| 1. |
- Bylund, Annika, et al.
(författare)
-
Anticancer effects of a plant lignan 7-hydroxymatairesinol on a prostate cancer model in vivo.
- 2005
-
Ingår i: Experimental biology and medicine. - 1535-3702 .- 1535-3699. ; 230:3, s. 217-223
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Clinical intervention studies and experimental studies with lignan-rich diets suggest that lignans may have inhibitory effects on prostate cancer, but no clinical or experimental studies with purified lignans have been published. The purpose of this study was to investigate the effect of a plant lignan 7-hydroxymatairesinol (HMR) on LNCaP human prostate cancer xenografts in athymic mice. Athymic nude male mice were injected subcutaneously with LNCaP cells. Starting 3 days after tumor cell injections, a control diet or a control diet supplemented with 0.15% or 0.30% of HMR was administered to mice and the tumor take rate and growth was observed for 9 weeks. HMR diet inhibited the growth of LNCaP tumors. Mice treated with HMR had smaller tumor volume, lower tumor take rate, increased proportion of nongrowing tumors, and higher tumor cell apoptotic index compared with controls. Furthermore, the cell proliferation index was reduced in mice receiving the 0.30% HMR diet compared with mice receiving the control diet. Our results suggest that dietary HMR started at the early phase of the tumor development inhibits the growth of the LNCaP human prostate cancer xenografts in athymic male mice.
|
|
| 2. |
- Gunnarsson, Rebeqa, et al.
(författare)
-
Mutation, methylation, and gene expression profiles in dup(1q)-positive pediatric B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia
- 2018
-
Ingår i: Leukemia. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0887-6924 .- 1476-5551. ; 32:10, s. 2117-2125
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- High-throughput sequencing was applied to investigate the mutation/methylation patterns on 1q and gene expression profiles in pediatric B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (BCP ALL) with/without (w/wo) dup(1q). Sequencing of the breakpoint regions and all exons on 1q in seven dup(1q)-positive cases revealed non-synonymous somatic single nucleotide variants (SNVs) in BLZF1, FMN2, KCNT2, LCE1C, NES, and PARP1. Deep sequencing of these in a validation cohort w (n = 17)/wo (n = 94) dup(1q) revealed similar SNV frequencies in the two groups (47% vs. 35%; P = 0.42). Only 0.6% of the 36,259 CpGs on 1q were differentially methylated between cases w (n = 14)/wo (n = 13) dup(1q). RNA sequencing of high hyperdiploid (HeH) and t(1;19)(q23;p13)-positive cases w (n = 14)/wo (n = 52) dup(1q) identified 252 and 424 differentially expressed genes, respectively; only seven overlapped. Of the overexpressed genes in the HeH and t(1;19) groups, 23 and 31%, respectively, mapped to 1q; 60-80% of these encode nucleic acid/protein binding factors or proteins with catalytic activity. We conclude that the pathogenetically important consequence of dup(1q) in BCP ALL is a gene-dosage effect, with the deregulated genes differing between genetic subtypes, but involving similar molecular functions, biological processes, and protein classes.
|
|
| 3. |
- Lundin, Margareta
(författare)
-
Aspects on Image Quality in Radiologic Evaluation of the Urinary Tract
- 2012
-
Doktorsavhandling (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- The focus of this document is on image quality as one of the factors fundamental for the diagnostic process. With the rising number of procedures and the trend towards more complicated examinations, urinary tract investigations was chosen in this work as a good clinical model for evaluation of the factors influencing image quality and of the ways of evaluating image quality.In paper I, a method is described for optimisation during the introduction of a new imaging system, with a focus on the maintenance of image quality relative to the older already optimised system. Image quality was assessed using the image criteria of the European guidelines for IVU with visual grading analysis. Equivalent image quality in image pairs was achieved at 30% of the dose. The CDRAD contrast-detail phantom makes it possible to find dose levels that give equal image quality using different imaging systems.In paper II, the influence of bowel purgation on image quality in urography is questioned. The aim of this study was to compare bowel purgation and two other preparation methods; dietary restrictions and no preparation at all. Image quality was assessed according to European Commission criteria for excretory urography. The effectiveness of bowel purgation and the amount of residual gas were scored separately. The results of our study show that the preparation methods are of equal value and further use of bowel purgation before excretory urography cannot be justified.In paper III, the image quality of the non-enhanced series is compared to a virtual noncontrast series obtained using two generations of dual-energy CT scanners and taking CT of the urinary tract as a model. The image quality of the VNC images was rated inferior to the single-energy variant for both scanners, the OR range being 11.5–67.3 for the Definition and 2.1–2.8 for the Definition Flash. Visual noise and overall quality were regarded as better with Flash than with Definition. Image quality of VNC images obtained with the new generation of DECT is still slightly inferior compared to native images.In paper IV, the accuracy of measurement of renal calculi in a dual-energy, virtual, nonenhanced-image series is compared to actual stone size and a single-energy image series in the phantom study. This study shows that detection of small stones is not reliable, despite better image quality, with the new DECT and that small stones will be missed with VNC imaging. With larger stones, the inherent measurement error with CT is magnified with VNC imaging.
|
|
| 4. |
- Carr, C., et al.
(författare)
-
RPC : The rosetta plasma consortium
- 2007
-
Ingår i: Space Science Reviews. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0038-6308 .- 1572-9672. ; 128:1-4, s. 629-647
-
Forskningsöversikt (refereegranskat)abstract
- The Rosetta Plasma Consortium (RPC) will make in-situ measurements of the plasma enviromnent of comet 67P/Churyumov-Gerasimenko. The consortium will provide the complementary data sets necessary for an understanding of the plasma processes in the inner coma, and the structure and evolution of the coma with the increasing cometary activity. Five sensors have been selected to achieve this: the Ion and Electron Sensor (IES), the Ion Composition Analyser (ICA), the Langmuir Probe (LAP), the Mutual Impedance Probe (MIP) and the Magnetometer (MAG). The sensors interface to the spacecraft through the Plasma Interface Unit (PIU). The consortium approach allows for scientific, technical and operational coordination, and makes Optimum use of the available mass and power resources.
|
|
| 5. |
- Erlinge, D., et al.
(författare)
-
Bivalirudin versus Heparin Monotherapy in Myocardial Infarction
- 2017
-
Ingår i: New England Journal of Medicine. - : Massachusetts Medical Society. - 0028-4793 .- 1533-4406. ; 377:12, s. 1132-1142
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background The comparative efficacy of various anticoagulation strategies has not been clearly established in patients with acute myocardial infarction who are undergoing percutaneous coronary intervention (PCI) according to current practice, which includes the use of radial-artery access for PCI and administration of potent P2Y12 inhibitors without the planned use of glycoprotein IIb/IIIa inhibitors. Methods In this multicenter, randomized, registry-based, open-label clinical trial, we enrolled patients with either ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI) or non-STEMI (NSTEMI) who were undergoing PCI and receiving treatment with a potent P2Y12 inhibitor (ticagrelor, prasugrel, or cangrelor) without the planned use of glycoprotein IIb/IIIa inhibitors. The patients were randomly assigned to receive bivalirudin or heparin during PCI, which was performed predominantly with the use of radial-artery access. The primary end point was a composite of death from any cause, myocardial infarction, or major bleeding during 180 days of follow-up. Results A total of 6006 patients (3005 with STEMI and 3001 with NSTEMI) were enrolled in the trial. At 180 days, a primary end-point event had occurred in 12.3% of the patients (369 of 3004) in the bivalirudin group and in 12.8% (383 of 3002) in the heparin group (hazard ratio, 0.96; 95% confidence interval [CI], 0.83 to 1.10; P=0.54). The results were consistent between patients with STEMI and those with NSTEMI and across other major subgroups. Myocardial infarction occurred in 2.0% of the patients in the bivalirudin group and in 2.4% in the heparin group (hazard ratio, 0.84; 95% CI, 0.60 to 1.19; P=0.33), major bleeding in 8.6% and 8.6%, respectively (hazard ratio, 1.00; 95% CI, 0.84 to 1.19; P=0.98), definite stent thrombosis in 0.4% and 0.7%, respectively (hazard ratio, 0.54; 95% CI, 0.27 to 1.10; P=0.09), and death in 2.9% and 2.8%, respectively (hazard ratio, 1.05; 95% CI, 0.78 to 1.41; P=0.76). Conclusions Among patients undergoing PCI for myocardial infarction, the rate of the composite of death from any cause, myocardial infarction, or major bleeding was not lower among those who received bivalirudin than among those who received heparin monotherapy. (Funded by the Swedish Heart-Lung Foundation and others; VALIDATE-SWEDEHEART ClinicalTrialsRegister.eu number, 2012-005260-10 ; ClinicalTrials.gov number, NCT02311231 .).
|
|
| 6. |
- Essving, Per, 1960-, et al.
(författare)
-
Minimally invasive surgery did not improve outcome compared to conventional surgery following unicompartmental knee arthroplasty using local infiltration analgesia A randomized controlled trial with 40 patients
- 2012
-
Ingår i: Acta Orthopaedica. - New York, USA : Informa Healthcare. - 1745-3674 .- 1745-3682. ; 83:6, s. 634-641
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background and purpose: There has recently been interest in the advantages of minimally invasive surgery (MIS) over conventional surgery, and on local infiltration analgesia (LIA) during knee arthroplasty. In this randomized controlled trial, we investigated whether MIS would result in earlier home-readiness and reduced postoperative pain compared to conventional unicompartmental knee arthroplasty (UKA) where both groups received LIA.Patients and methods: 40 patients scheduled for UKA were randomized to a MIS group or a conventional surgery (CON) group. Both groups received LIA with a mixture of ropivacaine, ketorolac, and epinephrine given intra-and postoperatively. The primary endpoint was home-readiness (time to fulfillment of discharge criteria). The patients were followed for 6 months.Results: We found no statistically significant difference in home-readiness between the MIS group (median (range) 24 (21-71) hours) and the CON group (24 (21-46) hours). No statistically significant differences between the groups were found in the secondary endpoints pain intensity, morphine consumption, knee function, hospital stay, patient satisfaction, Oxford knee score, and EQ-5D. The side effects were also similar in the two groups, except for a higher incidence of nausea on the second postoperative day in the MIS group.Interpretation: Minimally invasive surgery did not improve outcome after unicompartmental knee arthroplasty compared to conventional surgery, when both groups received local infiltration analgesia. The surgical approach (MIS or conventional surgery) should be selected according to the surgeon's preferences and local hospital policies.
|
|
| 7. |
- Essving, Per, 1960-, et al.
(författare)
-
Minimally invasive surgery did not improve outcome compared to conventional surgery following unicompartmental knee arthroplasty when using local infiltration analgesia
-
Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Background and purpose: There has recently been focus on the advantages of minimally invasive surgery (MIS) over conventional surgery and on local infiltration analgesia (LIA) during knee arthroplasty. This prospective randomized controlled trial investigated whether MIS would result in earlier home readiness and reduced postoperative pain compared to conventional unicompartmental knee arthroplasty (UKA) where both groups received LIA. Patients and methods: 40 patients scheduled for UKA were randomized to group MIS or group CON (conventional surgery). Both groups received LIA, with a mixture of ropivacaine, ketorolac, and epinephrine, intra- and postoperatively. The primary endpoint was home readiness (time to fulfillment of discharge criteria). The patients were followed for 6 months. Results: We found no statistically significant difference in home readiness between group MIS, median (range) 24 (21–71) h compared to group CON, 24 (21–46) h. No statistically significant differences between the groups were found in the secondary endpoints: pain intensity, morphine consumption, knee function, hospital stay, patient satisfaction, Oxford Knee Score and EQ-5D. The side effects between the groups were also similar, except a higher incidence of nausea on the second postoperative day in group MIS compared with group CON. Interpretation: Minimally invasive surgery did not improve outcome after unicompartmental knee arthroplasty compared to conventional surgery, when both groups received local infiltration analgesia. The surgical approach (MIS or conventional surgery) should be selected according to surgeon’s preferences and local hospital policies. ClinicalTrials.gov. (Identifier NCT00991445).
|
|
| 8. |
- Glimskär, Anders, et al.
(författare)
-
Inventering och utveckling för uppföljning av gräsmarks- och hällmarksnaturtyper 2017
- 2018
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Rapporten beskriver resultat från biogeografisk uppföljning av några naturtyper med sparsam förekomst i landskapet. För hällmarkstorrängar (naturtyp 8230) visas resultat från tredje året av uppföljningen, som bland annat visar att en stor andel av hällmarkstorrängarna ligger utanför skyddade områden. För alvar, basiska berghällar och karsthällmark är 2017 det första året för ett förtätat stickprov på Öland och Gotland. Förutom variabler för artförekomst och vegetationsstruktur ingår också beskrivning av vittringsmaterial och karstsprickor samt en särskild metodik för karstlevande snäckor. Svämängar har karterats i sin helhet längs Vindelälven, med ett stickprov av fältbesökta ytor. De kommande fem åren är planen att svämängar vid samtliga större vattendrag från Dalälven och norrut karteras. Förutom uppföljningen av dessa naturtyper, så har även utvecklingsinsatser gjorts för andra naturtyper, som underlag för framtida uppföljning. Ett mindre antal objekt av höglänta slåtterängar och slåtterängar i låglandet har inventerats, för att ge underlag för hur artsammansättningen kan ge stöd för en tillförlitlig klassning av slåtter- och betespräglade naturtyper. Första tester har gjorts för hur högörtängar och svämängar kan följas vid mindre vattendrag, men fler år behövs för att slutsatserna ska bli tydliga. Tester har också gjorts för hur Remiils miljöövervakning i gräsmarker kan bidra för vanliga gräsmarksnaturtyper, men en bra lösning förutsätter kraftigt förbättrad samordning mellan olika inventeringar.
|
|
| 9. |
- Glimskär, Anders, et al.
(författare)
-
Inventering och utveckling för uppföljning av gräsmarks- och hällmarksnaturtyper 2017 (reviderad rapport)
- 2018
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- I denna rapport beskrivs resultat från arbetet med biogeografisk uppföljning av några naturtyper med sparsam eller aggregerad fördelning i landskapet. För hällmarkstorrängar (naturtyp 8230) redovisas här resultat från tredje året av det sexåriga inventeringsvarv, där polygoner större än 100 m2 (d.v.s. 0,01 hektar) har avgränsats med flygbildstolkning och därefter inventerats med tätt utlagda provytor, med minsta avstånd 10 m. En stor andel av hällmarkstorrängarna ligger utanför skyddade områden och TUVA-objekt, men förekomsten av hällmarkstorrängsarter är likartad i olika regioner och inom resp. utanför skyddade områden. För rapportering till EU för Art- och habitatdirektivet skulle det vara värdefullt med en utökad uppföljning av hällmarkstorrängar inom skyddade områden, med samma metodik som i det befintliga utlägget. Även för kalkhällmarksnaturtyperna finns en stor andel av ytorna utanför skyddade områden, förutom på Stora alvaret, som är väl täckt av TUVA och Natura 2000-områden. För dessa – basiska berghällar (6110), alvar och prekambriska kalkhällmarker (6280) samt karsthällmarker (8240) – har inventeringen genomförts med ett kraftigt förtätat stickprov av mindre landskapsrutor på Öland och Gotland. En utvidgad flygbildstolkning med heltäckande polygonavgränsning av naturtyper har använts, i kombination med provytor med en utökad lista av arter och andra variabler (t.ex. vittringsmaterial på kalksten, och en särskild grupp av variabler har tagits fram för karstsprickor och karstlevande snäckor. På Gotland har preliminärt, utifrån de provytor som inventerats hittills, ungefär en tredjedel av de fältbesökta provytorna någon förekomst av karstsprickor, och många av dem har ett stort antal hällsnäckor. Utgångspunkten är att denna design och metodik ska utgöra första året av ett tänkt sexårigt inventeringsvarv. För svämängar (6450) har en komplett inventering med avgränsning i flygbilder och stickprov av provytor utförts längs med hela Vindelälven. Under 2017 har omfattningen varit hälften av den tänkta inom ett sexårigt inventeringsvarv, där ambitionen är att samtliga svämängar från Dalälven och norrut ska karteras längs med alla vattendrag i Sverige som finns med i kartskiktet för naturtypen större vattendrag (3210). Att använda infraröda flygfoton från olika tidpunkter för att bedöma översvämningspåverkan ger mycket god träffsäkerhet, och vegetationens sammansättning har överensstämt mycket väl med den förväntade i de fältbesökta ytorna. Svämängar och högörtängar (6430) kan också finnas vid vissa mindre vattendrag, om vattenfluktuationen är tillräckligt stor för att bibehålla en lagom stor störning och förhindra igenväxning med träd och buskar. Vi har därför tagit fram en metodik för att kartera förekomster av de naturtyperna samordnat med den biogeografiska uppföljningen av mindre vattendrag (3260). Inga objekt påträffades 2017, men från 2018 görs uppföljningen i full skala i hela landet, vilket vi hoppas ger goda förutsättningarna för att ändå få användbara resultat till en rimlig kostnad. Metodtesterna för slåtterängar har framför allt fokuserat på naturtyperna slåtterängar i låglandet (6510) och höglänta slåtterängar (6520), men även objekt av lövängar har besökts (6530), för att få en bra helhetsbild över slåtterpräglade värden. För att belysa den frågan har fokus dock varit på markvegetationen, men inte på hävdpåverkade träd, som är en viktig del av lövängarnas värden. Slåtterängarna i alla regioner kännetecknas av stor andel örter i fältskiktet och en relativt enhetlig grupp av kärlväxter som verkar tydligt slåttergynnade i alla de besökta regionerna. Vårt förslag är att man även i fortsättningen utgår ifrån befintliga kartskikt över skyddsvärda slåtterängar, t.ex. från TUVA-databasen och miljöersättningen till slåtterängar. För trädanknutna värden i lövängar behövs dock andra typer av inventeringsmoment än de som har används hittills i detta projekt. Som komplement till t.ex. den klassning av vanliga gräsmarksnaturtyper som görs i Jordbruksverkets kvalitetsuppföljning av ängs- och betesmarker, så har en naturtypsklassning testats även för de gräsmarker som inventeras inom Remiil (Regional miljöövervakning i landskapsrutor), på uppdrag av 18 län. Eftersom denna inventering fokuserar på alla gräsmarkstyper i landskapet, så tillhör endast en mindre andel av fältytorna någon skyddsvärd naturtyp enligt EU:s klassificering, men eftersom totalantalet provytor är stort, så kan det ändå ge ett betydelsefullt och kostnadseffektivt bidrag, om bestämda åtgärder vidtas för att förbättra samordningen mellan de gräsmarksinventeringar som finns.
|
|
| 10. |
- Glimskär, Anders, et al.
(författare)
-
Uppföljning av gräsmarks- och hällmarksnaturtyper 2020
- 2021
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Rapporten presenterar resultat från två deluppdrag för gräsmarks- och hällmarksnaturtyper inom Art- och habitatdirektivet för år 2020. Det första innefattar resultat från löpande uppföljning för ett antal naturtyper där en riktad uppföljning finansieras specifikt inom detta uppdrag. Den andra delen innefattar naturtypsklassificering av provytor inom Remiil och kvalitetsuppföljningen av ängs- och betesmarksobjekt.För hällmarkstorrängar är 2020 det sjätte året av löpande uppföljning, och årets resultat har en stor mängd karterad hällmarkstorräng jämfört med tidigare år. Uppföljningen av svämängar som 2017 gjordes längs Vindelälven och 2018-2019 vid Dalälven, fortsatte under 2020 längs Ljungan. Även 2020 finansierades här ett tillägg till Remiils inventering av gräsmarker inom det gemensamma delprogrammet ”Gräsmarkernas gröna infrastruktur”. År 2017 var andelen naturtypsklassade provytor oväntat liten, men 2018-2020 var den betydligt större och närmare det förväntade. Kvalitetsuppföljningen av ängs- och betesmarker påbörjades 2006 och kompletteras sedan 2008 med naturtypsklassning i provytorna. Metodiken och dataförvaltningen är nu helt samordnad med Remiil och de naturtypsuppdrag som redovisas i denna rapport.
|
|
| 11. |
- Glimskär, Anders, et al.
(författare)
-
Uppföljning av gräsmarks- och hällmarksnaturtyper 2019
- 2019
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Rapporten presenterar resultat från två deluppdrag för gräsmarks- och hällmarksnaturtyper inom Artoch habitatdirektivet för år 2019. Det första innefattar resultat från löpande uppföljning för ett antal naturtyper där en riktad uppföljning finansieras specifikt inom detta uppdrag. Den andra delen innefattar naturtypsklassificering av provytor inom Remiil och kvalitets¬uppföljningen av ängs- och betesmarksobjekt.För hällmarkstorrängar är 2019 det femte året av löpande uppföljning, och årets resultat har en stor mängd karterad hällmarkstorräng jämfört med tidigare år. För kalkhällmarks¬naturtyper presenteras även de resultat för Öland som ursprungligen ingick i uppdraget 2018, eftersom vi då valde att senarelägga inventeringen på grund av den extremt torra sommaren. Uppföljningen av svämängar som 2017 gjordes längs Vindelälven och 2018 vid Nedre Dalälven, fortsatte under 2019 vid övriga Dalälven. Även 2018 och 2019 finansierades här ett tillägg till Remiils inventering av gräs¬marker inom det gemensamma delprogrammet ”Gräsmarkernas gröna infrastruktur”. År 2017 var andelen naturtypsklassade oväntat liten, men både 2018 och 2019 var den betydligt större och närmare det förväntade. Kvalitetsuppföljningen av ängs- och betesmarker påbörjades 2006 och kompletteras sedan 2008 med naturtypsklassning i provytorna. Metodiken och dataförvaltningen är nu helt samordnad med Remiil och de naturtyps¬uppdrag som redovisas i denna rapport
|
|
| 12. |
- Glimskär, Anders, et al.
(författare)
-
Uppföljning av gräsmarks- och hällmarksnaturtyper 2021
- 2022
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Sammanfattning Rapporten presenterar resultat från ett uppdrag för biogeografisk uppföljning av gräsmarks- och hällmarksnaturtyper inom art- och habitatdirektivet för år 2021. Det innefattar resultat från löpande uppföljning för ett antal naturtyper där en riktad uppföljning finansieras specifikt inom detta uppdrag. Det innefattar också som ett tilläggsmoment naturtypsklassificering av provytor inom Remiil. För hällmarkstorrängar är 2021 det sjunde året av löpande uppföljning. Vid jämförelse visar det sig att resultaten för hällmarkstorrängar 2015 inte är helt tillförlitliga på grund av otillräcklig kvalitet hos Lantmäteriets flygbilder vid den tiden. Uppföljningen av svämängar fortsatte under 2021 för Indalsälvens huvudavrinningsområde. Uppföljningen av slåtterängar samt kalkhällmarker på Öland/Gotland och fastlandet fortsatte på samma sätt som tidigare år.En särskild utvärdering har gjorts för avgränsning och klassning av slåtterängsnaturtyper och kalkhällmarker på fastlandet, utifrån SLU Artdatabankens GIS-skikt. Slutsatsen är att en stor del av ytorna bedöms vara av annan naturtyp än den avsedda, men att det normalt är näraliggande typer och att det troligen är svårt att förbättra klassningen ytterligare i förväg, t.ex. genom mer flygbildstolkning, utan att riskera att förlora värdefull information. Den tidigare bedömningen att hällmarker av hällmarkstallskogskaraktär inte bör ingå har dock stärkts. Kalkindikation hos mossor och lavar är det bästa kriteriet för att skilja ut kalkhällsnaturtyper, men även bedömning av själva berggrunden kan ingå.
|
|
| 13. |
- Glimskär, Anders, et al.
(författare)
-
Uppföljning av gräsmarks- och hällmarksnaturtyper 2022
- 2023
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Rapporten presenterar resultat från ett uppdrag för biogeografisk uppföljning av gräsmarks- och hällmarksnaturtyper inom art- och habitatdirektivet för år 2022. Det innefattar resultat från löpande uppföljning för ett antal naturtyper där en riktad uppföljning finansieras specifikt inom detta uppdrag. Den innefattar också som ett tilläggsmoment naturtypsklassificering av provytor i det gemensamma delprogrammet för gräsmarker inom Remiil. För hällmarkstorrängar är 2022 det åttonde året av löpande uppföljning. Uppföljningen av svämängar kompletterades med restytor i fält för Indalsälvens huvudavrinningsområde. Uppföljningen av slåtterängar samt kalkhällmarker på Öland/Gotland och fastlandet fortsatte på samma sätt som tidigare år.En särskild utvärdering har gjorts för statusbedömning och arealberäkning för hällmarkstorrängar samt alvar och andra kalkhällmarker på Öland, Gotland och fastlandet. Slutsatsen är att stickprovet är tillräckligt för bra skattningar för hällmarkstorräng och kalkhällmarker på Öland och Gotland. Mer data behövs för utvärdering av kalkhällmarker på fastlandet, men de bör troligen utvärderas separat från övriga kalkhällmarker.Ett arbete med att ta fram kriterier och uppföljningsmetodik för inlandssandmarker (grässandhedar, rissandhedar och sandstäpp) har påbörjats, med ambitionen att en löpande uppföljning ska kunna påbörjas under 2023.
|
|
| 14. |
- Glimskär, Anders, et al.
(författare)
-
Uppföljning och statusbedömning för gräsmarks- och hällmarksnaturtyper 2018
- 2019
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- I rapporten beskrivs resultat från arbete med biogeografisk uppföljning av några gräsmarks- och hällmarksnaturtyper med sparsam eller aggregerad fördelning i landskapet, där vi använder kombinationen av flygbildstolkning och fältinventering för att effektivisera och styra datainsamlingen, utifrån statistiskt representativa stickprov av områden över hela landet eller naturtypernas hela utbredningsområde. För alvar, basiska hällmarker och karsthällmarker görs uppföljningen än så länge endast i ett förtätat stickprov på Öland och Gotland. Rapporten innehåller också ett utkast till hur en uppföjning av hällmarkstorräng kan utföras specifikt för skyddade områden. En metodstudie har gjorts för att testa kriterier för avgränsning av fukthedar, som är tänkt att användas för uppföljning i och utanför kända förekomster. Som underlag för Sveriges rapportering till EU för Artikel 17 i Art- och habitatdirektivet har ett antal slumpvis utvalda lövängar på Gotland och i övriga landet fältbesökts, och data har samlats in som underlag för bedömning av bevarandestatus, med fokus på hävdgynnade träd och fältskiktsvegetation. Slutligen har förslag till kriterier för bevarandestatus tagits fram för vanliga gräsmarksnaturtyper, som underlag för Artikel 17-rapporteringen, och därefter har statusen per naturtyp klassats baserat på data från Jordbruksverkets kvalitetsuppföljning i ängs- och betesmarker.
|
|
| 15. |
|
|
| 16. |
|
|
| 17. |
|
|
| 18. |
|
|
| 19. |
|
|
| 20. |
|
|
| 21. |
|
|
| 22. |
|
|
| 23. |
|
|
| 24. |
- Glimskär, Anders, et al.
(författare)
-
Årsrapport för Regional miljöövervakning i landskapsrutor 2022
- 2023
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Denna årsrapport avser de uppdrag som SLU har haft från Länsstyrelsen i Örebro län m.fl. länsstyrelser under år 2022, att utföra miljöövervakning med riktad metodik för småbiotoper, gräsmarker och våtmarker i ett stickprov av landskapsrutor. År 2022 är det andra året av länsstyrelsernas löpande uppdrag med datainsamling som gäller för programperioden 2021-2026. Miljöövervakningen utförs inom ramen för tre så kallade gemensamma delprogram inom regional miljöövervakning: Småbiotoper i åkerlandskapet Gräsmarkernas gröna infrastruktur Vegetation och ingrepp i våtmarker
|
|
| 25. |
- Glimskär, Anders, et al.
(författare)
-
Årsrapport för Regional miljöövervakning i landskapsrutor 2023
- 2023
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Denna årsrapport avser de uppdrag som SLU har haft från Länsstyrelsen i Örebro län m.fl. länsstyrelser från och med år 2021, att utföra miljöövervakning med riktad metodik för småbiotoper, gräsmarker och våtmarker i ett stickprov av landskapsrutor. År 2021 var det första året av länsstyrelsernas löpande uppdrag med datainsamling för programperioden 2021-2026, och det är till största delen en direkt fortsättning på verksamheten under föregående period, 2015-2020. Miljöövervakningen utförs inom ramen för tre så kallade gemensamma delprogram inom regional miljöövervakning:Småbiotoper i åkerlandskapetGräsmarkernas gröna infrastrukturVegetation och ingrepp i våtmarker
|
|
| 26. |
- Holmstrom, Oscar, et al.
(författare)
-
Detection of breast cancer lymph node metastases in frozen sections with a point-of care low-cost microscope scanner
- 2019
-
Ingår i: PLOS ONE. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 14:3
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background Detection of lymph node metastases is essential in breast cancer diagnostics and staging, affecting treatment and prognosis. lntraoperative microscopy analysis of sentinel lymph node frozen sections is standard for detection of axillary metastases but requires access to a pathologist for sample analysis. Remote analysis of digitized samples is an alternative solution but is limited by the requirement for high-end slide scanning equipment.Objective To determine whether the image quality achievable with a low-cost, miniature digital microscope scanner is sufficient for detection of metastases in breast cancer lymph node frozen sections.Methods Lymph node frozen sections from 79 breast cancer patients were digitized using a prototype miniature microscope scanner and a high-end slide scanner. Images were independently reviewed by two pathologists and results compared between devices with conventional light microscopy analysis as ground truth.Results Detection of metastases in the images acquired with the miniature scanner yielded an overall sensitivity of 91% and specificity of 99% and showed strong agreement when compared to light microscopy (k = 0.91). Strong agreement was also observed when results were compared to results from the high-end slide scanner (k = 0.94). A majority of discrepant cases were micrometastases and sections of which no anticytokeratin staining was available.ConclusionAccuracy of detection of metastatic cells in breast cancer sentinel lymph node frozen sections by visual analysis of samples digitized using low-cost, point-of-care microscopy is comparable to analysis of digital samples scanned using a high-end, whole slide scanner. This technique could potentially provide a workflow for digital diagnostics in resource-limited settings, facilitate sample analysis at the point-of-care and reduce the need for trained experts on-site during surgical procedures.
|
|
| 27. |
- Jemt, Anders, 1985-, et al.
(författare)
-
Evaluation of methods for whole genome and transcriptome sequencing from nanograms of FFPE samples
-
Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- The most widely used method for the preservation of clinical tissue specimens is formalin fixation and paraffin embedding (FFPE). Simultaneous analysis of RNA and DNA from samples preserved using this method have long proved problematic, primarily due to lack of material. Here, we describe an attempt to build a complete analysis package for RNA and DNA extracted from single tissue sections. The workflow includes quality control of the extracted material, library preparation and data analysis. We extract DNA with varying integrity from FFPE sections and subject them to whole genome sequencing using two library preparation methods, Illumina TruSeq Nano using the Illumina NeoPrep and Rubicon Genomics ThruPlex. We are able to obtain some usable data, albeit with high duplication rates, demonstrating both the possibilities and challenges of sequencing damaged DNA. Two different approaches to transcriptome sequencing are assessed, the TruSeq RNA Access library preparation kit from Illumina and the SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit - Pico Input from Clonetech. The sequence capture approach of the TruSeq kit is shown to be more robust to low integrity RNA compared to the SMARTer kit. However, the SMARTer kit needs much less starting material and is able to yield data about all transcripts, not just protein coding mRNA.
|
|
| 28. |
- Kindström, Merit, et al.
(författare)
-
Inventering och utveckling för uppföljning av gräsmarks- och hällmarksnaturtyper 2017
- 2017
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- I denna rapport beskrivs resultat från arbetet med biogeografisk uppföljning av några naturtyper med sparsam eller aggregerad fördelning i landskapet. För hällmarkstorrängar (naturtyp 8230) redovisas här resultat från tredje året av det sexåriga inventeringsvarv, där polygoner större än 100 m2 har avgränsats med flygbildstolkning och därefter inventerats med tätt utlagda provytor, med minsta avstånd 10 m. En jämförelse visar att en mycket stor andel av hällmarkstorrängarna ligger utanför skyddade områden och TUVA-objekt, men att förekomsten av hällmarkstorrängsarter är väldigt likartad i olika regioner och inom resp. utanför skyddade områden. För kalkhällsnaturtyperna basiska berghällar (6110), alvar och prekambriska kalkhällmarker (6280) samt karsthällmarker (8240) har inventeringen genomförst med ett kraftigt förtätat stickprov av mindre landskapsrutor på Öland och Gotland. En utvidgad flygbildstolkning med heltäckande polygonavgränsning av naturtyper har använts, i kombination med provytor med en utökad lista av arter och andra variabler (t.ex. vittringsmaterial på kalksten, och en särskild grupp av variabler har tagits fram för karstsprickor och karstlevande snäckor. På Gotland har ungefär en tredjedel av ytorna någon förekomst av karstsprickor, och många av dem har ett stort antal hällsnäckor. Även för kalkhällmarker finns en stor andel av ytorna utanför skyddade områden, förutom på Stora alvaret, som är väl täckt av TUVA och Natura 2000-områden. Utgångspunkten är att denna design och metodik ska kunna utgöra första året av ett tänkt sexårigt inventeringsvarv. För svämängar (6450) har en komplett inventering med avgränsning i flygbilder och stickprov av provytor utförts längs med hela Vindelälven. Under 2017 har omfattningen varit hälften av den tänkta inom ett sexårigt inventeringsvarv, där ambitionen är att samtliga svämängar från dalälven och norrut ska karteras längs med alla vattendrag i Sverige som finns med i kartskiktet för naturtypen större vattendrag (3210). Att använda infraröda flygfoton från olika tidpunkter för att bedöma översvämningspåverkan ger mycket god träffsäkerhet, och vegetationens sammansättning har överensstämt mycket väl med den förväntade i de fältbesökta ytorna. Metodtesterna för slåtterängar har framför allt fokuserat på naturtyperna slåtterängar i låglandet (6510) och höglänta slåtterängar (6520), men även objekt av lövängar har besökts (6530), för att få en bra helhetsbild över slåtterpräglade värden. För att belysa den frågan har fokus dock varit på markvegetationen, men inte på hävdpåverkade träd, som är en viktig del av lövängarnas värden. Slåtterängarna i alla regioner kännetecknas av stor andel örter i fältskiktet och en relativt enhetlig grupp av kärlväxter som verkar tydligt slåttergynnade i alla de besökta regionerna. Vårt förslag är att man även i fortsättningen utgår ifrån befintliga kartskikt över skyddsvärda slåtterängar, t.ex. från TUVA-databasen och miljöersättningen till slåtterängar. För trädanknutna värden i lövängar behövs dock andra typer av inventeringsmoment än de som har används hittills i detta projekt
|
|
| 29. |
- Kuchalik, Jan, 1965-, et al.
(författare)
-
Local infiltration analgesia : a 2-year follow-up of patients undergoing total hip arthroplasty
- 2017
-
Ingår i: Journal of Anesthesia. - : Springer Japan KK. - 0913-8668 .- 1438-8359. ; 31:6, s. 837-845
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- PURPOSE: Local infiltration analgesia (LIA) is commonly used for postoperative pain management following total hip arthroplasty (THA). However, the long-term effects of the component drugs are unclear. The aim of our study was to investigate functional outcome, quality of life, chronic post-surgical pain, and adverse events in patients within 2 years of undergoing THA.METHODS: The study was a secondary analysis of data from a previous larger study. Eighty patients were randomized to receive either intrathecal morphine (Group ITM) or local infiltration analgesia (Group LIA) for pain management in a double-blind study. The parameters measured were patient-assessed functional outcome [using the Hip dysfunction and Osteo-arthritis Outcome Score (HOOS) questionnaire], health-related quality of life [using the European Quality of Life-5 dimensions (EQ-5D) questionnaire and the 36-Item Short Form Health Survey (SF-36) score], and pain using the numeric rating score (NRS), with persistent post-surgical pain having a NRS of > 3 or a HOOS pain sub-score of > 30. All complications and adverse events were investigated during the first 2 years after primary surgery.RESULTS: Pain intensity and rescue analgesic consumption were similar between the groups after hospital discharge. No differences were found in HOOS or SF-36 score between the groups up to 6 months after surgery. A significant group × time interaction was seen in the EQ 5D form in favor of the LIA group. No between-group difference in persistent post-surgical pain was found at 3 or 6 months, or in adverse events up to 2 years after surgery.CONCLUSION: Analysis of functional outcome, quality of life, and post-discharge surgical pain did not reveal significant differences between patients receiving LIA and those receiving ITM. LIA was found to be a safe technique for THA during the long-term follow-up. However, it should be noted that these conclusions are based on a limited number of patients.
|
|
| 30. |
- Kuchalik, Jan, 1965-, et al.
(författare)
-
Local infiltration analgesia or femoral nerve block for postoperative pain management in patients undergoing total hip arthroplasty : A randomized, double-blind study
- 2017
-
Ingår i: Scandinavian Journal of Pain. - : Walter de Gruyter. - 1877-8860 .- 1877-8879. ; 16, s. 223-230
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- BACKGROUND AND AIMS: Several methods for pain management following total hip arthroplasty (THA) have been described but the best postoperative pain management technique remains uncertain. We compared surgeon applied local infiltration analgesia (LIA) with anaesthesiologist performed femoral nerve block (FNB) using ultrasound. The primary aim was to assess pain intensity 24h after THA.METHODS: In this randomized, double-blind study, 56 patients (ASA I-III) undergoing THA consented to participate. In Group FNB, patients received an ultrasound-guided femoral nerve block using 30ml of ropivacaine 7.5mg/ml (225mg) while Group LIA received a similar volume of saline. Spinal anaesthesia was then performed and bupivacaine heavy, 3-3.5ml injected depending on patient characteristics. During surgery, patients in Group LIA received a mixture of 300mg (150ml) ropivacaine, ketorolac 30mg (1ml) and adrenaline 0.5mg (0.5ml) (total volume 151.5ml) peri-articularly and subcutaneously while Group FNB received 151.5ml of saline peri-articularly in a systematic way by the surgeon. A multi-hole catheter was placed with the tip placed intra-articularly at the end of surgery in both groups. After 23h, the LIA mixture consisting of 20ml ropivacaine (7.5mg/ml), ketorolac 30mg (1ml), adrenaline 0.1mg (1ml) (total volume 22ml) was injected in Group LIA and the same volume of saline in Group FNB. Postoperative pain, analgesic consumption (postoperative and post-discharge), side effects, home discharge, quality of life and hip function were recorded, the latter up to 6 months after surgery.RESULTS: Postoperative pain intensity was significantly lower in Group LIA compared to Group FNB during mobilization at 24h (primary endpoint), mean difference 1.8 NRS units (95% CI 0.7-2.9) (P=0.006), at rest after 4h (P=0.029) and on standing after 24 (P=0.0003) and 48h (P=0.043). Rescue morphine consumption was also significantly lower in Group LIA during 0-24, mean difference 13.5mg (95% CI, 6.1-20.9) (P=0.002) postoperatively. Motor block was greater at 6h (P=0.029) postoperatively in Group FNB. Two patients (one in each group) had persistent post-surgical pain (NRS>3) at 3 months (3.6%) but none at 6 month. No other differences were found between the groups.CONCLUSION: Local infiltration analgesia significantly reduces pain intensity on standing and mobilization, and rescue analgesic consumption compared to femoral nerve block without causing significant side effects. The superior analgesia in the LIA group may result from the secondary injection at 23h postoperatively and needs to be further evaluated in future studies. No differences were found in home discharge, quality of life and hip dysfunction between the groups.IMPLICATION: Local infiltration analgesia is the preferred method for postoperative pain management following THA compared to single-shot femoral nerve block.
|
|
| 31. |
- Lagerqvist, Bo, et al.
(författare)
-
Outcomes 1 year after thrombus aspiration for myocardial infarction.
- 2014
-
Ingår i: New England Journal of Medicine. - : Massachusetts Medical Society. - 0028-4793 .- 1533-4406. ; 371:12, s. 1111-1120
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Routine intracoronary thrombus aspiration before primary percutaneous coronary intervention (PCI) in patients with ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI) has not been proved to reduce short-term mortality. We evaluated clinical outcomes at 1 year after thrombus aspiration.
|
|
| 32. |
- Larsson, Britt-Marie, et al.
(författare)
-
Limited airway effects in mild asthmatics after exposure to air pollution in a road tunnel
- 2010
-
Ingår i: Respiratory Medicine. - : Elsevier BV. - 0954-6111 .- 1532-3064. ; 104:12, s. 1912-1918
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Ambient air pollution is a contributing factor to respiratory morbidity and mortality and asthmatics are a particularly vulnerable population. The aim of the study was to investigate whether acute exposure to traffic related air pollution in a road tunnel would increase bronchial responsiveness in mild asthmatics, and if this would be accompanied by increased measures of inflammatory markers in the airways assessed by nasal lavage (NAL) and induced sputum. Fourteen mild asthmatics (7 treated with inhaled corticosteroids) were exposed for 2 h in a road tunnel and a control environment, respectively, separated by at least 3 weeks. Symptoms and peak expiratory flow (PEF) were recorded. Seven hours following exposure sessions, subjects underwent measurements of fraction of exhaled nitric oxide (FENO), spirometry, and a bronchial provocation test. NAL, induced sputum and blood samples were collected. The median PM(2.5) and PM(10) levels during the exposure occasions in the road tunnel were 80 (range 41-93) μg/m(3) and 183 (72-213) μg/m(3) respectively. Irritative symptoms from the airways increased and PEF decreased after road tunnel exposure. Increased levels of IL-10, IL-12 and TNF-α were observed in NAL fluid from subjects without ongoing inhaled corticosteroid treatment. Forced expiratory volume in 1 s (FEV(1)) and the degree of bronchial responsiveness in asthmatics did not change significantly after tunnel exposure. We conclude that asthmatics exhibit increased symptoms, decreased PEF and signs of inflammatory response in the upper airways, after a 2 h road tunnel exposure. Our findings may further emphasize asthmatics as a vulnerable group to common air pollutants.
|
|
| 33. |
- Liljeruhm, Josefine, et al.
(författare)
-
Engineering a palette of eukaryotic chromoproteins for bacterial synthetic biology
- 2018
-
Ingår i: Journal of Biological Engineering. - : BIOMED CENTRAL LTD. - 1754-1611. ; 12
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background: Coral reefs are colored by eukaryotic chromoproteins (CPs) that are homologous to green fluorescent protein. CPs differ from fluorescent proteins (FPs) by intensely absorbing visible light to give strong colors in ambient light. This endows CPs with certain advantages over FPs, such as instrument-free detection uncomplicated by ultra-violet light damage or background fluorescence, efficient Forster resonance energy transfer (FRET) quenching, and photoacoustic imaging. Thus, CPs have found utility as genetic markers and in teaching, and are attractive for potential cell biosensor applications in the field. Most near-term applications of CPs require expression in a different domain of life: bacteria. However, it is unclear which of the eukaryotic CP genes might be suitable and how best to assay them.Results: Here, taking advantage of codon optimization programs in 12 cases, we engineered 14 CP sequences (meffRed, eforRed, asPink, spisPink, scOrange, fwYellow, amilGFP, amajLime, cjBlue, mefiBlue, aeBlue, amilCP, tsPurple and gfasPurple) into a palette of Escherichia coil BioBrick plasmids. BioBricks comply with synthetic biology's most widely used, simplified, cloning standard. Differences in color intensities, maturation times and fitness costs of expression were compared under the same conditions, and visible readout of gene expression was quantitated. A surprisingly large variation in cellular fitness costs was found, resulting in loss of color in some overnight liquid cultures of certain high-copy-plasmid-borne CPs, and cautioning the use of multiple CPs as markers in competition assays. We solved these two problems by integrating pairs of these genes into the chromosome and by engineering versions of the same CP with very different colors.Conclusion: Availability of 14 engineered CP genes compared in E coil, together with chromosomal mutants suitable for competition assays, should simplify and expand CP study and applications. There was no single plasmid-borne CP that combined all of the most desirable features of intense color, fast maturation and low fitness cost, so this study should help direct future engineering efforts.
|
|
| 34. |
- Lundin, Anders, et al.
(författare)
-
A stiff and straight back preoperatively is associated with a good outcome 2 years after lumbar disc surgery
- 2009
-
Ingår i: Acta Orthopaedica. - : Medical Journals Sweden AB. - 1745-3674 .- 1745-3682. ; 80:5, s. 573-578
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- BACKGROUND AND PURPOSE: The degree of lumbar lordosis and reduced lumbar mobility are regarded as important clinical features in patients with low back pain, and in lumbar disc herniation A more stiff back preoperatively in a proportion of patients has been shown to be associated with sequestered disc herniation. The main aim of this study was to investigate whether there was any correlation between lumbar lordosis and flexion on the one hand in patients with lumbar disc herniation who were scheduled for surgery, and postoperative pain and disability on the other. Our second aim was to determine the patterns of postoperative improvement in pain, perceived disability, and flexion/lordosis for 2 years after surgery. METHODS: Pain (VAS), disability (DRI), lumbar flexion and lordosis (Debrunner's kyfometer) were measured pre- and postoperatively in 80 patients who underwent microscopic lumbar disc surgery. RESULTS: Patients with preoperative hyperlordosis had more severe pain and more disability postoperatively than patients with hypolordosis. The level of pain did not change much from 2-6 weeks postoperatively until 2 years, while the perceived disability did not reach a steady state until 6 months after surgery. INTERPRETATION: Patients with a stiff and flat back have a good prognosis after lumbar disc surgery, and in most cases the pain will reach the 2-year level during the first 2-6 weeks, while the physical restoration measured by the lumbar flexion and lordosis, and the perceived disability, will continue to improve over the first 6 months after surgery.
|
|
| 35. |
- Lundin, Anders, et al.
(författare)
-
Corticosteroids peroperatively diminishes damage to the C-fibers in microscopic lumbar disc surgery
- 2005
-
Ingår i: Spine. - : Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health). - 0362-2436 .- 1528-1159. ; 30:21, s. 2362-2368
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- STUDY DESIGN:A subgroup analysis of patient outcomes from a double-blind randomized controlled study comparing corticosteroid versus saline in microscopic lumbar disc surgery.OBJECTIVES:To study if the use of corticosteroids combined with surgery alleviates the damage to the nerve fibers in lumbar disc herniation.SUMMARY OF BACKGROUND DATA:The use of quantitative sensory testing can detect damage to the myelinated A-delta fibers (cold sense) and the unmyelinated C-fibers (warmth sense). Corticosteroids combined with surgery in lumbar disc surgery enhance the outcome after surgery in terms of less pain and more rapid rehabilitation.METHODS:Analyzing quantitative sensory testing before surgery and after 2 weeks and 2 years.RESULTS:In the corticosteroid group, we saw a statistically significant normalization for the warmth disturbance comparing with control group, which not was detected concerning the cold disturbance.CONCLUSIONS:The use of corticosteroids combined with surgery seems to protect some of the damage to the C-fibers in lumbar disc herniation.
|
|
| 36. |
- Lundin, Anders, et al.
(författare)
-
Efficacy and Safety of the Dopaminergic Stabilizer Pridopidine (ACR16) in Patients With Huntington's Disease
- 2010
-
Ingår i: Clinical neuropharmacology. - 0362-5664 .- 1537-162X. ; 33:5, s. 260-264
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Objectives: To evaluate the efficacy and safety of the dopaminergic stabilizer pridopidine (ACR16) in patients with Huntington's disease (HD). Methods: In a randomized, double-blind, placebo-controlled, 4-week trial, patients with HD received pridopidine (50 mg/d, n = 28) or placebo (n = 30). The primary outcome measure was the change from baseline in weighted cognitive score, assessed by cognitive tests (Symbol Digit Modalities, verbal fluency, and Stroop tests). Secondary outcome measures included changes in the Unified Huntington's Disease Rating Scale, Hospital Anxiety and Depression Scale, Leeds Sleep Evaluation Questionnaire, Reitan Trail-Making Test A, and Clinical Global Impression of Change. Safety assessments were also performed. Results: There was no significant difference between pridopidine and placebo in the change from baseline of the weighted cognitive score. However, secondary measures such as affective symptoms showed trends toward improvement, and there was significant improvement in voluntary motor symptoms compared with placebo (P<0.05). Pridopidine was well tolerated, with a safety profile similar to placebo. Conclusions: Pridopidine shows promise as a treatment for some of the symptoms of HD. In this small-scale study, the most notable effect was improvement in voluntary motor symptoms. Larger, longer-term trials are warranted.
|
|
| 37. |
|
|
| 38. |
|
|
| 39. |
|
|
| 40. |
- Lundin, Fredrik, et al.
(författare)
-
Preoperative and postoperative H-1-MR spectroscopy changes in frontal deep white matter and the thalamus in idiopathic normal pressure hydrocephalus
- 2013
-
Ingår i: Journal of Neurology Neurosurgery and Psychiatry. - : BMJ. - 0022-3050 .- 1468-330X. ; 84:2, s. 188-193
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background In a previous study we found significantly decreased N-acetyl aspartate (NAA) and total Objective The primary aim of this study was to investigate if these metabolites in the thalamus were Subjects and methods Fourteen patients with iNPH, mean age 74 years, and 15 HI, also mean age 74 Results At 3 months postoperatively, we found no significant changes of tNA or NAA in the thalamus. In Conclusions Normalisation of thalamic tNA and NAA could not be detected postoperatively. The
|
|
| 41. |
- Lundin (Palmerius), Karljohan, 1977-, et al.
(författare)
-
Enabling design and interactive selection of haptic modes
- 2007
-
Ingår i: Virtual Reality. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1359-4338 .- 1434-9957.
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The ever increasing size and complexity of volumetric data in a wide range of disciplines makes it useful to augment volume visualization tools with alternative modalities. Studies have shown that introducing haptics can significantly increase both exploration speed and precision. It is also capable of conveying material properties of data and thus has great potential to improve user performance in volume data exploration. In this paper we describe how recent advances in volume haptics can be used to build haptic modes-building blocks for haptic schemes. These modes have been used as base components of a toolkit allowing for more efficient development of haptic prototypes and applications. This toolkit allows interactive construction, configuration and fine-tuning of both visual and haptic representations of the data. The technology is also used in a pilot study to determine the most important issues and aspects in haptic volume data interaction and exploration, and how the use of haptic modes can facilitate the implementation of effective haptic schemes.
|
|
| 42. |
- Martínez-Carranza, Markel, et al.
(författare)
-
A ribonucleotide reductase from Clostridium botulinum reveals distinct evolutionary pathways to regulation via the overall activity site
- 2020
-
Ingår i: Journal of Biological Chemistry. - : American Society for Biochemistry and Molecular Biology. - 0021-9258 .- 1083-351X. ; 295:46, s. 15576-15587
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Ribonucleotide reductase (RNR) is a central enzyme for the synthesis of DNA building blocks. Most aerobic organisms, including nearly all eukaryotes, have class I RNRs consisting of R1 and R2 subunits. The catalytic R1 subunit contains an overall activity site that can allosterically turn the enzyme on or off by the binding of ATP or dATP, respectively. The mechanism behind the ability to turn the enzyme off via the R1 subunit involves the formation of different types of R1 oligomers in most studied species and R1–R2 octamers in Escherichia coli. To better understand the distribution of different oligomerization mechanisms, we characterized the enzyme from Clostridium botulinum, which belongs to a subclass of class I RNRs not studied before. The recombinantly expressed enzyme was analyzed by size-exclusion chromatography, gas-phase electrophoretic mobility macromolecular analysis, EM, X-ray crystallography, and enzyme assays. Interestingly, it shares the ability of the E. coli RNR to form inhibited R1–R2 octamers in the presence of dATP but, unlike the E. coli enzyme, cannot be turned off by combinations of ATP and dGTP/dTTP. A phylogenetic analysis of class I RNRs suggests that activity regulation is not ancestral but was gained after the first subclasses diverged and that RNR subclasses with inhibition mechanisms involving R1 oligomerization belong to a clade separated from the two subclasses forming R1–R2 octamers. These results give further insight into activity regulation in class I RNRs as an evolutionarily dynamic process.
|
|
| 43. |
- Nilsson, R. Henrik, 1976, et al.
(författare)
-
Introducing guidelines for publishing DNA-derived occurrence data through biodiversity data platforms
- 2022
-
Ingår i: Metabarcoding and Metagenomics. - : Pensoft Publishers. - 2534-9708. ; 6, s. 239-244
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- DNA sequencing efforts of environmental and other biological samples disclose unprecedented and largely untapped opportunities for advances in the taxonomy, ecology, and geographical distributions of our living world. To realise this potential, DNA-derived occurrence data (notably sequences with dates and coordinates) – much like traditional specimens and observations – need to be discoverable and interpretable through biodiversity data platforms. The Global Biodiversity Information Facility (GBIF) recently headed a community effort to assemble a set of guidelines for publishing DNA-derived data. These guidelines target the principles and approaches of exposing DNA-derived occurrence data in the context of broader biodiversity data. They cover a choice of terms using a controlled vocabulary, common pitfalls, and good practices, without going into platform-specific details. Our hope is that they will benefit anyone interested in better exposure of DNA-derived occurrence data through general biodiversity data platforms, including national biodiversity portals. This paper provides a brief rationale and an overview of the guidelines, an up-to-date version of which is maintained at https://doi.org/10.35035/doc-vf1a-nr22. User feedback and interaction are encouraged as new techniques and best practices emerge.
|
|
| 44. |
- Adler, Jan-Olof, et al.
(författare)
-
The upgraded photon tagging facility at the MAX IV Laboratory
- 2013
-
Ingår i: Nuclear Instruments & Methods in Physics Research. Section A: Accelerators, Spectrometers, Detectors, and Associated Equipment. - : Elsevier BV. - 0167-5087 .- 0168-9002. ; 715, s. 1-10
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- A description is given of the upgraded photon tagging facility at the MAX IV Laboratory. Two magnetic spectrometers are used to momentum analyze post-bremsstrahlung electrons. The tagged photon range extends from 10 to 180 MeV with an energy resolution of about 300 keV. The system has been operated at rates up to 4 x 10(6) photons s(-1) MeV (-1). Different diagnostic tools are described as well as the experimental program.
|
|
| 45. |
- Agebjörn, Anders, et al.
(författare)
-
Kvinna – motsatsen till man? : Ordet kvinna:s semantik
- 2016
-
Ingår i: Svenskans beskrivning 34 : Förhandlingar vid Trettiofjärde sammankomsten Lund den 22–24 oktober 2014 - Förhandlingar vid Trettiofjärde sammankomsten Lund den 22–24 oktober 2014. - 0347-8971. - 9789187833779 - 9789187833786 ; 74, s. 61-77
-
Konferensbidrag (refereegranskat)
|
|
| 46. |
|
|
| 47. |
- Akkurt, I, et al.
(författare)
-
Photoneutron yields from tungsten in the energy range of the giant dipole resonance
- 2003
-
Ingår i: Physics in Medicine and Biology. - : IOP Publishing. - 1361-6560 .- 0031-9155. ; 48:20, s. 3345-3352
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Photoneutron production on the nuclei of high-Z components of medical accelerator heads can lead to a significant secondary dose during a course of bremsstrahlung radiotherapy, However, a quantitative evaluation of secondary neutron dose requires improved data on the photoreaction yields. These have been measured as a function of photon energy, neutron energy and neutron angle for W-nat, using tagged photons at the MAX-Lab photonuclear facility in Sweden. This work presents neutron yields for W-nat(gamma, n) and compares these with the predictions of the Monte Carlo code MCNP-GN, developed specifically to simulate photoneutron production at medical accelerators.
|
|
| 48. |
- Alneberg, Johannes, et al.
(författare)
-
BARM and BalticMicrobeDB, a reference metagenome and interface to meta-omic data for the Baltic Sea
-
Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- The Baltic Sea is one of the world’s largest brackish water bodies and is characterised by pronounced physicochemical gradients where microbes are the main biogeochemical catalysts. Meta-omic methods provide rich information on the composition of, and activities within microbial ecosystems, but are computationally heavy to perform. We here present the BAltic Sea Reference Metagenome (BARM), complete with annotated genes to facilitate further studies with much less computational effort. The assembly is constructed using 2.6 billion metagenomic reads from 81 water samples, spanning both spatial and temporal dimensions, and contains 6.8 million genes that have been annotated for function and taxonomy. The assembly is useful as a reference, facilitating taxonomic and functional annotation of additional samples by simply mapping their reads against the assembly. This capability is demonstrated by the successful mapping and annotation of 24 external samples. In addition, we present a public web interface, BalticMicrobeDB, for interactive exploratory analysis of the dataset.
|
|
| 49. |
- Alneberg, Johannes, et al.
(författare)
-
BARM and BalticMicrobeDB, a reference metagenome and interface to meta-omic data for the Baltic Sea
- 2018
-
Ingår i: Scientific Data. - : Nature Publishing Group. - 2052-4463. ; 5
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The Baltic Sea is one of the world's largest brackish water bodies and is characterised by pronounced physicochemical gradients where microbes are the main biogeochemical catalysts. Meta-omic methods provide rich information on the composition of, and activities within, microbial ecosystems, but are computationally heavy to perform. We here present the Baltic Sea Reference Metagenome (BARM), complete with annotated genes to facilitate further studies with much less computational effort. The assembly is constructed using 2.6 billion metagenomic reads from 81 water samples, spanning both spatial and temporal dimensions, and contains 6.8 million genes that have been annotated for function and taxonomy. The assembly is useful as a reference, facilitating taxonomic and functional annotation of additional samples by simply mapping their reads against the assembly. This capability is demonstrated by the successful mapping and annotation of 24 external samples. In addition, we present a public web interface, BalticMicrobeDB, for interactive exploratory analysis of the dataset. [GRAPHICS] .
|
|
| 50. |
- Amnebrink, Dennis, et al.
(författare)
-
Genome-resolved analysis reveals transcriptional transitions across seasons in Baltic Sea prokaryotes
-
Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Microbial communities in surface waters of temperate seas are exposed to recurring annual seasonal variation in temperature and nutrient concentrations. To what extent bacterioplankton populations in natural communities alter their functional repertoire as a result of seasonal succession has not been thoroughly investigated. Here we use metatranscriptomics and leverage a comprehensive catalogue of metagenome-assembled genomes (MAGs) to follow gene expression in individual populations over a two-year time period at an offshore station in the Baltic Sea. We show that the collective expression of the MAGs changed in a consistent manner across seasons in the two years, forming clusters representing the four seasons, and that more than 80% of these displayed a recurring seasonal pattern. Furthermore, we found that the changes in expression could partly be explained by modulation of expression within the prokaryotic populations, since intra-population expression patterns also changed with season. Taken together, our results demonstrate how natural microbial populations alter their expression on the gene level, and how these changes drive large scale changes on both population and community level. This work aims to broaden the understanding of how microbes respond and adapt to their environment by preferentially altering their expressed genetic repertoire, and how microbial community dynamics can be explained through the gene expression of various populations constituting the community.
|
|
