SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Porter Edward K.)
 

Sökning: WFRF:(Porter Edward K.) > (2021) > Genome evolution an...

Genome evolution and the emergence of pathogenicity in avian Escherichia coli

Mageiros, Leonardos (författare)
Univ Bath, Milner Ctr Evolut, Dept Biol & Biochem, Bath, Avon, England
Méric, Guillaume (författare)
Univ Bath, Milner Ctr Evolut, Dept Biol & Biochem, Bath, Avon, England
Bayliss, Sion C. (författare)
Univ Bath, Milner Ctr Evolut, Dept Biol & Biochem, Bath, Avon, England; MRC Cloud Infrastruct Microbial Bioinformat CLIMB, London, England
visa fler...
Pensar, Johan (författare)
Univ Oslo, Dept Biostat, Oslo, Norway; Univ Helsinki, Helsinki Inst Informat Technol, Dept Math & Stat, Helsinki, Finland
Pascoe, Ben (författare)
Univ Bath, Milner Ctr Evolut, Dept Biol & Biochem, Bath, Avon, England; Univ Oslo, Dept Biostat, Oslo, Norway
Mourkas, Evangelos (författare)
Univ Bath, Milner Ctr Evolut, Dept Biol & Biochem, Bath, Avon, England
Calland, Jessica K. (författare)
Univ Bath, Milner Ctr Evolut, Dept Biol & Biochem, Bath, Avon, England
Yahara, Koji (författare)
Natl Inst Infect Dis, Antimicrobial Resistance Res Ctr, Tokyo, Japan
Murray, Susan (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
Wilkinson, Thomas S. (författare)
Swansea Univ, Inst Life Sci, Med Sch, Swansea SA2 8PP, W Glam, Wales
Williams, Lisa K. (författare)
Swansea Univ, Inst Life Sci, Med Sch, Swansea SA2 8PP, W Glam, Wales
Hitchings, Matthew D. (författare)
Swansea Univ, Inst Life Sci, Med Sch, Swansea SA2 8PP, W Glam, Wales
Porter, Jonathan (författare)
Environm Agcy, Natl Lab Serv, Starcross, England
Kemmett, Kirsty (författare)
Univ Liverpool, Inst Infect & Global Hlth, Dept Epidemiol & Populat Hlth, Leahurst Campus, Wirral, Merseyside, England
Feil, Edward J. (författare)
Univ Bath, Milner Ctr Evolut, Dept Biol & Biochem, Bath, Avon, England
Jolley, Keith A. (författare)
Univ Oxford, Dept Zool, South Parks Rd, Oxford OX1 3PS, England
Williams, Nicola J. (författare)
Univ Liverpool, Inst Infect & Global Hlth, Dept Epidemiol & Populat Hlth, Leahurst Campus, Wirral, Merseyside, England
Corander, Jukka (författare)
Univ Oslo, Dept Biostat, Oslo, Norway; Univ Helsinki, Helsinki Inst Informat Technol, Dept Math & Stat, Helsinki, Finland; Wellcome Sanger Inst, Parasites & Microbes, Cambridge, England
Sheppard, Samuel K. (författare)
Univ Bath, Milner Ctr Evolut, Dept Biol & Biochem, Bath, Avon, England; MRC Cloud Infrastruct Microbial Bioinformat CLIMB, London, England; Univ Oxford, Dept Zool, South Parks Rd, Oxford OX1 3PS, England
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2021-02-03
2021
Engelska.
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Nature. - 2041-1723. ; 12:1
Relaterad länk:
https://doi.org/10.1...
visa fler...
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
https://www.nature.c...
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Chickens are the most common birds on Earth and colibacillosis is among the most common diseases affecting them. This major threat to animal welfare and safe sustainable food production is difficult to combat because the etiological agent, avian pathogenic Escherichia coli (APEC), emerges from ubiquitous commensal gut bacteria, with no single virulence gene present in all disease-causing isolates. Here, we address the underlying evolutionary mechanisms of extraintestinal spread and systemic infection in poultry. Combining population scale comparative genomics and pangenome-wide association studies, we compare E. coli from commensal carriage and systemic infections. We identify phylogroup-specific and species-wide genetic elements that are enriched in APEC, including pathogenicity-associated variation in 143 genes that have diverse functions, including genes involved in metabolism, lipopolysaccharide synthesis, heat shock response, antimicrobial resistance and toxicity. We find that horizontal gene transfer spreads pathogenicity elements, allowing divergent clones to cause infection. Finally, a Random Forest model prediction of disease status (carriage vs. disease) identifies pathogenic strains in the emergent ST-117 poultry-associated lineage with 73% accuracy, demonstrating the potential for early identification of emergent APEC in healthy flocks.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy