptome in pancreatic islets from T2D and non-diabetic donors. We provide a detailed map of the global DNA methylation pattern in human islets, β- and α-cells. Genomic regions close to the transcription start site showed low degrees of methylation and regions further away from the transcription start site such as the gene body, 3'UTR and intergenic regions showed a higher degree of methylation. While CpG islands were hypomethylated, the surrounding 2 kb shores showed an intermediate degree of methylation, whereas regions further away (shelves and open sea) were hypermethylated in human islets, β- and α-cells. We identified 1,649 CpG sites and 853 genes, including TCF7L2, FTO and KCNQ1, with differential DNA methylation in T2D islets after correction for multiple testing. The majority of the differentially methylated CpG sites had an intermediate degree of methylation and were underrepresented in CpG islands (∼7%) and overrepresented in the open sea (∼60%). 102 of the differentially methylated genes, including CDKN1A, PDE7B, SEPT9 and EXOC3L2, were differentially expressed in T2D islets. Methylation of CDKN1A and PDE7B promoters in vitro suppressed their transcriptional activity. Functional analyses demonstrated that identified candidate genes affect pancreatic β- and α-cells as Exoc3l silencing reduced exocytosis and overexpression of Cdkn1a, Pde7b and Sept9 perturbed insulin and glucagon secretion in clonal β- and α-cells, respectively. Together, our data can serve as a reference methylome in human islets. We provide new target genes with altered DNA methylation and expression in human T2D islets that contribute to perturbed insulin and glucagon secretion. These results highlight the importance of epigenetics in the pathogenesis of T2D.
|
|
| 9. |
|
|
| 10. |
- ELIASSON, CLAES U
(författare)
-
Inventering och övervakning av väddnätfjäril (Euphydryas aurinia) på Gotland 2004
- 2005
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Tre år av kontinuerligt intensivt bete av väddnätfjärilens främsta förekomstyta i Kallgate-området har förändrat miljön avsevärt. Lyckligtvis har somrarna 2003 och 2004 varit torra och den kraftiga markerosion som iakttogs redan efter en första betessäsong har därför inte förvärrats i väntad utsträckning. Däremot kan en mycket tydlig förändring i väddnätfjärilens val av reproduktionsytor nu ses. Inom det södra beteshägnet (ca 215 ha) som har två mindre skyddshägn (vardera ca 3 ha) mot bete har andelen larvkolonier inom skyddshägnen av samtliga i det stora hägnet ökat från 51 % under 2002 till 92 % under 2004. Detta beror bl.a. på att ängsväddplantan reagerar på bete genom att producera mindre blad som ligger tätt mot markunderlaget så att fjärilshonan inte kan utnyttja bladen för äggläggning. Helt säkert förstör också nötboskapen larvernas spånader då de betar, vilket är ödesdigert då larverna är millimeterlånga.Sammantaget har populationen ökat sedan 2002, vilket var väntat med hänsyn till detta års omfattande översvämning. Den kraftiga koncentrationen av fjärilar till skyddshägnen visar att populationen kunde ha varit ännu större idag utan detta bete. Den största ökningen av populationen har skett på Bälsalvret som inte omfattas av bete. Ändå är miljön här endast fläckvis gynnsam för fjärilens reproduktion trots att värdväxten finns i stor mängd. Detta beror på att tuvbildningen är för dålig och att honorna undviker att lägga ägg på ängsvädd som växer på plan mark. Väddnätfjärilen finns fortfarande kvar på Martebomyr och på en blekvät i Vänge men antalet fjärilar här är endast något tiotal. Rapporten lämnar utförlig redovisning av och förklaring till populationens förändringar i olika delar av metapopula-tionen inom Kallgateområdet. Vidare lämnas förslag till inskränkningar i beteshävden, vilka bör kunna realiseras nu då nästan hela populationen omfattas av ett Natura 2000-område.
|
|
