| 1. |
|
|
| 2. |
- Amortegui, Julio Cesar Espana, et al.
(författare)
-
LC-MS/MS Analysis of Cyanotoxins in Bivalve Mollusks : Method Development, Validation and First Evidence of Occurrence of Nodularin in Mussels (Mytilus edulis) and Oysters (Magallana gigas) from the West Coast of Sweden
- 2023
-
Ingår i: Toxins. - : MDPI. - 2072-6651. ; 15:5
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- In this paper, an LC-MS/MS method for the simultaneous identification and quantification of cyanotoxins with hydrophilic and lipophilic properties in edible bivalves is presented. The method includes 17 cyanotoxins comprising 13 microcystins (MCs), nodularin (NOD), anatoxin-a (ATX-a), homoanatoxin (h-ATX) and cylindrospermopsin (CYN). A benefit to the presented method is the possibility for the MS detection of MC-LR-[Dha7] and MC-LR-[Asp3] as separately identified and MS-resolved MRM signals, two congeners which were earlier detected together. The performance of the method was evaluated by in-house validation using spiked mussel samples in the quantification range of 3.12-200 mu g/kg. The method was found to be linear over the full calibration range for all included cyanotoxins except CYN for which a quadratic regression was used. The method showed limitations for MC-LF (R-2 = 0.94), MC-LA (R-2 <= 0.98) and MC-LW (R-2 <= 0.98). The recoveries for ATX-a, h-ATX, CYN, NOD, MC-LF and MC-LW were lower than desired (<70%), but stable. Despite the given limitations, the validation results showed that the method was specific and robust for the investigated parameters. The results demonstrate the suitability of the method to be applied as a reliable monitoring tool for the presented group of cyanotoxins, as well as highlight the compromises that need to be included if multi-toxin methods are to be used for the analysis of cyanotoxins with a broader range of chemical properties. Furthermore, the method was used to analyze 13 samples of mussels (Mytilus edulis) and oysters (Magallana gigas) collected in the 2020-2022 summers along the coast of Bohuslan (Sweden). A complementary qualitative analysis for the presence of cyanotoxins in phytoplankton samples collected from marine waters around southern Sweden was performed with the method. Nodularin was identified in all samples and quantified in bivalve samples in the range of 7-397 <= g/kg. Toxins produced by cyanobacteria are not included in the European Union regulatory monitoring of bivalves; thus, the results presented in this study can be useful in providing the basis for future work including cyanotoxins within the frame of regulatory monitoring to increase seafood safety.
|
|
| 3. |
- Andersson, Agneta, et al.
(författare)
-
DNA-streckkodning av marina växtplankton : Ett nytt verktyg i miljöövervakningen
- 2024
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Växtplankton utgör grunden i den marina näringsväven och används världen över för att bestämma miljöstatus i hav och sjöar. De ingår exempelvis som en kvalitetsfaktor i EU:s vattendirektiv och havsmiljödirektiv. Det finns långa tidsserier av växtplanktonövervakning där analyserna utförts med mikroskopi. Det sker nu en snabb internationell utveckling av DNA-metoder för att övervaka växtplankton. Målsättningen med detta projekt var att utveckla en praktisk och robust DNA analysmetod som kan implementeras i svensk marin miljöövervakning. Vårt tillvägagångssätt var att följa med på ordinarie marina miljöövervakningsexpeditioner under ett års tid (2019–2020) och ta parallella havsvattenprov för så kallad DNA-streckkodning av växtplankton. Sammanlagt tog vi prov vid 19 övervakningsstationer som var spridda från Bottenviken i norr till Skagerrak i söder. Provtagningsfrekvensen var cirka 1 gång per månad. Praktiska metoder utarbetades för fältprovtagning, DNA-extraktion, sekvensering, bioinformatisk analys och taxonomisk annotering. Vi har även tagit fram system för datahantering hos nationell datavärd och gett förslag på en ny datatyp för nationellt datavärdskap för marinbiologi och oceanografi vid Svenskt Oceanografiskt Datacentrum (https://sharkweb. smhi.se/hamta-data/). En viktig del har varit att jämföra resultaten av DNA-streckkodning och mikroskopi. Resultaten visar att DNA-streckkodning ger ungefär dubbelt så högt biodiversitetsmått än mikroskopering, även om det skiljer sig åt mellan olika grupper av växtplankton. För att undersöka om DNA-streckkodning kan användas för kvantitativ analys tillsatte vi en intern standard till proverna bestående av syntetiskt DNA, men eftersom resultatet varierade så behöver man arbeta vidare med detta. Den relativa fördelningen av vanliga eukaryota växtplanktongrupper visade sig ha relativt bra överensstämmelse mellan DNA-streckkodning och mikroskopimåttet kolbiomassa, medan biovolym och abundans skiljde sig åt mer. DNA-streckkodning visade sig ge detaljerade utbredningsmönster av skadliga alger, till exempel för släktet Prymnesium bland häftalgerna (Coccolithophyceae). Vi har inom projektet kunnat utvärdera ekologiska drivkrafter för växtplanktonsamhällets diversitet och artsammansättning, genom att miljöövervakningen mäter många fysikalisk-kemiska parametrar. Både salthalt och närsalter visade sig ha stor inverkan på växtplanktonsamhällets sammansättning och diversitet. Sammanfattningsvis ser vi att den framtagna DNA-streckkodningsmetoden skulle vara ett bra komplement till den etablerade växtplanktonövervakningen.
|
|
| 4. |
- Andersson, Agneta, et al.
(författare)
-
DNA-streckkodning kompletterar traditionell planktonanalys
- 2020
-
Ingår i: Sveriges vattenmiljö - Kunskapsbank. - Göteborg : Havsmiljöinstitutet.
-
Forskningsöversikt (populärvet., debatt m.m.)abstract
- Att filtrera några deciliter havsvatten och analysera DNA-innehållet ger snabbt svaret på vilka växtplankton som finns i våra hav. Det låter kanske som science fiction, men målet för projektet "DNA-streckkodning av marina växtplankton" är att tekniken ska vara redo för den svenska miljöövervakningen redan 2022.
|
|
| 5. |
|
|
| 6. |
- Eriksson, Leif E. B., et al.
(författare)
-
Evaluation of new spaceborne SAR sensors for sea-ice monitoring in the Baltic Sea
- 2010
-
Ingår i: Canadian journal of remote sensing. - : CANADIAN AERONAUTICS SPACE INST. - 0703-8992 .- 1712-7971. ; 36, s. S56-S73
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- In this study, synthetic aperture radar (SAR) data from the Advanced Land Observing Satellite (ALOS) and the Envisat, RADARSAT-2, and TerraSAR-X satellites were compared to evaluate their usefulness for sea-ice monitoring in the Baltic Sea. Radar signature characteristics at different frequencies, polarizations, and spatial resolutions are presented for three examples from 2009. C-band like-polarization data, which have been used for operational sea-ice mapping since the early 1990s, serve as a reference. Advantages and disadvantages were identified for the different SAR systems and imaging modes. One conclusion is that cross-polarized data improve the discrimination between sea ice and open water. Another observation is that it is easier to identify ice ridges in L-band data than in images from shorter wavelengths. The information content of X-and C-band images is largely equivalent, whereas L-band data provide complementary information. L-band SAR also seems to be less sensitive to wet snow cover on the ice.
|
|
| 7. |
- Eriksson, Leif, 1970, et al.
(författare)
-
Evaluation of multi-polarization SAR data at L-, C- and X-band for sea-ice monitoring in the Baltic Sea
- 2010
-
Ingår i: Proceedings of the ESA Living Planet Symposium 2010, 28 June - 2 July 2010, Bergen, Norway. ; ESA SP-686
-
Konferensbidrag (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- SAR data from the satellites ALOS, Envisat, Radarsat-2 and TerraSAR-X were compared in order to evaluate their usefulness for sea ice monitoring in the Baltic Sea. Different advantages and disadvantages were identified for the SAR systems and imaging modes. It has been shown that cross-polarized data improve the discrimination between sea-ice and open water. Another observation is that it is easier to identify ice ridges in L-band data than in images from shorter wavelengths. The information content of X- and C-band images is largely equivalent, whereas L-band data provide complementary information. L-band SAR also seems tobe less sensitive to wet snow cover on the ice.
|
|
| 8. |
- Eriksson, Leif, 1970, et al.
(författare)
-
Evaluation of new spaceborne SAR sensors for sea-ice monitoring in the Baltic Sea
- 2010
-
Ingår i: Canadian journal of remote sensing. - : Informa UK Limited. - 0703-8992 .- 1712-7971. ; 36:1, s. S56-S73
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- In this study, synthetic aperture radar (SAR) data from the Advanced Land Observing Satellite (ALOS) and the Envisat, RADARSAT-2, and TerraSAR-X satellites were compared to evaluate their usefulness for sea-ice monitoring in the Baltic Sea. Radar signature characteristics at different frequencies, polarizations, and spatial resolutions are presented for three examples from 2009. C-band like-polarization data, which have been used for operational sea-ice mapping since the early 1990s, serve as a reference. Advantages and disadvantages were identified for the different SAR systems and imaging modes. One conclusion is that cross-polarized data improve the discrimination between sea ice and open water. Another observation is that it is easier to identify ice ridges in L-band data than in images from shorter wavelengths. The information content of X- and C-band images is largely equivalent, whereas L-band data provide complementary information. L-band SAR also seems to be less sensitive to wet snow cover on the ice.
|
|
| 9. |
|
|
| 10. |
|
|
