| 1. |
- Bång, Magnus, et al.
(författare)
-
Automatisk trafikövervakning genom AI i svenska farvatten : Slutrapport AutoMon Del I
- 2023
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Denna slutrapport redogör för resultatet av projektet: AutoMon Del I—Automatisk trafikövervakning genom AI i svenska farvatten (TRV2019/95873). Projektägare är Linköpings universitet och genomförts tillsammans med Sjöfartsverket, SAAB, VTI, och Luftfartsverket. Vi kommer i denna rapport redogöra för resultaten samt diskutera framtida utmaningar med konceptet AutoMon. Syftet med AutoMon är att undersöka och belysa problemområdet automatiserad trafikövervakning genom att implementera en AI-demonstrator för svenska farvatten, initialt med fokus på att detektera anomalier i trafiken, och där hanteringen (dvs. granskning och lösning) av problemsituationer lämnas över till en mänsklig operatör. Förekomsten av fartygsolyckor och -incidenter, med potentiellt stora konsekvenser för individ och miljö - utanför etablerade VTS-områden - visar på behovet av utökad övervakning av sjötrafiken i svenska farvatten för att möjliggöra proaktiva åtgärder för att minimera olycksrisker till sjöss. Forskningsprojektet undersöker hur en hög nivå av automation kan användas för att upptäcka och hantera trafikavvikelser på svenskt vatten samt ge möjlighet till s.k. situational awareness (lägesbild) över hela dess yta, samtidigt som stöd för centralt eller distribuerat beslutsfattande ges. Runt om i världen förekommer även manipulation av AIS-systemet och dess positionsangivelser; ett problem som sannolikt kommer att öka även i Sverige. Båda problemställningarna är globala, vilket ger hög relevans. Lösningar har högt värde där digitalisering och artificiell intelligens kan användas som medel för ökad sjösäkerhet (safety och cyber security).
|
|
| 2. |
- Gremel, Gabriela, et al.
(författare)
-
A systematic search strategy identifies cubilin as independent prognostic marker for renal cell carcinoma
- 2017
-
Ingår i: BMC Cancer. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1471-2407. ; 17
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background: There is an unmet clinical need for better prognostic and diagnostic tools for renal cell carcinoma (RCC). Methods: Human Protein Atlas data resources, including the transcriptomes and proteomes of normal and malignant human tissues, were searched for RCC-specific proteins and cubilin (CUBN) identified as a candidate. Patient tissue representing various cancer types was constructed into a tissue microarray (n = 940) and immunohistochemistry used to investigate the specificity of CUBN expression in RCC as compared to other cancers. Two independent RCC cohorts (n = 181; n = 114) were analyzed to further establish the sensitivity of CUBN as RCC-specific marker and to explore if the fraction of RCCs lacking CUBN expression could predict differences in patient survival. Results: CUBN was identified as highly RCC-specific protein with 58% of all primary RCCs staining positive for CUBN using immunohistochemistry. In venous tumor thrombi and metastatic lesions, the frequency of CUBN expression was increasingly lost. Clear cell RCC (ccRCC) patients with CUBN positive tumors had a significantly better prognosis compared to patients with CUBN negative tumors, independent of T-stage, Fuhrman grade and nodal status (HR 0.382, CI 0.203-0.719, P = 0.003). Conclusions: CUBN expression is highly specific to RCC and loss of the protein is significantly and independently associated with poor prognosis. CUBN expression in ccRCC provides a promising positive prognostic indicator for patients with ccRCC. The high specificity of CUBN expression in RCC also suggests a role as a new diagnostic marker in clinical cancer differential diagnostics to confirm or rule out RCC.
|
|
| 3. |
|
|
| 4. |
|
|
| 5. |
- Henriksson, Eva, et al.
(författare)
-
Homeodomain leucine zipper class I genes in Arabidopsis. Expression patterns and phylogenetic relationships
- 2005
-
Ingår i: Plant Physiology. - : American Society of Plant Biologists. - 0032-0889 .- 1532-2548. ; 139:1, s. 509-518
-
Tidskriftsartikel (populärvet., debatt m.m.)abstract
- Members of the homeodomain leucine zipper (HDZip) family of transcription factors are present in a wide range of plants, from mosses to higher plants, but not in other eukaryotes. The HDZip genes act in developmental processes, including vascular tissue and trichome development, and several of them have been suggested to be involved in the mediation of external signals to regulate plant growth. The Arabidopsis ( Arabidopsis thaliana) genome contains 47 HDZip genes, which, based on sequence criteria, have been grouped into four different classes: HDZip I to IV. In this article, we present an overview of the class I HDZip genes in Arabidopsis. We describe their expression patterns, transcriptional regulation properties, duplication history, and phylogeny. The phylogeny of HDZip class I genes is supported by data on the duplication history of the genes, as well as the intron/exon patterning of the HDZip-encoding motifs. The HDZip class I genes were found to be widely expressed and partly to have overlapping expression patterns at the organ level. Further, abscisic acid or water deficit treatments and different light conditions affected the transcript levels of a majority of the HDZip I genes. Within the gene family, our data show examples of closely related HDZip genes with similarities in the function of the gene product, but a divergence in expression pattern. In addition, six HDZip class I proteins tested were found to be activators of gene expression. In conclusion, several HDZip I genes appear to regulate similar cellular processes, although in different organs or tissues and in response to different environmental signals.
|
|
| 6. |
- Magnusson, Patrik K. E., et al.
(författare)
-
The Swedish Twin Registry : establishment of a biobank and other recent developments
- 2013
-
Ingår i: Twin Research and Human Genetics. - Cambridge, United Kingdom : Cambridge University Press. - 1832-4274 .- 1839-2628. ; 16:1, s. 317-329
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The Swedish Twin Registry (STR) today contains more than 194,000 twins and more than 75,000 pairs have zygosity determined by an intra-pair similarity algorithm, DNA, or by being of opposite sex. Of these, approximately 20,000, 25,000, and 30,000 pairs are monozygotic, same-sex dizygotic, and opposite-sex dizygotic pairs, respectively. Since its establishment in the late 1950s, the STR has been an important epidemiological resource for the study of genetic and environmental influences on a multitude of traits, behaviors, and diseases. Following large investments in the collection of biological specimens in the past 10 years we have now established a Swedish twin biobank with DNA from 45,000 twins and blood serum from 15,000 twins, which effectively has also transformed the registry into a powerful resource for molecular studies. We here describe the main projects within which the new collections of both biological samples as well as phenotypic measures have been collected. Coverage by year of birth, zygosity determination, ethnic heterogeneity, and influences of in vitro fertilization are also described.
|
|
| 7. |
- Agalou, Adamantia, et al.
(författare)
-
A genome-wide survey of HD-Zip genes in rice and analysis of drought-responsive family members
- 2008
-
Ingår i: Plant Molecular Biology. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0167-4412 .- 1573-5028. ; 66:1-2, s. 87-103
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The homeodomain leucine zipper (HD-Zip) genes encode transcription factors that have diverse functions in plant development and have often been implicated in stress adaptation. The HD-Zip genes are the most abundant group of homeobox (HB) genes in plants and do not occur in other eukaryotes. This paper describes the complete annotation of the HD-Zip families I, II and III from rice and compares these gene families with Arabidopsis in a phylogeny reconstruction. Orthologous pairs of rice and Arabidopsis HD-Zip genes were predicted based on neighbour joining and maximum parsimony (MP) trees with support of conserved intron-exon organization. Additionally, a number of HD-Zip genes appeared to be unique to rice. Searching of EST and cDNA databases and expression analysis using RT-PCR showed that 30 out of 31 predicted rice HD-Zip genes are expressed. Most HD-Zip genes were broadly expressed in mature plants and seedlings, but others showed more organ specific patterns. Like in Arabidopsis and other dicots, a subset of the rice HD-Zip I and II genes was found to be regulated by drought stress. We identified both drought-induced and drought-repressed HD-Zip genes and demonstrate that these genes are differentially regulated in drought-sensitive versus drought-tolerant rice cultivars. The drought-repressed HD-Zip family I gene, Oshox4, was selected for promoter-GUS analysis, showing that drought-responsiveness of Oshox4 is controlled by the promoter and that Oshox4 expression is predominantly vascular-specific. Loss-of-function analysis of Oshox4 revealed no specific phenotype, but overexpression analysis suggested a role for Oshox4 in elongation and maturation processes.
|
|
| 8. |
- Alklind Taylor, Anna-Sofia, et al.
(författare)
-
Acceptance of Entertainment Systems in Stroke Rehabilitation
- 2009
-
Ingår i: Proceedings of IADIS Game and Entertainment Technologies 2009 (GET 2009). - : IADIS Press. - 9789728924850 ; , s. 75-83
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- Game-based tools for rehabilitation of different types of physical and cognitive impairments are becoming more and more popular. By introducing an element of fun, these systems aim at increasing patients' motivation to train and, from a further perspective, improve recovery rates. There is, however, a question whether such tools will be fully accepted by the intended target group. Earlier work on user acceptance has mainly focused on utility systems, i.e. systems used mainly in the work place. However, people use systems for different reasons and that makes it difficult to apply the same principles on systems with the main purpose to entertain. Serious games have characteristics from both utility and entertainment systems, which makes it interesting to study the acceptance of these kinds of systems. In this study, we have developed a home-based entertainment system for stroke rehabilitation, with focus on rehabilitation of motor impairments. By analysing the gaming behaviour and interview responses of five stroke patients, we investigate factors influencing user acceptance of this specific type of system. The results show that current models of acceptance are not sufficient to fully explain acceptance of serious games in general and serious games for rehabilitation in particular. Besides well-known factors, such as perceived usefulness, perceived ease-of-use and perceived enjoyment, other, more specific, factors also play a vital role in the acceptance of the system.
|
|
| 9. |
- Alklind Taylor, Anna-Sofia, et al.
(författare)
-
Gamers against All Odds
- 2009
-
Ingår i: Learning by playing: game-based education system design and development. - Berlin, Heidelberg : Springer Berlin/Heidelberg. - 9783642033636 - 9783642033643 ; , s. 1-12
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- The goal of the project presented in this paper is to enable motor rehabilitation to stroke patients in their home environment and to utilise game enjoyment to achieve frequent training. Stroke patients have an average age above 70 years, which implies that they typically do not belong to a gaming generation. In addition, these patients suffer from motor, and many times cognitive impairments, which make traditional games extremely difficult to use. Nearly all work in this area has been conducted in a clinic environment where it is possible to overcome some of these difficulties by letting professionals assist and guide patients.In this paper, we present the challenges faced, the system itself and the result from a study where five patients were equipped with a game console in their homes for five weeks. The focus of this paper is on analysing the gaming behaviour of patients, which includes the amount of time they spent, the type of games they selected and their comments on the gaming experience. The conclusion from this analysis is that their behaviour resembles that of gamers. They spent significant voluntary time, and it has been possible for patients, with no prior experience of computer games, to enjoy gaming in their homes where they had no professional assistance.
|
|
| 10. |
- Alklind Taylor, Anna-Sofia, et al.
(författare)
-
Spelbaserad simulering för insatsutbildning : Slutrapport
- 2012
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Denna rapport är en avrapportering av projektet Spelbaserad simulering för insatsutbildning. Projektet syftar till att:Studera hur serious games kan förstärka lärandemiljön i träning och utbildningPraktiskt testa och analysera användningen av spelteknologi för att ta fram rekommendationer för konstruktion av träningssimulatorerSkapa underlag för utveckling av Räddningsverkets utbildningsmetoder genom samarbete mellan forskare och praktikerSerious games och spelbaserad simulatorträning ses som en möjlighet att vidareutveckla undervisnings- och träningsmiljön inom räddningstjänst. Begreppet serious games definieras som att använda spel och spelteknik för att uppnå syften utöver ren underhållning. För att utnyttja områdets potential i största möjliga mån krävs en kombination av att utveckla och anpassa teknik så att den passar för ändamålet, detta kan till exempel innebära att utnyttja de möjligheter som modern spelteknik ger för att logga användarbeteende och resultat. Dessutom innefattar serious games en komponent av speldesign, det vill säga att utnyttja möjligheter som spel ger för att skapa en motiverande och engagerande lärandemiljö. Detta kan till exempel innebära att skapa tävlingsmoment och poängsystem som sporrar till upprepad användning. I projektet har vi utnyttjat såväl teknik- som speldesignskomponenten.Projektets syften har uppnåtts genom att producera och utvärdera ett prototypspel för insatsträning samt en modell för hur serious games kan användas i träning och utbildning. De huvudsakliga resultaten består av en spelprototyp av ett webbaserat spel för att träna beslutsfattande på taktisk nivå samt en pedagogisk modell för spelbaserad träning. Prototypen och modellen har testats på en distanskurs för Räddningsledarutbildning i regi av Myndigheten för samhällsskydd och beredskap (MSB). Utvärderingen visar på goda resultat vad gäller systemets användbarhet. Den pedagogiska potentialen har inte kunnat utvärderas fullt ut då prototypen inte blev en tillräckligt integrerad del i kursen där den utvärderades.Projektet visar att spelbaserad träning kan vara en möjlighet för pedagogisk utveckling med avseende på både teknik och pedagogisk kontext. I detta sammanhang är det viktigt att poängtera vikten av att genomföra och utvärdera pedagogiska anpassningar i samband med spelbaserad träning. Vidare har projektet har samarbetat med olika konstellationer av lärare och kursdeltagare vid MSB. En viktig lärdom är att tydliga resurser och organisatoriskt engagemang finns på plats i den här typen av samproducerande forskningsprojekt.
|
|
