SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Keränen Henrik)
 

Sökning: WFRF:(Keränen Henrik) > (2020) > X-Ray Crystallograp...

X-Ray Crystallography and Free Energy Calculations Reveal the Binding Mechanism of A(2A) Adenosine Receptor Antagonists

Jespers, Willem (författare)
Uppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik
Verdon, Gregory (författare)
Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England.
Azuaje, Jhonny (författare)
Univ Santiago de Compostela, Fac Farmacy, Dept Organ Chem, Santiago De Compostela, Spain.;Univ Santiago de Compostela, Ctr Singular Invest Quim Biol & Mat Mol CIQUS, Santiago De Compostela, Spain.
visa fler...
Majellaro, Maria (författare)
Univ Santiago de Compostela, Fac Farmacy, Dept Organ Chem, Santiago De Compostela, Spain.;Univ Santiago de Compostela, Ctr Singular Invest Quim Biol & Mat Mol CIQUS, Santiago De Compostela, Spain.
Keränen, Henrik, 1983- (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi,Uppsala Univ, Biomed Ctr, Dept Cell & Mol Biol, BMC, Box 596, Uppsala, Sweden.;H Lundbeck & Co AS, Ottiliavej 9, DK-2500 Valby, Denmark.
Garcia-Mera, Xerardo (författare)
Univ Santiago de Compostela, Fac Farmacy, Dept Organ Chem, Santiago De Compostela, Spain.
Congreve, Miles (författare)
Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England.
Deflorian, Francesca (författare)
Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England.
de Graaf, Chris (författare)
Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England.
Zhukov, Andrei (författare)
Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England.
Dore, Andrew S. (författare)
Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England.
Mason, Jonathan S. (författare)
Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England.
Åqvist, Johan (författare)
Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Beräkningsbiologi och bioinformatik
Cooke, Robert M. (författare)
Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England.
Sotelo, Eddy (författare)
Univ Santiago de Compostela, Fac Farmacy, Dept Organ Chem, Santiago De Compostela, Spain.;Univ Santiago de Compostela, Ctr Singular Invest Quim Biol & Mat Mol CIQUS, Santiago De Compostela, Spain.
Gutiérrez-de-Terán, Hugo (författare)
Uppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2020-07-22
2020
Engelska.
Ingår i: Angewandte Chemie International Edition. - : WILEY-V C H VERLAG GMBH. - 1433-7851 .- 1521-3773. ; 59:38, s. 16536-16543
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • We present a robust protocol based on iterations of free energy perturbation (FEP) calculations, chemical synthesis, biophysical mapping and X-ray crystallography to reveal the binding mode of an antagonist series to the A(2A) adenosine receptor (AR). Eight A(2A)AR binding site mutations from biophysical mapping experiments were initially analyzed with sidechain FEP simulations, performed on alternate binding modes. The results distinctively supported one binding mode, which was subsequently used to design new chromone derivatives. Their affinities for the A(2A)AR were experimentally determined and investigated through a cycle of ligand-FEP calculations, validating the binding orientation of the different chemical substituents proposed. Subsequent X-ray crystallography of the A(2A)AR with a low and a high affinity chromone derivative confirmed the predicted binding orientation. The new molecules and structures here reported were driven by free energy calculations, and provide new insights on antagonist binding to the A(2A)AR, an emerging target in immunooncology.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Kemi -- Organisk kemi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Chemical Sciences -- Organic Chemistry (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Kemi -- Teoretisk kemi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Chemical Sciences -- Theoretical Chemistry (hsv//eng)

Nyckelord

adenosine receptors
biophysical mapping (BPM)
free energy perturbation (FEP)
G protein-coupled receptor (GPCR)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy