SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Ji Xinyu)
 

Sökning: WFRF:(Ji Xinyu) > (2022) > Epigenome-wide thre...

Epigenome-wide three-way interaction study identifies a complex pattern between TRIM27, KIAA0226, and smoking associated with overall survival of early-stage NSCLC

Ji, Xinyu (författare)
Nanjing Medical University
Lin, Lijuan (författare)
Nanjing Medical University
Fan, Juanjuan (författare)
Nanjing Medical University
visa fler...
Li, Yi (författare)
University of Michigan
Wei, Yongyue (författare)
Harvard University,Nanjing Medical University
Shen, Sipeng (författare)
Nanjing Medical University
Su, Li (författare)
Harvard University
Shafer, Andrea (författare)
Massachusetts General Hospital
Bjaanæs, Maria Moksnes (författare)
Oslo university hospital
Karlsson, Anna (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Department of Clinical Sciences, Lund
Planck, Maria (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Department of Clinical Sciences, Lund
Staaf, Johan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Department of Clinical Sciences, Lund
Helland, Åslaug (författare)
Oslo university hospital,University of Oslo
Esteller, Manel (författare)
Catalan Institution for Research and Advanced Studies,University of Barcelona,Spanish Center for Biomedical Research Network in Oncology (CIBERONC),Josep Carreras Leukaemia Research Institute (IJC)
Zhang, Ruyang (författare)
Nanjing Medical University,Harvard University
Chen, Feng (författare)
Nanjing Medical University
Christiani, David C. (författare)
Massachusetts General Hospital,Harvard University
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2022-01-07
2022
Engelska 15 s.
Ingår i: Molecular Oncology. - : Wiley. - 1574-7891 .- 1878-0261. ; 16:3, s. 717-731
Relaterad länk:
http://dx.doi.org/10... (free)
visa fler...
https://doi.org/10.1...
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The interaction between DNA methylation of tripartite motif containing 27 (cg05293407TRIM27) and smoking has previously been identified to reveal histologically heterogeneous effects of TRIM27 DNA methylation on early-stage non-small-cell lung cancer (NSCLC) survival. However, to understand the complex mechanisms underlying NSCLC progression, we searched three-way interactions. A two-phase study was adopted to identify three-way interactions in the form of pack-year of smoking (number of cigarettes smoked per day × number of years smoked) × cg05293407TRIM27 × epigenome-wide DNA methylation CpG probe. Two CpG probes were identified with FDR-q ≤ 0.05 in the discovery phase and P ≤ 0.05 in the validation phase: cg00060500KIAA0226 and cg17479956EXT2. Compared to a prediction model with only clinical information, the model added 42 significant three-way interactions using a looser criterion (discovery: FDR-q ≤ 0.10, validation: P ≤ 0.05) had substantially improved the area under the receiver operating characteristic curve (AUC) of the prognostic prediction model for both 3-year and 5-year survival. Our research identified the complex interaction effects among multiple environment and epigenetic factors, and provided therapeutic target for NSCLC patients.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy