SwePub
Sök i SwePub databas

  Utökad sökning

Träfflista för sökning "id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-528363" "

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-528363"

  • Resultat 1-1 av 1
Sortera/gruppera träfflistan
   
NumreringReferensOmslagsbildHitta
1.
  • Arnqvist, Göran, Professor, 1961-, et al. (författare)
  • A chromosome-level assembly of the seed beetle Callosobruchus maculatus genome with annotation of its repetitive elements
  • 2024
  • Ingår i: G3. - : Oxford University Press. - 2160-1836. ; 14:2
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Callosobruchus maculatus is a major agricultural pest of legume crops worldwide and an established model system in ecology and evolution. Yet, current molecular biological resources for this species are limited. Here, we employ Hi-C sequencing to generate a greatly improved genome assembly and we annotate its repetitive elements in a dedicated in-depth effort where we manually curate and classify the most abundant unclassified repeat subfamilies. We present a scaffolded chromosome-level assembly, which is 1.01 Gb in total length with 86% being contained within the 9 autosomes and the X chromosome. Repetitive sequences accounted for 70% of the total assembly. DNA transposons covered 18% of the genome, with the most abundant superfamily being Tc1-Mariner (9.75% of the genome). This new chromosome-level genome assembly of C. maculatus will enable future genetic and evolutionary studies not only of this important species but of beetles more generally.
  •  
Skapa referenser, mejla, bekava och länka
  • Resultat 1-1 av 1

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy