Sökning: (WFRF:(Van Loo B)) srt2:(2020-2023)
> (2022) >
Signatures of copy ...
Signatures of copy number alterations in human cancer
-
- Steele, Christopher D (författare)
- University College London
-
- Abbasi, Ammal (författare)
- University of California, San Diego
-
- Islam, S M Ashiqul (författare)
- University of California, San Diego
-
visa fler...
-
- Bowes, Amy L (författare)
- Francis Crick Institute,University College London
-
- Khandekar, Azhar (författare)
- University of California, San Diego
-
- Haase, Kerstin (författare)
- Francis Crick Institute
-
- Hames-Fathi, Shadi (författare)
- University College London
-
- Ajayi, Dolapo (författare)
- University College London
-
- Verfaillie, Annelien (författare)
- Francis Crick Institute
-
- Dhami, Pawan (författare)
- UCL Cancer Institute
-
- McLatchie, Alex (författare)
- UCL Cancer Institute
-
- Lechner, Matt (författare)
- UCL Cancer Institute
-
- Light, Nicholas (författare)
- Hospital for Sick Children, Toronto,University of Toronto
-
- Shlien, Adam (författare)
- Hospital for Sick Children, Toronto,University of Toronto
-
- Malkin, David (författare)
- University of Toronto,Hospital for Sick Children, Toronto
-
- Feber, Andrew (författare)
- Royal Marsden NHS Foundation Trust,Institute of Cancer Research London
-
- Proszek, Paula (författare)
- Institute of Cancer Research London,Royal Marsden NHS Foundation Trust
-
- Lesluyes, Tom (författare)
- Francis Crick Institute
-
- Mertens, Fredrik (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Genetik,Forskargrupper vid Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Genetics,Lund University Research Groups,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
- Flanagan, Adrienne M (författare)
- University College London,Royal National Orthopedic Hospital
-
- Tarabichi, Maxime (författare)
- Francis Crick Institute,Université Libre de Bruxelles (ULB)
-
- Van Loo, Peter (författare)
- Francis Crick Institute
-
- Alexandrov, Ludmil B (författare)
- University of California, San Diego
-
- Pillay, Nischalan (författare)
- Royal National Orthopedic Hospital,University College London
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2022-06-15
- 2022
- Engelska 8 s.
-
Ingår i: Nature. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0028-0836 .- 1476-4687. ; 606:7916, s. 984-991
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Gains and losses of DNA are prevalent in cancer and emerge as a consequence of inter-related processes of replication stress, mitotic errors, spindle multipolarity and breakage-fusion-bridge cycles, among others, which may lead to chromosomal instability and aneuploidy1,2. These copy number alterations contribute to cancer initiation, progression and therapeutic resistance3-5. Here we present a conceptual framework to examine the patterns of copy number alterations in human cancer that is widely applicable to diverse data types, including whole-genome sequencing, whole-exome sequencing, reduced representation bisulfite sequencing, single-cell DNA sequencing and SNP6 microarray data. Deploying this framework to 9,873 cancers representing 33 human cancer types from The Cancer Genome Atlas6 revealed a set of 21 copy number signatures that explain the copy number patterns of 97% of samples. Seventeen copy number signatures were attributed to biological phenomena of whole-genome doubling, aneuploidy, loss of heterozygosity, homologous recombination deficiency, chromothripsis and haploidization. The aetiologies of four copy number signatures remain unexplained. Some cancer types harbour amplicon signatures associated with extrachromosomal DNA, disease-specific survival and proto-oncogene gains such as MDM2. In contrast to base-scale mutational signatures, no copy number signature was associated with many known exogenous cancer risk factors. Our results synthesize the global landscape of copy number alterations in human cancer by revealing a diversity of mutational processes that give rise to these alterations.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
Nature
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Steele, Christop ...
-
Abbasi, Ammal
-
Islam, S M Ashiq ...
-
Bowes, Amy L
-
Khandekar, Azhar
-
Haase, Kerstin
-
visa fler...
-
Hames-Fathi, Sha ...
-
Ajayi, Dolapo
-
Verfaillie, Anne ...
-
Dhami, Pawan
-
McLatchie, Alex
-
Lechner, Matt
-
Light, Nicholas
-
Shlien, Adam
-
Malkin, David
-
Feber, Andrew
-
Proszek, Paula
-
Lesluyes, Tom
-
Mertens, Fredrik
-
Flanagan, Adrien ...
-
Tarabichi, Maxim ...
-
Van Loo, Peter
-
Alexandrov, Ludm ...
-
Pillay, Nischala ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature
- Av lärosätet
-
Lunds universitet