| 1. |
- Lopes Cardozo, Josephine M N, et al.
(författare)
-
Associations of a Breast Cancer Polygenic Risk Score With Tumor Characteristics and Survival
- 2023
-
Ingår i: Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology. - 0732-183X .- 1527-7755. ; 41:10, s. 1849-1863
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- PURPOSE: A polygenic risk score (PRS) consisting of 313 common genetic variants (PRS313) is associated with risk of breast cancer and contralateral breast cancer. This study aimed to evaluate the association of the PRS313 with clinicopathologic characteristics of, and survival following, breast cancer.METHODS: Women with invasive breast cancer were included, 98,397 of European ancestry and 12,920 of Asian ancestry, from the Breast Cancer Association Consortium (BCAC), and 683 women from the European MINDACT trial. Associations between PRS313 and clinicopathologic characteristics, including the 70-gene signature for MINDACT, were evaluated using logistic regression analyses. Associations of PRS313 (continuous, per standard deviation) with overall survival (OS) and breast cancer-specific survival (BCSS) were evaluated with Cox regression, adjusted for clinicopathologic characteristics and treatment.RESULTS: The PRS313 was associated with more favorable tumor characteristics. In BCAC, increasing PRS313 was associated with lower grade, hormone receptor-positive status, and smaller tumor size. In MINDACT, PRS313 was associated with a low risk 70-gene signature. In European women from BCAC, higher PRS313 was associated with better OS and BCSS: hazard ratio (HR) 0.96 (95% CI, 0.94 to 0.97) and 0.96 (95% CI, 0.94 to 0.98), but the association disappeared after adjustment for clinicopathologic characteristics (and treatment): OS HR, 1.01 (95% CI, 0.98 to 1.05) and BCSS HR, 1.02 (95% CI, 0.98 to 1.07). The results in MINDACT and Asian women from BCAC were consistent.CONCLUSION: An increased PRS313 is associated with favorable tumor characteristics, but is not independently associated with prognosis. Thus, PRS313 has no role in the clinical management of primary breast cancer at the time of diagnosis. Nevertheless, breast cancer mortality rates will be higher for women with higher PRS313 as increasing PRS313 is associated with an increased risk of disease. This information is crucial for modeling effective stratified screening programs.
|
|
| 2. |
|
|
| 3. |
|
|
| 4. |
|
|
| 5. |
|
|
| 6. |
|
|
| 7. |
- Malm, Joakim, et al.
(författare)
-
Utvärdering av SI-verksamheten vid Lunds universitet 2022/23
- 2023
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Enkelt uttryckt är Samverkansinlärning (SI) en studiecirkel kopplat till en utmanande kurs. SI leds av en senior student som utformar läraktiviteter där studenterna arbetar i grupper med att förklara och förtydliga svårt kursmaterial. Målsättningen med SI, förutom förbättrade prestationer i den aktuella kursen, är att studenterna skall utveckla goda studiestrategier och bli mer självständiga i sitt lärande. Denna rapport behandlar SI-verksamheten vid Lunds universitet under läsåret 2022/23. Målsättningen är att läsaren skall få en god bild av hur SI bedrivs vid lärosätet och hur insatsen upplevs av deltagare och studentledare. Rapporten bygger dels på kvantitativa data – SI-närvaro, samt närvaron kopplat till studenternas prestationer i SI-stödda kurser. Och dels på kvalitativa data från enkäter till deltagare och SI-ledare, dels information frän metodhandledare och SI-koordinatorer. Under läsåret 2022/23 kompletterades undervisningen i 204 kurstillfällen av SI där totalt 266 studentledare ledde SI-pass. 5200 studenter vid universitetet deltog på passen under läsåret. Medelnärvaron var 23 % och 53% av studenter med tillgång till SI provade på att besöka åtminstone ett pass. Dessa siffror betyder att SI-verksamheten vid Lunds universitet är en av de största vid lärosäten i Europa (SI finns på 75+ högre lärosäten i Europa). SI-verksamheten följer också grundläggande SI-principer på ett bra sätt enligt deltagarna. Exempelvis på så sätt att deltagarna har ett stort inflytande över agendan på SI-passen och att arbetet med att förstå utmanande kursmaterial bedrivs genom arbete och diskussion i grupp. SI-ledaren ser till att arbetet gårframåt genom att ställa frågor och uppmuntrar deltagarna att dela med sig av sina kunskaper till varandra.Studenternas drivkraft att gå på SI-passen är i huvudsak meningsorienterad genom att de vill få en bättre förståelse av ämnet och för att det är roligt att diskutera kursinnehåll med kurskamrater. Vad ger då deltagande på SI för närvarande studenter? Jämförelser av närvaro på SI och genomströmning på SI-stödd kurs antyder att chanserna att klara kursen vid ordinarie examination(er) ökar med ökad SI-närvaro. Deltagande studenter upplever dessutom i stor utsträckning att SI leder till att de bättre förstår vad som förväntas av dem i kursen, är ett effektivt stöd att ta sig fram i kursen, ökar intresset för ämnet och ger dem en djupare förståelse av kursinnehållet. Dessutom anser en stor andel av deltagarna att de utvecklar generella färdigheter såsom problemlösning, kritiskt tänkande, lagarbete och presentation av akademiskt material införandra. En betydande del av SI-deltagarna anger att de åtminstone till viss del utvecklar sitt sätt att studera och förbättrar sitt akademiska självförtroende. Lite mer än en fjärdedel av de svarande på enkäten anser att SI varit viktigt för att skaffa studiekamrater, vilket kan vara mycket betydelsefullt för att känna tillhörighet inom akademien och ge ytterligare motivation till fortsatta högre studier.De dominerande svarsteman på öppna enkätfrågor rörande vad som är bäst med SI samt vad som skiljer SI-pass från ordinarie undervisning är desamma för bägge frågorna. Det handlar om att deltagarna uppskattar diskussionen/samarbetet samt atmosfären och arbetsmiljön på passen. Vidare gillar studenterna fokus på djupare förståelse av kursinnehållet. På frågan vad man tycker kan förbättras med SI-passen anser en del av deltagarna att strukturen på passet ibland kan vara tydligare och att arbetet under passen ibland kan kännas ineffektivt.Det är roligt att konstatera att de allra flesta SI-ledarna trivs i sin roll, känner sig nöjda med sitt jobb och upplever att de gör skillnad för sina deltagare, baserat på deras enkätsvar. Dessutom utvecklar de i hög grad i olika färdigheter som kommunikation, grupphantering och ledarskap.
|
|
| 8. |
- Middha, Pooja K., et al.
(författare)
-
A genome-wide gene-environment interaction study of breast cancer risk for women of European ancestry
- 2023
-
Ingår i: Breast Cancer Research. - : BioMed Central (BMC). - 1465-5411 .- 1465-542X. ; 25:1
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background Genome-wide studies of gene-environment interactions (GxE) may identify variants associated with disease risk in conjunction with lifestyle/environmental exposures. We conducted a genome-wide GxE analysis of similar to 7.6 million common variants and seven lifestyle/environmental risk factors for breast cancer risk overall and for estrogen receptor positive (ER +) breast cancer. Methods Analyses were conducted using 72,285 breast cancer cases and 80,354 controls of European ancestry from the Breast Cancer Association Consortium. Gene-environment interactions were evaluated using standard unconditional logistic regression models and likelihood ratio tests for breast cancer risk overall and for ER + breast cancer. Bayesian False Discovery Probability was employed to assess the noteworthiness of each SNP-risk factor pairs. Results Assuming a 1 x 10(-5) prior probability of a true association for each SNP-risk factor pairs and a Bayesian False Discovery Probability < 15%, we identified two independent SNP-risk factor pairs: rs80018847(9p13)-LINGO2 and adult height in association with overall breast cancer risk (ORint = 0.94, 95% CI 0.92-0.96), and rs4770552(13q12)-SPATA13 and age at menarche for ER + breast cancer risk (ORint = 0.91, 95% CI 0.88-0.94). Conclusions Overall, the contribution of GxE interactions to the heritability of breast cancer is very small. At the population level, multiplicative GxE interactions do not make an important contribution to risk prediction in breast cancer.
|
|
