SwePub
Sök i SwePub databas

  Utökad sökning

Träfflista för sökning "onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-136421" "

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-136421"

  • Resultat 1-1 av 1
Sortera/gruppera träfflistan
   
NumreringReferensOmslagsbildHitta
1.
  • Khan, Mehmood Alam, et al. (författare)
  • fastphylo : Fast tools for phylogenetics
  • 2013
  • Ingår i: BMC Bioinformatics. - : BioMed Central. - 1471-2105. ; 14:1, s. 334-
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Background: Distance methods are ubiquitous tools in phylogenetics. Their primary purpose may be to reconstruct evolutionary history, but they are also used as components in bioinformatic pipelines. However, poor computational efficiency has been a constraint on the applicability of distance methods on very large problem instances. Results: We present fastphylo, a software package containing implementations of efficient algorithms for two common problems in phylogenetics: estimating DNA/protein sequence distances and reconstructing a phylogeny from a distance matrix. We compare fastphylo with other neighbor joining based methods and report the results in terms of speed and memory efficiency. Conclusions: Fastphylo is a fast, memory efficient, and easy to use software suite. Due to its modular architecture, fastphylo is a flexible tool for many phylogenetic studies.
  •  
Skapa referenser, mejla, bekava och länka
  • Resultat 1-1 av 1

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy