| 1. |
- Bergström, David, 1994-, et al.
(författare)
-
Bayesian optimization for selecting training and validation data for supervised machine learning
- 2019
-
Ingår i: 31st annual workshop of the Swedish Artificial Intelligence Society (SAIS 2019), Umeå, Sweden, June 18-19, 2019..
-
Konferensbidrag (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Validation and verification of supervised machine learning models is becoming increasingly important as their complexity and range of applications grows. This paper describes an extension to Bayesian optimization which allows for selecting both training and validation data, in cases where data can be generated or calculated as a function of a spatial location.
|
|
| 2. |
- Bergström, Mattias, et al.
(författare)
-
Pulseless electrical activity is associated with improved survival in out-of-hospital cardiac arrest with initial non-shockable rhythm.
- 2018
-
Ingår i: Resuscitation. - : Elsevier BV. - 0300-9572 .- 1873-1570. ; 133, s. 147-152
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- OBJECTIVE: To describe the prevalence, baseline characteristics and factors associated with survival in out-of-hospital cardiac arrest (OHCA) with initial non-shockable rhythm sub-grouped into pulseless electrical activity (PEA) and asystole as presenting rhythm.METHODS: The Swedish Registry of Cardiopulmonary Resuscitation is a prospectively recorded nationwide registry of modified Utstein parameters, including all patients with attempted resuscitation after OHCA. Data between 1990-2016 were analyzed.RESULTS: After exclusions, the study population consisted of 48,707 patients presenting with either PEA or asystole. The proportion of PEA increased from 12% to 22% during the study period with a fivefold increase in 30-day survival reaching 4.9%. Survival in asystole showed a modest increase from 0.6% to 1.3%. In the multivariable analysis, PEA was independently associated with survival at 30 days (OR 1.54, 95% CI 1.26-1.88).CONCLUSION: Between 1990 and 2016, the proportion of PEA as the first recorded rhythm doubled with a five-fold increase in 30-day survival, while survival among patients with asystole remained at low levels. PEA and asystole should be considered separate entities in clinical decision-making and be reported separately in observational studies and clinical trials.
|
|
| 3. |
- Bergström, Per, 1981-, et al.
(författare)
-
Automatic in-line inspection of shape based on photogrammetry
- 2016
-
Ingår i: The 7th International Swedish Production Symposium, SPS16, Conference Proceedings. - Lund : Swedish Production Academy. ; , s. 1-9
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- We are describing a fully automatic in-line shape inspection system for controlling the shape of moving objects on a conveyor belt. The shapes of the objects are measured using a full-field optical shape measurement method based on photogrammetry. The photogrammetry system consists of four cameras, a flash, and a triggering device. When an object to be measured arrives at a given position relative to the system, the flash and cameras are synchronously triggered to capture images of the moving object.From the captured images a point-cloud representing the measured shape is created. The point-cloud is then aligned to a CAD-model, which defines the nominal shape of the measured object, using a best-fit method and a feature-based alignment method. Deviations between the point-cloud and the CAD-model are computed giving the output of the inspection process. The computational time to create a point-cloud from the captured images is about 30 seconds and the computational time for the comparison with the CAD-model is about ten milliseconds. We report on recent progress with the shape inspection system.
|
|
| 4. |
- Bergström, Ulf, et al.
(författare)
-
Ekologiska effekter av fiskefria områden i Sveriges kust- och havsområden
- 2016
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Denna rapport beskriver de ekologiska effekterna av fiskefria områden i svenska kust- och havsområden. År 2005 fick dåvarande Fiskeriverket, numera Havs- och vattenmyndigheten, i uppdrag att införa och utvärdera effekterna av fiskefria områden. Fem fiskefria områden bildades 2009-2011 och utvecklingen av fiskbestånd, i vissa fall även andra delar av ekosystemen, har följts till och med 2015. Rapporten fokuserar på de delar av regeringsuppdraget som syftar till att utvärdera de biologiska effekterna av fiskefria områden samt att bedöma fiskets påverkan på fiskbestånd och ekosystem. När områdena inrättats 2011 utgjorde de svenska fiskefria områdena, inklusive de som fanns sedan tidigare, nästan 1200 km2. Detta motsvarar mindre än 1 % av de svenska havsområdena, men samtidigt två tredjedelar av den totala ytan fiskefria områden i hela Europa. Detta innebär att det svenska arbetet med utvärderingar av fiskefria områden är av stort intresse även internationellt sett. De områden och målarter som ingått i utvärderingen är: · Sik i Bottenhavet · Gös, gädda och abborre i Stockholms skärgård · Torsk i Kattegatt · Hummer och rovfisk i Göteborgs skärgård · Torsk, piggvar och rödspotta i fjordsystemet innanför Orust och Tjörn Effekterna av dessa fiskefria områden beskrivs detaljerat i varsin delrapport. Generellt har en tydlig återhämtning hos målarterna skett. Antalet individer och storleken på fisken har ökat i de fiskefria områdena i förhållande till referensområden där fiske fortsatt varit tillåtet. Resultaten visar att fisket på de aktuella bestånden tidigare varit av sådan omfattning att det påverkat både beståndsstorlek och storleksstruktur. De positiva effekterna ses både för bestånd där yrkesfisket stått för merparten av fångsterna, exempelvis torsk i Kattegatt, och för kustarter där fritidsfisket dominerat fångsterna, som till exempel sik i Bottenhavet, gös i Stockholms skärgård och hummer i Göteborgs skärgård. Trots den korta utvärderingsperioden på ca 5 år har alltså bestånden svarat med tydliga ökningar, vilket visar att fiskefria områden är en effektiv åtgärd för att snabbt stärka försvagade bestånd. I ett av de undersökta områdena, Havstensfjorden, har däremot inga positiva effekter kunnat påvisas hittills. Sannolikt har de lokala bestånden av främst torsk och rödspotta i detta område befunnit sig på en så låg nivå före fredningen att de varit rekryteringsöverfiskade. Det kan därmed ta lång tid för dessa bestånd att återhämta sig. Även effekter på fisksamhällena som helhet och på bottenfauna har kunnat konstateras i de fiskefria områden där dessa delar av ekosystemet undersökts. Troligen beror förändringarna på en kombination av direkta effekter på målarterna och bifångstarter genom att fisket upphört, samt på indirekta effekter genom en ökad predation från stor rovfisk och hummer på bytesarter. Genom att mängden rovfiskar ökar bidrar fiskefria områden till att återställa ekosystemfunktioner, och kan exempelvis motverka massförekomster av snabbväxande alger, och de problem dessa förorsakar, genom så kallade trofiska kaskader. Ytterligare en effekt av fiskeförbud är att den fysiska störningen av bottendjurssamhällen från bottentrålning minskar och att arter som är känsliga för fysisk påverkan därmed gynnas. I de flesta fall har införandet av de fiskefria områdena sannolikt lett till ett minskat fiske snarare än en förflyttning av fisket till angränsande områden. I Kattegatt var syftet med det fiskefria området och buffertzonerna att flytta det oselektiva blandfisket med bottentrål efter havskräfta och plattfisk till områden där risken att fånga vuxen lekmogen torsk var lägre. Blandfiskena efter havskräfta och plattfisk har kunnat ta upp sina kvoter och kunnat fortgå i buffertområdena efter lekperioden och utanför det fiskefria området, men nu med minskade oavsiktliga fångster av vuxen torsk. I rapporten sammanfattas även det internationella kunskapsläget angående fiskefria områden, liksom resultaten från fyra tidigare studerade svenska fiskefria områden. Effekterna i de tidigare undersökta svenska områdena överensstämmer i stort med de som påvisats i de nu aktuella studierna, med positiva effekter på beståndstäthet och storleksstruktur samt en påföljande ökning i reproduktionspotential. Resultaten är även i linje med internationella studier när det gäller effekter på fiskbestånd. För de svenska fiskefria områdena råder däremot brist på direkta studier av ekosystemeffekter av stängningarna. Det finns emellertid kunskap från andra forskningsprojekt i svenska vatten som visar på kopplingen mellan rovfiskbestånd och ekosystemens funktion, framför allt genom trofiska kaskader. Nettoeffekterna av fiskefria områden för fisket är ofta svåra att bedöma. I och med att fiskarna blir fler och större inom de fiskefria områdena ökar även reproduktionen, vilket kan ge positiva effekter på bestånden utanför de stängda områdena genom export av ägg och larver och migration av äldre fisk. Storleken på sådana spilleffekter är dock svår att mäta. Även om exporten av fisk från fiskefria områden inte alltid kan uppväga förlusten av fiskeområden för fisket, så kan de bidra med andra positiva effekter. Genom att en del av fiskbestånden undantas från fiske minskas risken för beståndskollaps till följd av i övrigt otillräckliga åtgärder inom fiskförvaltningen, och de fiskefria områdena fungerar därmed som en försäkring. Samtidigt kan fiskefria områden motverka den genetiska utarmning som kan ske genom ett selektivt fiske på snabbväxande och storvuxna individer, vilket på sikt annars kan leda till en minskad fiskresurs, liksom en lägre biologisk variation och resiliens mot andra förändringar i miljön. I Kattegatt har nettoeffekten av åtgärderna kunnat mätas. Effekten är positiv på beståndet som helhet, eftersom torsken visar tecken på återhämtning i hela havsområdet. Det fiskefria området har inte begränsat fångstuttaget av andra kvoterade arter än torsk. På sikt ger återhämtningen förutsättningar för ett ökat fiske av torsk, eftersom beståndet sprider sig utanför det fiskefria området efter lekperioden. Fiskefria områden kan om de är väl utformade ge positiva beståndseffekter och därmed komplettera andra regleringar inom fiskförvaltningen. I många fall kan goda resultat uppnås med mindre drastiska åtgärder, exempelvis genom redskaps- eller fångstbegränsningar i tid och rum. Denna utvärdering visar att fiskefria områden kan vara viktiga för förvaltning i synnerhet av blandfisken och fisken på lokala kustbestånd, samt för att motverka negativa effekter på ekosystemet av fiske. Marina skyddade områden där skydd av både fisk och deras livsmiljöer kombineras, är därför ett viktigt instrument för en ekosystembaserad förvaltning. Inom havsmiljöarbetet behövs fiskefria områden också som referensområden för att kunna sätta mål för den ekologiska statusen i kust- och havsmiljö och för att bättre förstå fiskets effekter på bestånd och ekosystem i relation till andra påverkansfaktorer.
|
|
| 5. |
- Ekblom, Örjan, 1971-, et al.
(författare)
-
Cardiorespiratory Fitness, Sedentary Behaviour and Physical Activity Are Independently Associated with the Metabolic Syndrome, Results from the SCAPIS Pilot Study
- 2015
-
Ingår i: Plos One. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 10:6
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background Previous studies on the relation between lifestyle and the metabolic syndrome lack one or several aspects of the physical activity pattern in the analyses or cardiorespiratory fitness. Likewise, both uni- and triaxial accelerometry have been used, though, the predictive validity of these two modes has not been compared. The aims of the present study were firstly to investigate the independent relation between cardiorespiratory fitness and physical activity pattern to the metabolic syndrome (MetS) and secondly to examine the predictive validity of uni- and triaxial accelerometry, respectively. Data was extracted from the SCAPIS pilot study (n=930, mean age 57.7 yrs). Physical activity pattern was assessed by accelerometry. Cardiorespiratory fitness was estimated using cycle ergometry. MetS was defined per the Adult Treatment Panel III from the National Cholesterol Education Program definition. Time spent sedentary (OR: 2.38, 95% CI: 1.54-4.24 for T3 vs T1), in light intensity (OR: 0.50, 95% CI: 0.28-0.90) and in moderate-to-vigorous activity (OR: 0.33, 95% CI: 0.18-0.61), as well as cardiorespiratory fitness (OR: 0.24, 95% CI: 0.12-0.48), were all independently related to the prevalence of MetS after adjustment for potential confounders, fitness and/or the other aspects of the physical activity pattern. In addition, we found that triaxial analyses were more discriminant, with ORs farther away from the reference group and additional significant ORs. The finding that several aspects of the physical activity pattern reveal independent relations to the MetS makes new possible targets for behaviour change of interest, focusing on both exercise and everyday life. When assessing the risk status of a patient, it is advised that triaxial accelerometry is used.
|
|
| 6. |
- Mardinoglu, Adil, 1982, et al.
(författare)
-
An Integrated Understanding of the Rapid Metabolic Benefits of a Carbohydrate-Restricted Diet on Hepatic Steatosis in Humans
- 2018
-
Ingår i: Cell Metabolism. - : Elsevier BV. - 1550-4131 .- 1932-7420. ; 27:3
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- A carbohydrate-restricted diet is a widely recommended intervention for non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD), but a systematic perspective on the multiple benefits of this diet is lacking. Here, we performed a short-term intervention with an isocaloric low-carbohydrate diet with increased protein content in obese subjects with NAFLD and characterized the resulting alterations in metabolism and the gut microbiota using a multi-omics approach. We observed rapid and dramatic reductions of liver fat and other cardiometabolic risk factors paralleled by (1) marked decreases in hepatic de novo lipogenesis; (2) large increases in serum beta-hydroxybutyrate concentrations, reflecting increased mitochondrial beta-oxidation; and (3) rapid increases in folate-producing Streptococcus and serum folate concentrations. Liver transcriptomic analysis on biopsy samples from a second cohort revealed downregulation of the fatty acid synthesis pathway and upregulation of folate-mediated one-carbon metabolism and fatty acid oxidation pathways. Our results highlight the potential of exploring diet-microbiota interactions for treating NAFLD.
|
|
| 7. |
- McFiggans, Gordon, et al.
(författare)
-
Secondary organic aerosol reduced by mixture of atmospheric vapours
- 2019
-
Ingår i: Nature. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0028-0836 .- 1476-4687. ; 565:7741, s. 587-593
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Secondary organic aerosol contributes to the atmospheric particle burden with implications for air quality and climate. Biogenic volatile organic compounds such as terpenoids emitted from plants are important secondary organic aerosol precursors with isoprene dominating the emissions of biogenic volatile organic compounds globally. However, the particle mass from isoprene oxidation is generally modest compared to that of other terpenoids. Here we show that isoprene, carbon monoxide and methane can each suppress the instantaneous mass and the overall mass yield derived from monoterpenes in mixtures of atmospheric vapours. We find that isoprene 'scavenges' hydroxyl radicals, preventing their reaction with monoterpenes, and the resulting isoprene peroxy radicals scavenge highly oxygenated monoterpene products. These effects reduce the yield of low-volatility products that would otherwise form secondary organic aerosol. Global model calculations indicate that oxidant and product scavenging can operate effectively in the real atmosphere. Thus highly reactive compounds (such as isoprene) that produce a modest amount of aerosol are not necessarily net producers of secondary organic particle mass and their oxidation in mixtures of atmospheric vapours can suppress both particle number and mass of secondary organic aerosol. We suggest that formation mechanisms of secondary organic aerosol in the atmosphere need to be considered more realistically, accounting for mechanistic interactions between the products of oxidizing precursor molecules (as is recognized to be necessary when modelling ozone production).
|
|
| 8. |
- Moksnes, Per-Olav, et al.
(författare)
-
Fritidsbåtars påverkan på grunda kustekosystem i sverige
- 2019
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Sveriges natursköna kust med vidsträckta skärgårdar erbjuder fantastiska förhållanden för fritidsbåtliv. Idag finns uppskattningsvis mer än 700 000 fritidsbåtar i Sverige, vilket är en av de högsta siffrorna i världen sett till befolkningsmängden. Kustens vågskyddade skärgård ger också goda förutsättningar att förvara fritidsbåtar vid bryggor, och idag täcks stora områden av bryggor och småbåtshamnar. Det stora antalet båtar och bryggor kan ge betydande effekter på miljön, men kunskapen om fritidsbåtlivets sammanlagda påverkan på Sveriges kustmiljöer har hittills varit bristfällig. Havsmiljöinstitutets mål med denna rapport har varit att sammanställa kunskapsläget kring hur fritidsbåtar påverkar grunda kustekosystem i Sverige, samt bedöma omfattningen av denna påverkan och om utveckling är hållbar. Syftet med rapporten är att bidra till utvecklingen av en mer hållbar förvaltning av fritidsbåtlivet genom att sammanställa vetenskaplig kunskap inom detta område på ett lättillgängligt sätt. Sammanställningen visar att det finns ett starkt stöd i den vetenskapliga litteraturen för att fritidsbåtar ger upphov till många negativa effekter på kustmiljön. Med fritidsbåtslivet följer en rad olika fysiska strukturer och aktiviteter som var och en ger upphov till flera olika typer av miljöpåverkan. En ökad utbredning av småbåtshamnar, bryggor och muddrade områden medför förluster av viktiga bottenmiljöer och leder ofta till en långvarig försämring av miljöförhållanden lokalt. Muddrings- och dumpningsaktiviteter leder till ökad uppgrumling och spridning av sediment, näringsämnen och miljögifter över stora områden, vilket bland annat påverkar bottenvegetation, fiskar och musslor negativt. Båttrafik och ankring leder till uppgrumling och erosion av sediment samt till skador på bottenmiljön. Undervattensbuller från båtarnas motorer stör också fiskar och däggdjur. Vidare medför användning av fritidsbåtar betydande utsläpp av giftiga ämnen och föroreningar från båtbottenfärger och förbränningsmotorer. Drygt 60 % av alla bryggor och småbåtshamnar återfinns i grunda (<3 m), vågskyddade områden med mjukbottnar, trots att de endast utgör en fjärdedel av kustens totala grundområden. Dessa områden lämpar sig väl för båtförvaring, men är också en av kustens mest produktiva och värdefulla miljöer. Grunda mjukbottnar är en viktig miljö för olika kärlväxter och kransalger, som i sin tur utgör viktiga uppväxthabitat för många olika fiskarter och kräftdjur. Rapporten visar att dessa miljöer är extra känsliga för en majoritet av de störningar som fritidsbåtlivet ger upphov till. Sammantaget medför detta att fritidsbåtslivet i förhållande till sin omfattning genererar stora skador på miljöer med höga naturvärden.
|
|
| 9. |
- Moksnes, Per-Olav, et al.
(författare)
-
Fritidsbåtars påverkan på grunda kustekosystem i Sverige
- 2019
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Sweden has a long and beautiful coastline with extensive archipelagos that offer exceptional conditions for recreational boating. There are more than 700 000 recreational boats in Sweden, which is one of the highest numbers in the world in relation to the population size. Small tidal differences and many sheltered bays also provide good conditions for storing boats at docks and piers and jetties. As a result, large areas of the Swedish coast are today covered with docks and marinas for recreational boats. The large number of boats and docks could have substantial negative effects on the environment. However, the understanding of the cumulative impact of recreational boating on Swedish coastal ecosystem has so far been incomplete. The goal with this report from the Swedish Institute for the Marine Environment has been to compile and summarize the present state of knowledge regarding how recreational boating affect shallow coastal ecosystems in Sweden, to determine the extent of the impact and if the development is sustainable. The aim has been to present scientific knowledge on these topics in an accessible way in order to facilitate the development of a more sustainable management of recreational boating in Sweden.The scientific literature strongly support that recreational boating generates many negative effects on the marine environment. Recreational boating requires a number of physical structures and generate a number activities that each results in several different pressures on the environment. An increased number of marinas, docks and dredged canals results in losses of important habitats, as well as long-term deterioration of the environmental conditions locally. Dredging and dumping of dredge material results in increased turbidity and dispersal of sediment, nutrients and pollutants over large areas with negative effects on many aquatic organisms, e.g. vegetation, fishes and mussels. Traffic from recreational boats and anchoring result in increased turbidity and sediment erosion as well as damage to habitats. Motor boats also create underwater noise that can disturb e.g. fishes, seals and porpoises. In addition, recreational boating result in substantial emissions of toxic substances and pollution from e.g. antifouling paint and combustion engines.More than 60% of all docks and marinas are found in wave sheltered, shallow (<3 m) areas with soft bottoms, despite that this environment only constitute 25% of shallow coastal areas in Sweden. These sheltered areas are well suited for storing boats, but also constitute one of the most productive and valuable environments along the coast. They are important environments for vegetation such as seagrass, pondweed and stoneworts, which in turn constitute important spawning and nursery areas for a large number of fish and invertebrates. The report shows that these shallow soft bottom environments are very sensitive to a majority of the stressors that recreational boating generate. Boating therefore create a disproportionally large impact on environments with high values.Although the impact from a single recreational boat or dock is limited, the cumulative effect is substantial because of the sheer number. According to recent inventories, there are today almost 110 000 docks along the Swedish coast covering almost 2 000 km of bottom. In comparison with the 1960s, the amount of docks has increased with almost 160%, which today constitutes an increase of 1 700 new docks per year. Recent studies show that vegetation is degraded as the number of docks and boats increase within shallow, wave sheltered areas. It is estimated that almost 20% of this important environment is negatively affected by recreational boating today; in the County of Stockholm and Västra Götaland around 30% of shallow, wave sheltered areas are estimated to be impacted. Despite several management measures in the last decades to decrease coastal exploitation, there are no signs that the rate of exploitation is decreasing.The large number of recreational boats with combustion engines, the trend of increasing engine size, and the fact that engines lack all forms of emission control result in substantial emissions of pollutants and greenhouse gases. Recent estimates suggest that the emissions from recreational boats are very high and comparable with other types of transport in Sweden. Emission of toxic copper from antifouling paint on recreational boats is also substantial and contributes to the high levels of copper in coastal waters, which is above the limit for good ecological status in 85% of the assessed coastal water bodies.Although most boat owners likely spend time at sea because they enjoy and care about the environment, the results presented in this report show that recreational boating have a substantial negative impact on the coastal environment, particularly in shallow, wave protected areas. In these areas, today’s use and development of recreational boating cannot be considered sustainable. However, the report also shows that there are ways to decrease the environmental impact from recreational boating. By changing the way we use and store recreational boats, and by improving management we can still allow coming generations to enjoy unexploited coastal environments with clear water and a rich plant and animal life.The report ends by discussing new, possible measures and solutions for a more sustainable use of recreational boats in Sweden, which could be a starting point for continuing such work. These include e.g. to identify vulnerable coastal environments in order to steer away exploitation and recreational boat traffic from these areas. By storing boats on land, the need for docks, dredging and toxic antifouling paint could decrease. Reduced speed limits and access limitations for recreational motorboats in certain areas could decrease negative impact on the most vulnerable habitats. Finally, new, environmentally friendly technology, and new financial instruments could be used to decrease negative impacts and create a more sustainable development of recreational boating.
|
|
| 10. |
- Navarro, Julien R. G., et al.
(författare)
-
Multicolor Fluorescent Labeling of Cellulose Nanofibrils by Click Chemistry
- 2015
-
Ingår i: Biomacromolecules. - : American Chemical Society. - 1525-7797 .- 1526-4602. ; 16:4, s. 1293-1300
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- (Figure Presented) We have chemically modified cellulose nanofibrils (CNF) with furan and maleimide groups, and selectively labeled the modified CNF with fluorescent probes; 7-mercapto-4-methylcoumarin and fluorescein diacetate 5-maleimide, through two specific click chemistry reactions: Diels-Alder cycloaddition and the thiol-Michael reaction. Characterization by solid-state 13C NMR and infrared spectroscopy was used to follow the surface modification and estimate the substitution degrees. We demonstrate that the two luminescent dyes could be selectively labeled onto CNF, yielding a multicolor CNF that was characterized by UV/visible and fluorescence spectroscopies. It was demonstrated that the multicolor CNF could be imaged using a confocal laser scanning microscope.
|
|
