SwePub
Sök i SwePub databas

  Utökad sökning

Träfflista för sökning "onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-142798" "

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-142798"

  • Resultat 1-1 av 1
Sortera/gruppera träfflistan
   
NumreringReferensOmslagsbildHitta
1.
  • Granholm, Viktor, 1986-, et al. (författare)
  • Fast and accurate database searches with MS-GF+percolator
  • 2014
  • Ingår i: Journal of Proteome Research. - : American Chemical Society (ACS). - 1535-3893 .- 1535-3907. ; 13:2, s. 890-897
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • One can interpret fragmentation spectra stemming from peptides in mass-spectrometry-based proteomics experiments using so-called database search engines. Frequently, one also runs post-processors such as Percolator to assess the confidence, infer unique peptides, and increase the number of identifications. A recent search engine, MS-GF+, has shown promising results, due to a new and efficient scoring algorithm. However, MS-GF+ provides few statistical estimates about the peptide-spectrum matches, hence limiting the biological interpretation. Here, we enabled Percolator processing for MS-GF+ output and observed an increased number of identified peptides for a wide variety of data sets. In addition, Percolator directly reports p values and false discovery rate estimates, such as q values and posterior error probabilities, for peptide-spectrum matches, peptides, and proteins, functions that are useful for the whole proteomics community.
  •  
Skapa referenser, mejla, bekava och länka
  • Resultat 1-1 av 1
Typ av publikation
tidskriftsartikel (1)
Typ av innehåll
refereegranskat (1)
Författare/redaktör
Kim, S. (1)
Fernandez Navarro, J ... (1)
Käll, Lukas (1)
Sjölund, Erik (1)
Smith, R. D. (1)
Granholm, Viktor, 19 ... (1)
Lärosäte
Kungliga Tekniska Högskolan (1)
Stockholms universitet (1)
Språk
Engelska (1)
Forskningsämne (UKÄ/SCB)
Naturvetenskap (1)
År
2014 (1)

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy