| 1. |
- Dinér, Peter, 1976, et al.
(författare)
-
Design, synthesis, and characterization of a highly effective Hog1 inhibitor: a powerful tool for analyzing MAP kinase signaling in yeast.
- 2011
-
Ingår i: PloS one. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 6:5
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The Saccharomyces cerevisiae High-Osmolarity Glycerol (HOG) pathway is a conserved mitogen-activated protein kinase (MAPK) signal transduction system that often serves as a model to analyze systems level properties of MAPK signaling. Hog1, the MAPK of the HOG-pathway, can be activated by various environmental cues and it controls transcription, translation, transport, and cell cycle adaptations in response to stress conditions. A powerful means to study signaling in living cells is to use kinase inhibitors; however, no inhibitor targeting wild-type Hog1 exists to date. Herein, we describe the design, synthesis, and biological application of small molecule inhibitors that are cell-permeable, fast-acting, and highly efficient against wild-type Hog1. These compounds are potent inhibitors of Hog1 kinase activity both in vitro and in vivo. Next, we use these novel inhibitors to pinpoint the time of Hog1 action during recovery from G(1) checkpoint arrest, providing further evidence for a specific role of Hog1 in regulating cell cycle resumption during arsenite stress. Hence, we describe a novel tool for chemical genetic analysis of MAPK signaling and provide novel insights into Hog1 action.
|
|
| 2. |
|
|
| 3. |
|
|
| 4. |
- Dinér, Peter, 1976, et al.
(författare)
-
Short cut to 1,2,3-triazole-based p38 MAP kinase inhibitors via [3+2]-cycloaddition chemistry
- 2009
-
Ingår i: New J. Chem.. - : Royal Society of Chemistry (RSC). - 1144-0546 .- 1369-9261. ; 33:5, s. 1010-1016
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- A series of 4,5-substituted 1,2,3-triazoles was synthesised via Cu(I)-catalysed azide–alkyne 1,3-dipolar [2+3]-cycloaddition reactions followed by a Suzuki coupling. The 1,2,3-triazoles were evaluated as inhibitors of the p38 MAP kinase, showing IC50 values in the high nanomolar range
|
|
| 5. |
- Mölelr, Hanne, et al.
(författare)
-
Food waste and date labelling - Issues affecting the durability
- 2016
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- The purpose of the project has been to identify how date labelling legislation on food is practised in Denmark, Finland, Norway and Sweden and how the durability can be affected in the food supply chain. The project recommends enhanced guidance for manufacturers, retailers and consumers.
|
|
| 6. |
- Ottosson, Jakob, et al.
(författare)
-
Bevattningsvatten : kunskapsunderlag
- 2019
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Livsmedel från växtriket kan i vissa fall sprida mikrobiologisk smitta. Bär, bladgrönt och groddarmedför en särskild risk. Det beror på att de ofta äts råa eller efter minimal tillredning. Vi värmer deminte innan vi äter dem.Om livsmedlen är kontaminerade är det med stor sannolikhet orsakat av bevattningen. Vattnet kan havarit påverkat av avföring. Det kan också bero på spillning från vilda djur. Även naturgödsel kanförorena produkterna vid stänk från jord.Syftet med detta projekt var att se över kvaliteten på vatten för bevattning i Sverige. Vi ville koppladet till mikrobiologiska risker och utifrån det ta fram underlag till nationella råd och riktlinjer. Måletär ”en säkrare produktion av ätfärdiga bär och grönsaker som bättre förebygger sjukdomsutbrott”.Det visade sig att kvaliteten på vattnet generellt sett var god hos odlarna i projektet. Det samma gällergrödor. I vatten hittade vi enstaka sjukdomsframkallande mikroorganismer och ESBL-bildande E. coli.Dessa hittade vi dock endast i ytvatten som var mer förorenade av avföring och spillning. Men endastett fåtal prov på gröda visade på högre fekal förorening. Majoriteten av dessa kom från en och sammaodlare, som bevattnade med vatten från en damm. Vi hittade inga patogener på grödor. Däremot var ettprov på vitkål positivt för ESBL-bildande E. coli.Vi gjorde en kvantitativ riskvärdering av Shigatoxinproducerande E. coli (STEC) från isbergssallat.Den visade att även en liten förorening orsakad av avföring och utan påvisade STEC-bakterier ibevattningsvattnet kan utgöra en risk för mag-och tarminfektion. Riskvärderingen kan användas somunderlag för att föreslå mikrobiologiska kriterier, till exempel på vattenkvalitet. Vi behöver dockbeakta osäkerheterna med värderingen. De viktigaste osäkerheterna var utsöndringen av ochpatogeniciteten hos STEC från infekterade nötkreatur. Hur mycket av dessa fastnar på den bevattnadegrödan? Hur stor är sannolikheten att infekteras vid låga doser (enstaka STEC-bakterier)? Och hur storär risken av stänk från jord?Det finns olika åtgärder att ta till för att minska sannolikheten för utbrott och sjukdomsfall. Dessa är 1.Kriterier för vattenkvalitet. 2: Rening av vatten som inte uppnår dessa kriterier. 3. Införa enuppehållstid mellan sista bevattning och skörd. 4. Dessutom kan konsumenterna skölja produkternainnan de konsumerar dem. Det är också viktigt att se till att hålla utrustningen ren, exempelvis rör ochmunstycken. På så vis undviks föroreningar och tillväxt av bakterier.Om ytvatten måste användas för bevattning under de sista två veckorna innan skörd bör ettprovtagningsprogram utformas. Proven bör då visa på låg fekal förorening samt avsaknad avSalmonella. I bästa fall bör ytvatten renas före bevattning. Detta kan göras till exempel med hjälp avfotokatalys, UV-ljus eller filtrering. De sista två dagarna före skörd bör dock endast vatten avdricksvattenkvalitet användas.I en framtid med sjunkande grundvattennivåer, torrare somrar och blötare vintrar finns ett behov av attsamla in vatten för bevattning. Det bör göras under höstregn och vårfloder, samt vintertid. Vattnet fårsedan lagras i magasin. Vatten från bevattningsmagasin kan behöva renas innan det används förbevattning beroende på hur skyddat magasinet är från föroreningar.
|
|
| 7. |
- Regot, Sergi, et al.
(författare)
-
Distributed biological computation with multicellular engineered networks.
- 2011
-
Ingår i: Nature. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1476-4687 .- 0028-0836. ; 469:7329, s. 207-11
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Ongoing efforts within synthetic and systems biology have been directed towards the building of artificial computational devices using engineered biological units as basic building blocks. Such efforts, inspired in the standard design of electronic circuits, are limited by the difficulties arising from wiring the basic computational units (logic gates) through the appropriate connections, each one to be implemented by a different molecule. Here, we show that there is a logically different form of implementing complex Boolean logic computations that reduces wiring constraints thanks to a redundant distribution of the desired output among engineered cells. A practical implementation is presented using a library of engineered yeast cells, which can be combined in multiple ways. Each construct defines a logic function and combining cells and their connections allow building more complex synthetic devices. As a proof of principle, we have implemented many logic functions by using just a few engineered cells. Of note, small modifications and combination of those cells allowed for implementing more complex circuits such as a multiplexer or a 1-bit adder with carry, showing the great potential for re-utilization of small parts of the circuit. Our results support the approach of using cellular consortia as an efficient way of engineering complex tasks not easily solvable using single-cell implementations.
|
|
