SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Keränen Henrik)
 

Sökning: WFRF:(Keränen Henrik) > (2011) > Computer Simulation...

Computer Simulations of Structure-Activity Relationships for hERG Channel Blockers

Boukharta, Lars (författare)
Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
Keränen, Henrik (författare)
Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
Stary-Weinzinger, Anna (författare)
visa fler...
Wallin, Göran (författare)
Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
de Groot, Bert L. (författare)
Åqvist, Johan (författare)
Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2011-06-16
2011
Engelska.
Ingår i: Biochemistry. - : American Chemical Society (ACS). - 0006-2960 .- 1520-4995. ; 50:27, s. 6146-6156
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The hERG potassium channel is of major pharmaceutical importance, and its blockade by various compounds, potentially causing serious cardiac side effects, is a major problem in drug development. Despite the large amounts of existing biochemical data on blockade of hERG by drugs and druglike compounds, relatively little is known regarding the structural basis of binding of blockers to the channel. Here, we have used a recently developed homology model of hERG to conduct molecular docking experiments with a series of channel blockers, followed by molecular dynamics simulations of the complexes and evaluation of binding free energies with the linear interaction energy method. The calculations yield a remarkably good agreement with experimental binding affinities and allow for a rationalization of three-dimensional structure-activity relationships in terms of a number of key interactions. Two main interaction regions of the channel are thus identified with implications for further mutagenesis experiments and design of new compounds.

Nyckelord

MEDICINE
MEDICIN

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy