Sökning: WFRF:(Bäcklin Christofer L.)
> (2013) >
Genome-wide signatu...
Genome-wide signatures of differential DNA methylation in pediatric acute lymphoblastic leukemia
-
- Nordlund, Jessica (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Bäcklin, Christofer L (författare)
- Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin
-
- Wahlberg, Per (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
visa fler...
-
Busche, Stephan (författare)
-
- Berglund, Eva C (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Eloranta, Maija-Leena (författare)
- Uppsala universitet,Reumatologi
-
Flaegstad, Trond (författare)
-
- Forestier, Erik (författare)
- Umeå universitet,Medicinsk och klinisk genetik
-
- Frost, Britt-Marie, 1955- (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för kvinnors och barns hälsa,Barnonkologisk forskning/Pfeifer
-
- Harila-Saari, Arja (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Heyman, Mats (författare)
- Karolinska Institutet
-
Jónsson, Olafur G (författare)
-
- Larsson, Rolf (författare)
- Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin
-
- Palle, Josefine (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Pediatrik,Barnonkologisk forskning/Pfeifer
-
- Rönnblom, Lars (författare)
- Uppsala universitet,Reumatologi
-
Schmiegelow, Kjeld (författare)
-
Sinnett, Daniel (författare)
-
- Söderhäll, Stefan (författare)
- Karolinska Institutet,Uppsala universitet,Pediatrik,Pediatric Oncology
-
Pastinen, Tomi (författare)
-
- Gustafsson, Mats G (författare)
- Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin
-
- Lönnerholm, Gudmar, 1941- (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för kvinnors och barns hälsa,Barnonkologisk forskning/Pfeifer
-
- Syvänen, Ann-Christine (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Springer Science and Business Media LLC, 2013
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: Genome Biology. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1465-6906 .- 1474-760X. ; 14:9, s. r105-
- Relaterad länk:
-
https://genomebiolog...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://umu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- BACKGROUND:Although aberrant DNA methylation has been observed previously in acute lymphoblastic leukemia (ALL), the patterns of differential methylation have not been comprehensively determined in all subtypes of ALL on a genome-wide scale. The relationship between DNA methylation, cytogenetic background, drug resistance and relapse in ALL is poorly understood.RESULTS:We surveyed the DNA methylation levels of 435,941 CpG sites in samples from 764 children at diagnosis of ALL and from 27 children at relapse. This survey uncovered four characteristic methylation signatures. First, compared with control blood cells, the methylomes of ALL cells shared 9,406 predominantly hypermethylated CpG sites, independent of cytogenetic background. Second, each cytogenetic subtype of ALL displayed a unique set of hyper- and hypomethylated CpG sites. The CpG sites that constituted these two signatures differed in their functional genomic enrichment to regions with marks of active or repressed chromatin. Third, we identified subtype-specific differential methylation in promoter and enhancer regions that were strongly correlated with gene expression. Fourth, a set of 6,612 CpG sites was predominantly hypermethylated in ALL cells at relapse, compared with matched samples at diagnosis. Analysis of relapse-free survival identified CpG sites with subtype-specific differential methylation that divided the patients into different risk groups, depending on their methylation status.CONCLUSIONS:Our results suggest an important biological role for DNA methylation in the differences between ALL subtypes and in their clinical outcome after treatment.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Pediatrik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Pediatrics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Nordlund, Jessic ...
-
Bäcklin, Christo ...
-
Wahlberg, Per
-
Busche, Stephan
-
Berglund, Eva C
-
Eloranta, Maija- ...
-
visa fler...
-
Flaegstad, Trond
-
Forestier, Erik
-
Frost, Britt-Mar ...
-
Harila-Saari, Ar ...
-
Heyman, Mats
-
Jónsson, Olafur ...
-
Larsson, Rolf
-
Palle, Josefine
-
Rönnblom, Lars
-
Schmiegelow, Kje ...
-
Sinnett, Daniel
-
Söderhäll, Stefa ...
-
Pastinen, Tomi
-
Gustafsson, Mats ...
-
Lönnerholm, Gudm ...
-
Syvänen, Ann-Chr ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Pediatrik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
- Artiklar i publikationen
-
Genome Biology
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet
-
Umeå universitet