Sökning: WFRF:(Alalam Hanna)
> (2020) >
A High-Throughput M...
A High-Throughput Method for Screening for Genes Controlling Bacterial Conjugation of Antibiotic Resistance.
-
- Alalam, Hanna (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Graf, Fabrice (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Department of Chemistry and Molecular Biology,Centre for antibiotic resistance research, CARe
-
- Palm, Martin (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
visa fler...
-
- Abadikhah, Marie (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Zackrisson, Martin (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Boström, Jonas (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Fransson, Alfred (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Hadjineophytou, Chris (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Persson, Linnéa (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Stenberg, Simon (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Mattsson, Matilda (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Ghiaci, Payam (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Department of Chemistry and Molecular Biology,Centre for antibiotic resistance research, CARe
-
- Sunnerhagen, Per, 1959 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Department of Chemistry and Molecular Biology,Centre for antibiotic resistance research, CARe
-
- Warringer, Jonas, 1973 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Farewell, Anne, 1961 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2020
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: mSystems. - 2379-5077. ; 5:6
- Relaterad länk:
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The rapid horizontal transmission of antibiotic resistance genes on conjugative plasmids between bacterial host cells is a major cause of the accelerating antibiotic resistance crisis. There are currently no experimental platforms for fast and cost-efficient screening of genetic effects on antibiotic resistance transmission by conjugation, which prevents understanding and targeting conjugation. We introduce a novel experimental framework to screen for conjugation-based horizontal transmission of antibiotic resistance between >60,000 pairs of cell populations in parallel. Plasmid-carrying donor strains are constructed in high-throughput. We then mix the resistance plasmid-carrying donors with recipients in a design where only transconjugants can reproduce, measure growth in dense intervals, and extract transmission times as the growth lag. As proof-of-principle, we exhaustively explore chromosomal genes controlling F-plasmid donation within Escherichia coli populations, by screening the Keio deletion collection in high replication. We recover all seven known chromosomal gene mutants affecting conjugation as donors and identify many novel mutants, all of which diminish antibiotic resistance transmission. We validate nine of the novel genes' effects in liquid mating assays and complement one of the novel genes' effect on conjugation (rseA). The new framework holds great potential for exhaustive disclosing of candidate targets for helper drugs that delay resistance development in patients and societies and improve the longevity of current and future antibiotics. Further, the platform can easily be adapted to explore interspecies conjugation, plasmid-borne factors, and experimental evolution and be used for rapid construction of strains.IMPORTANCE The rapid transmission of antibiotic resistance genes on conjugative plasmids between bacterial host cells is a major cause of the accelerating antibiotic resistance crisis. There are currently no experimental platforms for fast and cost-efficient screening of genetic effects on antibiotic resistance transmission by conjugation, which prevents understanding and targeting conjugation. We introduce a novel experimental framework to screen for conjugation-based horizontal transmission of antibiotic resistance between >60,000 pairs of cell populations in parallel. As proof-of-principle, we exhaustively explore chromosomal genes controlling F-plasmid donation within E. coli populations. We recover all previously known and many novel chromosomal gene mutants that affect conjugation efficiency. The new framework holds great potential for rapid screening of compounds that decrease transmission. Further, the platform can easily be adapted to explore interspecies conjugation, plasmid-borne factors, and experimental evolution and be used for rapid construction of strains.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- antimicrobial resistance
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
mSystems
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Alalam, Hanna
-
Graf, Fabrice
-
Palm, Martin
-
Abadikhah, Marie
-
Zackrisson, Mart ...
-
Boström, Jonas
-
visa fler...
-
Fransson, Alfred
-
Hadjineophytou, ...
-
Persson, Linnéa
-
Stenberg, Simon
-
Mattsson, Matild ...
-
Ghiaci, Payam
-
Sunnerhagen, Per ...
-
Warringer, Jonas ...
-
Farewell, Anne, ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Mikrobiologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
- Artiklar i publikationen
-
mSystems
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet