| 1. |
- Andersson, Agneta, et al.
(författare)
-
Key role of phosphorus and nitrogen in regulating cyanobacterial community composition in the northern Baltic Sea
- 2015
-
Ingår i: Estuarine, Coastal and Shelf Science. - : Elsevier BV. - 0272-7714 .- 1096-0015. ; 164, s. 161-171
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Despite cyanobacteria being a key phytoplankton group in the Baltic Sea, the factors governing their community structure are still poorly understood. Here, we studied the occurrence of the orders Chroococcales, Oscillatoriales and Nostocales, and potentially explanatory variables at five locations in the northern Baltic Sea from June September, 1998-2012. Cyanobacteria constituted 1-36% of the total phytoplankton biomass along the north south gradient. In the Bothnian Bay, Chroococcales and Oscillatoriales dominated the cyanobacterial community, whereas in the Bothnian Sea and northern Baltic Proper, Nostocales was the dominant group. The dominance of Chroococcales was coupled to low salinity and low total phosphorus, whereas Oscillatoriales correlated with high total nitrogen and low salinity. Nostocales correlated to high total phosphorus, inorganic phosphorus and salinity. Chroococcales showed an increase over time in the offshore Bothnian Bay, whereas Nostocales increased in the coastal Bothnian Sea and coastal Baltic Proper. The increase of Nostocales in the coastal Bothnian Sea was explained by a rise in total phosphorus and decrease in dissolved inorganic nitrogen compared to an increase of total nitrogen and phosphorus in the coastal Baltic Proper. No significant trends were observed in the cyanobacterial community in the offshore Bothnian Sea and the offshore northern Baltic Proper. We concluded that Chroococcales may be a useful indicator for increased phosphorus levels in waters with low phosphorus concentrations, whereas Nostocales could be used as a quality indicator for increasing phosphorus concentrations in waters with low inorganic N/P ratios (< 20), such as in the coastal Bothnian Sea and Baltic Proper.
|
|
| 2. |
- Andersson, Agneta, et al.
(författare)
-
Mer fosfor ger mer cyanobakterier i norra Östersjön
- 2013
-
Ingår i: Havet. - : Havsmiljöinstitutet. ; , s. 51-54
-
Forskningsöversikt (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- I flera områden i norra Östersjön har cyanobakterierna ökat under de senaste tio till femton åren. I Bottenhavets och Egentliga Östersjöns kustområden ökar de kvävefixerande cyanobakterierna. I Bottenvikens utsjö är det den småcelliga och kolonibildande gruppen Chroococcales som blir fler. Förändringarna beror i flera fall på ökande halter av fosfor.
|
|
| 3. |
- Andersson, Agneta, et al.
(författare)
-
Metabarcoding vs Microscopy - comparison of methods to monitor phytoplankton communities
- 2023
-
Ingår i: ACS - ES & T Water. - : American Chemical Society (ACS). - 2690-0637. ; 3:8, s. 2671-2680
-
Tidskriftsartikel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Phytoplankton are used worldwide to monitor environmental status in aquatic systems. Long-time series of microscopy-analyzed phytoplankton are available from many monitoring stations. The microscopy-method is however time consuming and has short-comings. DNA metabarcoding has been suggested as an alternative method, but the consistency between different methods need further investigation. We performed a comparative study of microscopy and metabarcoding analyzing micro- and nanophytoplankton. For metabarcoding, 25-1000 ml seawater were filtered, DNA extracted and the 18S and 16S rRNA gene amplicons sequenced. For microscopy, based on the Utermöhl method we evaluated the use of three metrics: abundance, biovolume and carbon biomass. At the genus, species, and unidentified taxa level, metabarcoding generally showed higher taxonomic diversity than microscopy, and diversity was already captured at the lowest filtration volume tested, 25 ml. Metabarcoding and microscopy displayed relatively similar distribution pattern at the group level. The results showed that the relative abundances of the 18S rRNA amplicon at the group level best fitted the microscopy carbon biomass metric. The results are promising for implementing DNA metabarcoding as a complement to microscopy in phytoplankton monitoring, especially if databases would be improved and group level indexes could be applied to classify the environmental state of water bodies.
|
|
| 4. |
- Andersson, Agneta, et al.
(författare)
-
Strategi för kontrollerande övervakning av Bottenhavets vattendistrikt
- 2008
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Ett pelagialprogram har tagits fram för övervakning i relativt opåverkade referensområden i kustvattentyperna 16 t.o.m.19 i Bottemhavet. Programmet bör kunna ligga till grund för uppföljning av internationella, nationella och regionala miljömål samt följa upp ekologisk status. Den rumsliga variationen samt mellanårsvariationen hos pelagiala variabler i Bottenhavsområdet har använts som utgångspunkt för att beräkna provtagningsbehovet. Det föreslagna programmet innebär att mellan 48 och 60 provtagningar årsperiod, varefter ekologisk status kan bedömas. Designen gör det möjligt att med 80 % säkerhet bedöma ekologisk status med mätdata som ligger minst 20 % från klassgränserna. Mätprogrammet är designat för provtagningar -årsperiod. Stationer har slumpats ut i de olika typerna, och förslag på årliga provtagningslokaler anges i rapporten. Eftersom djupet vid de olika stationerna varierar, bör de flesta pelagiala variablerna provtas vid ett diskret djup i övre delen av vattenmassan, t.ex. 1 m djup. Av vetenskapliga och ekonomiska skäl är det viktigt att pelagialprogrammet samordnas för hela Bottenhavet.För mjukbottenfauna bedöms det befintliga integrerade programmet för trendanalys i Bottenhavet kunna tillgodose Vattendirektivets behov för kontrollerande övervakning i distriktet. Detta under förutsättning att Sundsvallsbuktens program fortsätter och att de nya nationella och regionala provtagningsområdena i södra Bottenhavet (Gräsö) etableras och drivs. Dimensioneringen av nuvarande nationellt och regionalt bottenfaunaprogram och områdesövervakning men har även visat sig vara väl anpassat för bedömningar inom ramen för Vattendirektivet. Enligt bedömningsgrunden bör minst 5 stationer användas för klassning av ekologisk status. Dessa stationer måste dock inte ligga inom samma vattenförekomst, utan kan vara lokaliserade i angränsande vattenförekomster. Den ekologiska statusen för mjukbottenfauna i enskilda vattenförekomster klassas genom extrapolering med hjälp av data från närbelägna områden med liknande bottenmiljö och påverkansgrad.Befintlig fiskebeståndsövervakning föreslås fortlöpa för att möjliggöra uppföljning av förändringar. En utökning av antalet övervakningsområden föreslås dock för att upprätta minst ett referensområde per inre och yttre kustvattentyp. En kombination av stratifierad och slumpmässig övervakning av fiskebestånden enligt nuvarande strategi föreslås, där djupintervallen stratifieras medan stationerna slumpas ut i respektive djupintervall.Provfiske och provtagning för miljögiftsanalys av fisk bör samordnas till samma provtagningstillfälle. Vidare bör den modell för samfinansiering och samordning som idag tillämpas av kustlänen i Bottniska viken för övervakning av fiskbestånd, samt och miljögiftsövervakning av fisk, fortlöpa även framöver.De ämnen som ingår i det pågående nationella programmet för miljögifter i fisk bör mätas även i de nya föreslagna områdena. När EU:s dotterdirektiv för prioriterade ämnen är beslutat och Vattenmyndigheterna fastställt miljökvalitetsnormer för särskilda förorenande ämnen, bör en översyn göras och ytterligare ämnen som är aktuella för Bottenhavet införlivas i övervakningsprogrammet. Miljögiftsövervakning i fisk bedöms kunna mätas med ett maximalt avstånd på 75 km mellan stationsområdena. Bedömning och extrapolera mätvärdena.För samtliga delprogram har en grova uppskattningar av kostnader för genomförandet gjorts.
|
|
| 5. |
- Degerlund, Maria, et al.
(författare)
-
Functional diversity in cryptic species of Chaetoceros socialis Lauder (Bacillariophyceae)
- 2012
-
Ingår i: Journal of Plankton Research. - : Oxford University Press. - 0142-7873 .- 1464-3774. ; 34:5, s. 416-431
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The cosmopolitan distribution of the marine planktonic diatom Chaetoceros socialis Lauder is generally interpreted as a case of wide ecological plasticity. However, cryptic diversity has recently been observed within this taxon and this genetic diversity could extend to phenotypic differences between allopatric populations. Monoclonal strains of C. socialis isolated from NE Atlantic/Arctic and Tyrrhenian Sea waters were cultivated at 2.5, 8 and 13°C, and analysed for morphological, phylogenetic (LSU rRNA gene) and physiological (growth rate, photosynthetic yield) traits. The molecular analysis indicated an unequivocal divergence between the southern and the northern strains. Clear differences in spore morphology between the two groups were also observed, despite their morphological similarity in vegetative form. The physiological data demonstrated a functional partition between the northern and southern strains. The northern strains showed significantly higher growth rates than the southern ones at the lower temperatures, and vice versa at 13°C. Differences between the groups were also observed in the photosynthetic yields. These results reveal the expression of allopatric speciation in several phenotypic characters, providing a functional dimension to the cryptic, or rather pseudo-cryptic, diversity observed within C. socialis. We believe that such an integrated approach is useful for robust taxonomic and functional delimitations of presumed cosmopolitan microorganisms.
|
|
| 6. |
- Eilertsen, Hans Chr, et al.
(författare)
-
The effect of freeze/thaw cycles on reproducibility of metabolic profiling of marine microalgal extracts using direct infusion high-resolution mass spectrometry (HR-MS)
- 2014
-
Ingår i: Molecules. - : MDPI. - 1431-5157 .- 1420-3049. ; 19:10, s. 16373-16380
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- During normal sample preparation, storage in freezers and subsequent freeze/thaw cycles are commonly introduced. The effect of freeze/thaw cycles on the metabolic profiling of microalgal extracts using HR-MS was investigated. Methanolic extracts of monocultures of Arctic marine diatoms were analyzed immediately after extraction, after seven days of storage at -78 degrees C (one freeze/thaw cycle), and after additional seven days at -20 degrees C (two freeze/thaw cycles). Repeated direct infusion high-resolution mass spectrometry analysis of microalgae extracts of the same sample showed that reproducibility was ca. 90% when a fresh (unfrozen) sample was analyzed. The overall reproducibility decreased further by ca. 10% after the first freeze/thaw-cycle, and after one more freeze/thaw cycle the reproducibility decreased further by ca. 7%. The decrease in reproducibility after freeze-thaw cycles could be attributed to sample degradation and not to instrument variability.
|
|
| 7. |
- Hajdu, Susanna, et al.
(författare)
-
Sommarens växtplanktonsamhälle har förändrats
- 2007
-
Ingår i: Havet 2007. - : Naturvårdsverket. - 9789162012625
-
Bokkapitel (populärvet., debatt m.m.)abstract
- Växtplanktonsamhällets sammansättning under sommaren har förändrats i alla havsområden under senare år. Exempelvis har filamentösa cyanobakterier ökat i Egentliga Östersjön. Den troligaste förklaringen är ändrade hydrografiska förutsättningar, så som ökad humustillförsel från land, försämrat ljusklimat, minskad salinitet och ökad temperatur orsakad av ändringar i klimatet.
|
|
| 8. |
- Huseby, Siv, et al.
(författare)
-
Bacterioplankton growth
- 2018
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Bacterioplankton growth rate is an indicator of the decomposition of organic matter and thereby trophic status of the Sea. The bacterioplankton metabolism accounts for about half of the mineralization of organic matter and thereby pelagic oxygen consumption.The bacterioplankton growth rate in deep waters indicates good trophic status in the off-shore Bothnian Bay and Bothnian Sea. Deep water growth rates were 67 % higher than at corresponding depths in the Atlantic Ocean, lacking excess enrichment. The decline that has earlier been reported has now ceased. During the last few years the growth rates has increased some and there is now no significant trends in any of the studied basins.
|
|
| 9. |
- Huseby, Siv, et al.
(författare)
-
Chemical Diversity as a Function of Temperature in Six Northern Diatom Species
- 2013
-
Ingår i: Marine Drugs. - : MDPI. - 1660-3397. ; 11:11, s. 4232-4245
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- In this study, we investigate how metabolic fingerprints are related to temperature. Six common northern temperate diatoms (Attheya longicornis, Chaetoceros socialis, Chaetoceros furcellatus, Porosira glacialis, Skeletonema marinoi, and Thalassiosira gravida) were cultivated at two different temperatures, 0.5 and 8.5 °C. To exclude metabolic variations due to differences in growth rates, the growth rates were kept similar by performing the experiments under light limited conditions but in exponential growth phase. Growth rates and maximum quantum yield of photosynthesis were measured and interpreted as physiological variables, and metabolic fingerprints were acquired by high-resolution mass spectrometry. The chemical diversity varied substantially between the two temperatures for the tested species, ranging from 31% similarity for C. furcellatus and P. glacialis to 81% similarity for A. longicornis. The chemical diversity was generally highest at the lowest temperature.
|
|
| 10. |
- Huseby, Siv, et al.
(författare)
-
Metabolic fingerprinting reveals differences between northern and southern strains of the cryptic diatom Chaetoceros socialis
- 2012
-
Ingår i: European journal of phycology. - : Taylor & Francis. - 0967-0262 .- 1469-4433. ; 47:4, s. 480-489
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Morphology and molecular phylogeny constitute the structural elements of diatom taxonomy. These approaches do not, however, give information on the functioning of taxa. Additional methods to serve a more integrated and wide-ranging taxonomy have therefore been called for. Metabolic fingerprinting is one approach used within the field of metabolomics, often applied in classification of samples. Here we apply metabolic fingerprinting in a taxonomic study of a cryptic diatom species. Strains of the cosmopolitan diatom Chaetoceros socialis from two geographical areas; the north-east Atlantic and Arctic and the Gulf of Naples, were cultivated at three different temperatures; 2.5, 8 and 13°C. The strains from the two different geographical areas exhibited different growth rates as well as different photosynthetic efficiencies. Algal extracts, collected at the end of the growth experiments, were analysed by Ultra-Performance Liquid Chromatography High Resolution Mass Spectrometry. The two groups of strains were separated by principal component analysis of their metabolic fingerprints. Analysis of the data revealed both qualitative and quantitative differences in metabolite markers. These phenotypic differences reinforce differences also found for morphology, phylogenetic markers and growth rates, and point at different adaptive characteristics in organisms living under different temperature regimes.
|
|
| 11. |
- Huseby, Siv
(författare)
-
Naturtypsbestämning av utsjöstationer i Bottniska viken
- 2017
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Fyra utsjöstationer, som ingår i den nationella miljöövervakningen i Bottniska viken, har i denna undersökning naturtypsbestämts enligt art- och habitatdirektivets naturtyper och EUNIS/HUB. Stationerna provtogs med Van Veen huggare och den taxonomiska analysen utfördes på lab. För utsjö finns tre möjliga Natura 2000-naturtyper: 1110 sandbankar, 1170 rev och 1180 bubbelstrukturer. Ingen av de fyra stationerna passade beskrivningen av några av dessa tre möjligheter och klassades därmed inte som naturtyp enligt habitatdirektivet. Alla stationer hade lerigt sediment (>90%) med inslag av lite sand, silt eller noduler. Vid alla stationer dominerade amphipod-arterna Monoporeia affinis och/eller Pontoporeia femorata och stationerna bedömdes som ABH3N1 baltisk afotisk lerigt sediment dominerad av Monoporeia affinis och/ eller Pontoporeia femorata.
|
|
| 12. |
- Huseby, Siv
(författare)
-
Pelagial biologi/bakterieplankton
- 2016
-
Ingår i: Havet. - : Naturvårdsverket, Havsmiljöinstitutet och Havs- och vattenmyndigheten. - 9789198229134 - 9789187967122 ; , s. 62-62
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 13. |
- Höglander, Helena, et al.
(författare)
-
Pelagial biologi/växtplankton
- 2016
-
Ingår i: Havet. - : Naturvårdsverket; Havsmiljöinstitutet; Havs- och vattenmyndigheten. - 9789198229134 - 9789187967122 ; , s. 56-59
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 14. |
- Karlsson, Bengt, et al.
(författare)
-
Skadliga algblomningar
- 2008
-
Ingår i: Havet. - Stockholm : Naturvårdsverket. - 9789162012717 ; , s. 46-49
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 15. |
|
|
