Sökning: WFRF:(Farris Alton Brad III) >
Landscape of somati...
Landscape of somatic single nucleotide variants and indels in colorectal cancer and impact on survival
-
Zaidi, Syed H. (författare)
-
Harrison, Tabitha A. (författare)
-
Phipps, Amanda I. (författare)
-
visa fler...
-
Steinfelder, Robert (författare)
-
Trinh, Quang M. (författare)
-
Qu, Conghui (författare)
-
Banbury, Barbara L. (författare)
-
Georgeson, Peter (författare)
-
Grasso, Catherine S. (författare)
-
Giannakis, Marios (författare)
-
Adams, Jeremy B. (författare)
-
Alwers, Elizabeth (författare)
-
Amitay, Efrat L. (författare)
-
Barfield, Richard T. (författare)
-
Berndt, Sonja, I (författare)
-
Borozan, Ivan (författare)
-
Brenner, Hermann (författare)
-
Brezina, Stefanie (författare)
-
Buchanan, Daniel D. (författare)
-
Cao, Yin (författare)
-
Chan, Andrew T. (författare)
-
Chang-Claude, Jenny (författare)
-
Connolly, Charles M. (författare)
-
Drew, David A. (författare)
-
Farris, Alton Brad, III (författare)
-
Figueiredo, Jane C. (författare)
-
French, Amy J. (författare)
-
Fuchs, Charles S. (författare)
-
Garraway, Levi A. (författare)
-
Gruber, Steve (författare)
-
Guinter, Mark A. (författare)
-
Hamilton, Stanley R. (författare)
-
- Harlid, Sophia, 1978- (författare)
- Umeå universitet,Onkologi
-
Heisler, Lawrence E. (författare)
-
Hidaka, Akihisa (författare)
-
Hopper, John L. (författare)
-
Huang, Wen-Yi (författare)
-
Huyghe, Jeroen R. (författare)
-
Jenkins, Mark A. (författare)
-
Krzyzanowski, Paul M. (författare)
-
Lemire, Mathieu (författare)
-
Lin, Yi (författare)
-
Luo, Xuemei (författare)
-
Mardis, Elaine R. (författare)
-
McPherson, John D. (författare)
-
Miller, Jessica K. (författare)
-
Moreno, Victor (författare)
-
Mu, Xinmeng Jasmine (författare)
-
Nishihara, Reiko (författare)
-
Papadopoulos, Nickolas (författare)
-
Pasternack, Danielle (författare)
-
Quist, Michael J. (författare)
-
Rafikova, Adilya (författare)
-
Reid, Emma E. G. (författare)
-
Shinbrot, Eve (författare)
-
Shirts, Brian H. (författare)
-
Stein, Lincoln D. (författare)
-
Teney, Cherie D. (författare)
-
Timms, Lee (författare)
-
Um, Caroline Y. (författare)
-
- van Guelpen, Bethany (författare)
- Umeå universitet,Onkologi,Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM)
-
Van Tassel, Megan (författare)
-
Wang, Xiaolong (författare)
-
Wheeler, David A. (författare)
-
Yung, Christina K. (författare)
-
Hsu, Li (författare)
-
Ogino, Shuji (författare)
-
Gsur, Andrea (författare)
-
Newcomb, Polly A. (författare)
-
Gallinger, Steven (författare)
-
Hoffmeister, Michael (författare)
-
Campbell, Peter T. (författare)
-
Thibodeau, Stephen N. (författare)
-
Sun, Wei (författare)
-
Hudson, Thomas J. (författare)
-
Peters, Ulrike (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2020-07-20
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Communications. - : Nature Publishing Group. - 2041-1723. ; 11:1
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://umu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://www.nature.c...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Colorectal cancer (CRC) is a biologically heterogeneous disease. To characterize its mutational profile, we conduct targeted sequencing of 205 genes for 2,105 CRC cases with survival data. Our data shows several findings in addition to enhancing the existing knowledge of CRC. We identify PRKCI, SPZ1, MUTYH, MAP2K4, FETUB, and TGFBR2 as additional genes significantly mutated in CRC. We find that among hypermutated tumors, an increased mutation burden is associated with improved CRC-specific survival (HR=0.42, 95% CI: 0.21-0.82). Mutations in TP53 are associated with poorer CRC-specific survival, which is most pronounced in cases carrying TP53 mutations with predicted 0% transcriptional activity (HR=1.53, 95% CI: 1.21-1.94). Furthermore, we observe differences in mutational frequency of several genes and pathways by tumor location, stage, and sex. Overall, this large study provides deep insights into somatic mutations in CRC, and their potential relationships with survival and tumor features. Large scale sequencing study is of paramount importance to unravel the heterogeneity of colorectal cancer. Here, the authors sequenced 205 cancer genes in more than 2000 tumours and identified additional mutated driver genes, determined that mutational burden and specific mutations in TP53 are associated with survival odds.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Zaidi, Syed H.
-
Harrison, Tabith ...
-
Phipps, Amanda I ...
-
Steinfelder, Rob ...
-
Trinh, Quang M.
-
Qu, Conghui
-
visa fler...
-
Banbury, Barbara ...
-
Georgeson, Peter
-
Grasso, Catherin ...
-
Giannakis, Mario ...
-
Adams, Jeremy B.
-
Alwers, Elizabet ...
-
Amitay, Efrat L.
-
Barfield, Richar ...
-
Berndt, Sonja, I
-
Borozan, Ivan
-
Brenner, Hermann
-
Brezina, Stefani ...
-
Buchanan, Daniel ...
-
Cao, Yin
-
Chan, Andrew T.
-
Chang-Claude, Je ...
-
Connolly, Charle ...
-
Drew, David A.
-
Farris, Alton Br ...
-
Figueiredo, Jane ...
-
French, Amy J.
-
Fuchs, Charles S ...
-
Garraway, Levi A ...
-
Gruber, Steve
-
Guinter, Mark A.
-
Hamilton, Stanle ...
-
Harlid, Sophia, ...
-
Heisler, Lawrenc ...
-
Hidaka, Akihisa
-
Hopper, John L.
-
Huang, Wen-Yi
-
Huyghe, Jeroen R ...
-
Jenkins, Mark A.
-
Krzyzanowski, Pa ...
-
Lemire, Mathieu
-
Lin, Yi
-
Luo, Xuemei
-
Mardis, Elaine R ...
-
McPherson, John ...
-
Miller, Jessica ...
-
Moreno, Victor
-
Mu, Xinmeng Jasm ...
-
Nishihara, Reiko
-
Papadopoulos, Ni ...
-
Pasternack, Dani ...
-
Quist, Michael J ...
-
Rafikova, Adilya
-
Reid, Emma E. G.
-
Shinbrot, Eve
-
Shirts, Brian H.
-
Stein, Lincoln D ...
-
Teney, Cherie D.
-
Timms, Lee
-
Um, Caroline Y.
-
van Guelpen, Bet ...
-
Van Tassel, Mega ...
-
Wang, Xiaolong
-
Wheeler, David A ...
-
Yung, Christina ...
-
Hsu, Li
-
Ogino, Shuji
-
Gsur, Andrea
-
Newcomb, Polly A ...
-
Gallinger, Steve ...
-
Hoffmeister, Mic ...
-
Campbell, Peter ...
-
Thibodeau, Steph ...
-
Sun, Wei
-
Hudson, Thomas J ...
-
Peters, Ulrike
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Umeå universitet