| 1. |
- Abdellah, Tebani, et al.
(författare)
-
Annotation of pituitary neuroendocrine tumors with genome-wide expression analysis
- 2021
-
Ingår i: Acta neuropathologica communications. - : BioMed Central (BMC). - 2051-5960. ; 9:1
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Pituitary neuroendocrine tumors (PitNETs) are common, generally benign tumors with complex clinical characteristics related to hormone hypersecretion and/or growing sellar tumor mass. PitNETs can be classified based on the expression pattern of anterior pituitary hormones and three main transcriptions factors (TF), SF1, PIT1 and TPIT that regulate differentiation of adenohypophysial cells. Here, we have extended this classification based on the global transcriptomics landscape using tumor tissue from a well-defined cohort comprising 51 PitNETs of different clinical and histological types. The molecular profiles were compared with current classification schemes based on immunohistochemistry. Our results identified three main clusters of PitNETs that were aligned with the main pituitary TFs expression patterns. Our analyses enabled further identification of specific genes and expression patterns, including both known and unknown genes, that could distinguish the three different classes of PitNETs. We conclude that the current classification of PitNETs based on the expression of SF1, PIT1 and TPIT reflects three distinct subtypes of PitNETs with different underlying biology and partly independent from the expression of corresponding hormones. The transcriptomic analysis reveals several potentially targetable tumor-driving genes with previously unknown role in pituitary tumorigenesis.
|
|
| 2. |
- Ahlin, Åsa, 1970-
(författare)
-
Compulsory Schooling in a Decentralized Setting: Studies of the Swedish Case
- 2004
-
Doktorsavhandling (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Essay 1 (with Eva Johansson) investigates the demand for local public schooling using survey data, a method previously never applied to Sweden. Estimating a demand specification corresponding to that in U.S. studies, more elastic demand than in the U.S. is found. In an alternative specification, a more inelastic demand is indicated, in line with earlier findings on demand for total local spending in Sweden. Support for the hypothesis that municipal employees tend to have higher preferences for local public school spending than other employees is found. The differences in elasticities are, however, not statistically significant.Essay 2 investigates school competition and its implications for student performance. Using a value added specification, increased local school competition is shown to have positive effects on average performance in mathematics, but no significant effects in English or Swedish test performance. Immigrant pupils and those in need of special education tend to gain more from increased school competition, while adverse effects on students from low education families are found in terms of English and Swedish performance. Quantile regressions indicate homogeneous effects on low and high performing students.Essay 3 (with Eva Mörk) investigates the extent to which grants, local tax base, preferences and structural characteristics affected local school resources in connection with the decentralization of compulsory schooling in Sweden, using municipal panel data covering 1989-1995. The main arguments against decentralization are not supported by our findings. First, school spending as well as teacher density is found to be more equally distributed across municipalities following decentralization. Second, local tax capacity is not found to influence local school resources more in the decentralized than in the centralized regime. Furthermore, targeted grants have a significant impact on resources while general grants have not.Essay 4 examines teacher mobility in Sweden. Particular attention is paid to the role of working conditions. Various school attributes are used to proxy for teachers’ working conditions, including the average student performance, school resources and student composition. The results indicate a link, in the expected direction, between school attributes and the probability that a teacher will leave her teaching position in favour of another school. Also, teachers with higher wages tend to have a lower propensity of leaving their school. In contrast to previous US findings, the estimated impact of wages are not sensitive to whether or not controls for school attributes are included.
|
|
| 3. |
- Andersson, Linda, 1973, et al.
(författare)
-
Glucosylceramide synthase deficiency in the heart compromises β1-adrenergic receptor trafficking
- 2021
-
Ingår i: European Heart Journal. - : Oxford University Press. - 0195-668X .- 1522-9645. ; 42:43, s. 4481-4492
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- AIMS: Cardiac injury and remodelling are associated with the rearrangement of cardiac lipids. Glycosphingolipids are membrane lipids that are important for cellular structure and function, and cardiac dysfunction is a characteristic of rare monogenic diseases with defects in glycosphingolipid synthesis and turnover. However, it is not known how cardiac glycosphingolipids regulate cellular processes in the heart. The aim of this study is to determine the role of cardiac glycosphingolipids in heart function.METHODS AND RESULTS: Using human myocardial biopsies, we showed that the glycosphingolipids glucosylceramide and lactosylceramide are present at very low levels in non-ischaemic human heart with normal function and are elevated during remodelling. Similar results were observed in mouse models of cardiac remodelling. We also generated mice with cardiomyocyte-specific deficiency in Ugcg, the gene encoding glucosylceramide synthase (hUgcg-/- mice). In 9- to 10-week-old hUgcg-/- mice, contractile capacity in response to dobutamine stress was reduced. Older hUgcg-/- mice developed severe heart failure and left ventricular dilatation even under baseline conditions and died prematurely. Using RNA-seq and cell culture models, we showed defective endolysosomal retrograde trafficking and autophagy in Ugcg-deficient cardiomyocytes. We also showed that responsiveness to β-adrenergic stimulation was reduced in cardiomyocytes from hUgcg-/- mice and that Ugcg knockdown suppressed the internalization and trafficking of β1-adrenergic receptors.CONCLUSIONS: Our findings suggest that cardiac glycosphingolipids are required to maintain β-adrenergic signalling and contractile capacity in cardiomyocytes and to preserve normal heart function.
|
|
| 4. |
- Carlson, Åsa, et al.
(författare)
-
New Materialism
- 2019
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- Today, it is rather common that feminist researchers position themselves as new materialists within the theory of science instead of as social constructivists or poststructuralists. Since we believe that this change happened without very much discussion, we encourage debate on the topic, in order to get a deeper understanding of new materialism and how it relates to these other positions. Our point of departure is the view of Karen Barad as presented in Meeting the Universe Half-Way. In a reaction against (oversimplified) post-structuralism, Barad attempts to reintroduce the significance and causality of matter into scientific explanations without ending up as an empiricist. Like social constructivist and poststructuralists she thinks that knowledge always depends on the subject of knowledge, situated in her social and historical context. In addition, Barad thinks that everything we observe are phenomena that depend on perceptive and technical apparati, that is, tools for investigating nature including ourselves. Since we are nature, or the ‘object’ of enquiry, strictly speaking we have no causal relation to the ‘object’. This is so because relata (that which the causal relation is a relation of) have to be two distinct entities, but the subject of knowledge is not distinct from the object of knowledge. Barad underscores this by writing that we intra-act (as opposed to interact) with nature. Because of this, she concludes that phenomena are everything that exists. This conclusion and some other entailments have not been thoroughly scrutinized.
|
|
| 5. |
- Faithfull, Carolyn
(författare)
-
Ekosystemtjänstanalyser som stöd för en regional ekosystembaserad havsförvaltning : Erfarenheter från tre pilotområden: 8-fjordar, Stockholms skärgård och Södra Bottenhavet
- 2024
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Kartläggning och analys av ekosystemtjänster är viktiga verktyg för att synliggöra människans relation till och beroende av ekosystemet. De kan till exempel påvisa samband mellan processer i ekosystemet och samhället, och användas som underlag för att diskutera avvägningar mellan olika mål och intressen. I ekosystembaserad havsförvaltning kan diskussioner om ekosystemtjänster öka aktörers förståelse för ekosystemet som grund för vårt nyttjande av havet. De kan också stödja åtgärdsarbete och strategisk planering. Här presenterar vi analyser av ekosystemtjänster som tagits fram som underlag för en regional ekosystembaserad havsförvaltning i Södra Bottenhavet, Stockholms skärgård och området 8+fjordar i Bohuslän. Vi har dels använt två olika metoder för att kartlägga utbredningen av ekosystemtjänster och associerade nyttigheter i pilotområden - en naturbaserad metod som utgår från utbredningen av ekosystemkomponenter och en öppen GIS-metod för att samla in lokal kunskap om ekosystemtjänster från intressenter och allmänhet.Den naturbaserade kartläggningen gjordes för Södra Bottenhavet och Stockholms skärgård. Studien hade som mål att utveckla och testa en metod för att kartlägga kustnära ekosystemtjänster utifrån kartor av arter och livsmiljöer och utvärdera hur metoden kan användas för ekosystembaserad planering. Vi har gjort en bedömning av vilka ekosystemtjänster som är relevanta att kartlägga med metoden i dessa områden och vilka arter och livsmiljöer som främst kan förväntas bidra till dessa tjänster. För att lätt kunna dela resultaten har vi utvecklat en app som tillåter en användare att ta fram potentiella ekosystemtjänstkartor utifrån kartor över arter och livsmiljöer. Som nästa steg behöver appen utvärderas tillsammans med användare, för att testa användbarhet och vidare utvecklingsbehov.Öppen-GIS-analysen gjordes inom projektet 8+fjordar, där intressenter och allmänhet bjöds in till workshops för att beskriva sin syn på områdets värden och vad som påverkar miljön i området. De resulterande GIS-lagren ger en bild av hur användare av det lokala ekosystemet uppfattar sin närmiljö och vilka ekosystemtjänster de värdesätter och nyttjar. En initial utvärdering visar att resultaten kan användas till exempel för att identifiera platser där det finns konflikter mellan olika användningar av havet och peka ut behov av åtgärder för att lösa dessa konflikter. Processen att ta fram underlagen bidrog dessutom till ett gemensamt lärande inom projektet.Den tredje metoden som vi har använt är en enkät- och intervjustudie för att undersöka markägares attityder och preferenser i samband med åtgärdsarbete i Stockholms skärgård. Den här studien fokuserade på vilka ekosystemtjänster och nyttigheter markägare värdesätter i naturtypen grunda havsvikar. Resultatet kompletterar kunskapen om människans förhållande till denna naturtyp och lägger en viktig grund för att inkludera sociala mål och indikatorer i arbetet för att skydda och restaurera grunda havsvikar.Ekosystemtjänster är fortfarande ett abstrakt begrepp för många och rapporten syftar till att genom exempel synliggöra hur ekosystemtjänster kan användas för att stödja en långsiktigt hållbar förvaltning av kustområden. Att ta hänsyn till det komplexa samspelet mellan människa och natur är en central del av ekosystembaserad förvaltning. Våra tre exempel fyller delvis olika syften inom denna komplexitet. De kan användas individuellt för särskilda ändamål eller komplettera varandra. I samtliga fall är det viktigt att arbeta nära aktörer för att tydligt definiera behov, syften, och säkerställa att de slutliga resultaten blir lokalt användbara.
|
|
| 6. |
- Flygare, Susanne
(författare)
-
Rent Slam 1995! : Minskade föroreningar i Slam från kommunala reningsverk
- 1993
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- En arbetsgrupp med företrädare för Länsstyrelsen i Gävleborg samt miljösakkunniga i Hudiksvalls, Ovanåkers och Bollnäs kommuner har sammanställt rapporten RENT SLAM 1995! Rapporten vänder sig tillsyn av kommunala reningsverk som miljöansvariga i industrier med miljöfarliga avloppsvatten.Till rapporten finns en underlagsrapport, uppbyggd med ett lösbladssystem för att möjliggöra löpande revideringar. Materialet kan efterhand kompletteras med behandling av andra typer av vatten.Underlagsrapporten finns tillgänglig i begränsad upplaga, avsedd för i första hand länets kommuner. Den innehåller bl a lagstiftning, förslag på behandling av olika slags vatten, förslag på riktvärden för utsläpp till vatten, exempel på utbyten till mindre farliga produkter, checklista på 5& LKP (lagen om kemiska produkter) samt exempel på verkstadsoljors och metallbearbetningsvätskors miljöfarlighet. Underlaget bygger till största delen på uppgifter från verkstads- och ytbehandlingsindustrin.1995 få ett kommunalt avloppsreningsslam som i ett långsiktigt perspektiv kan användas på åkermark utan risk för negativ inverkan på gröda eller mark.Utgångspunkter för gruppens arbeteGrundprincipen är att vi skall ha ett så rent avloppsreningsslam som möjligt. Detta med utgångspunkt från kravet att vi alltid skall välja den lösning som totalt sett är den bästa för miljön. Kostnaden för reningsåtgärderna bör läggas vid källan för föroreningen.Strävan bör vara att vi i länet skaffar oss en genomsam och ” konkurrensneutral” syn på hur frågorna skall behandlas.Bidragen från hushållen, dagvattnet och industrin bör kvantifieras bör det gällericke ned brytbara ämnen eller i övrigt oönskade ämnen i det allmänna spillvattnet.Samarbetsformer för länet skapas för att lösa reningen av vissa specialvästskor. En genomsam lösning för vissa typer av avloppsvatten borde vara ekonomiskt intressant jämfört med transport till SAKAB eller egna små reningsverk.Ett gemensamt dokument upprättas, innehållande förslag till policy för anslutning till kommunala avloppsreningsverk, åtgärdsförslag samt sammanställning av kunskapsläget.
|
|
| 7. |
- Giordanetto, Fabrizio, et al.
(författare)
-
Design of Selective sPLA2-X Inhibitor (-)-2-{2-[Carbamoyl-6-(trifluoromethoxy)-1 H-indol-1-yl]pyridine-2-yl}propanoic Acid
- 2018
-
Ingår i: ACS Medicinal Chemistry Letters. - : American Chemical Society. - 1948-5875. ; 9:7, s. 600-605
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- A lead generation campaign identified indole-based sPLA2-X inhibitors with a promising selectivity profile against other sPLA2 isoforms. Further optimization of sPLA2 selectivity and metabolic stability resulted in the design of (-)-17, a novel, potent, and selective sPLA2-X inhibitor with an exquisite pharmacokinetic profile characterized by high absorption and low clearance, and low toxicological risk. Compound (-)-17 was tested in an ApoE-/- murine model of atherosclerosis to evaluate the effect of reversible, pharmacological sPLA2-X inhibition on atherosclerosis development. Despite being well tolerated and achieving adequate systemic exposure of mechanistic relevance, (-)-17 did not significantly affect circulating lipid and lipoprotein biomarkers and had no effect on coronary function or histological markers of atherosclerosis.
|
|
| 8. |
- Jacobsson, Bo, 1960, et al.
(författare)
-
Preterm delivery: an overview on prediction, prevention and treatment : Prediktion, prevention och behandlingsmetoder.
- 2019
-
Ingår i: Läkartidningen. - 1652-7518. ; 116
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Due to a low level of understanding of mechanisms involved in spontaneous preterm delivery there is a lack of reliable biomarkers. Existing biomarkers have a low positive predictive value but a high negative predictive value. Use of tests with high negative predictive value will reduce unnecessary interventions and hospitalization of women with threatening preterm delivery. When given to the right pregnant women, antenatal corticosteroid treatment are still the most important obstetrical intervention and reduces both neonatal mortality and short- and long-term morbidity.Several ongoing national Swedish multicenter studies may increase the understanding of the roles of cervical length, preeclampsia screening and magnesium sulfate dosage in the context of preterm delivery in a Nordic setting. Major development has been achieved in prediction and prevention of preterm preeclampsia at the cost of a 10% screen positive rate.
|
|
| 9. |
- Jotanovic, Jelena, et al.
(författare)
-
Transcriptome Analysis Reveals Distinct Patterns Between the Invasive and Noninvasive Pituitary Neuroendocrine Tumors
- 2024
-
Ingår i: Journal of the Endocrine Society. - : Oxford University Press. - 2472-1972. ; 8:5
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Although most pituitary neuroendocrine tumors (PitNETs)/pituitary adenomas remain intrasellar, a significant proportion of tumors show parasellar invasive growth and 6% to 8% infiltrate the bone structures, thus affecting the prognosis. There is an unmet need to identify novel markers that can predict the parasellar growth of PitNETs. Furthermore, mechanisms that regulate bone invasiveness of PitNETs and factors related to tumor vascularization are largely unknown.We used genome-wide mRNA analysis in a cohort of 77 patients with PitNETs of different types to explore the differences in gene expression patterns between invasive and noninvasive tumors with respect to the parasellar growth and regarding the rare phenomenon of bone invasiveness. Additionally, we studied the genes correlated to the contrast enhancement quotient, a novel radiological parameter of tumor vascularization.Most of the genes differentially expressed related to the parasellar growth were genes involved in tumor invasiveness. Differentially expressed genes associated with bone invasiveness are involved in NF-κB pathway and antitumoral immune response. Lack of clear clustering regarding the parasellar and bone invasiveness may be explained by the influence of the cell lineage-related genes in this heterogeneous cohort of PitNETs.Our transcriptomics analysis revealed differences in the molecular fingerprints between invasive, including bone invasive, and noninvasive PitNETs, although without clear clustering. The contrast enhancement quotient emerged as a radiological parameter of tumor vascularization, correlating with several angiogenesis-related genes. Several of the top genes related to the PitNET invasiveness and vascularization have potential prognostic and therapeutic application requiring further research.
|
|
| 10. |
|
|
