Sökning: WFRF:(Rehammar Anna 1978)
> (2018) >
miRNA profiling of ...
miRNA profiling of small intestinal neuroendocrine tumors defines novel molecular subtypes and identifies miR-375 as a biomarker of patient survival
-
- Arvidsson, Yvonne, 1960 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Cancer Center,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg
-
- Rehammar, Anna, 1978 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Department of Mathematical Sciences,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Bergström, Anders (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Cancer Center,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg
-
visa fler...
-
- Andersson, Ellinor (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Sahlgrenska Cancer Center,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg
-
- Altiparmak, Gülay (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Sahlgrenska Cancer Center,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg
-
- Swärd, Christina, 1967 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för kirurgi,Institute of Clinical Sciences, Department of Surgery,University of Gothenburg
-
- Wängberg, Bo, 1953 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för kirurgi,Institute of Clinical Sciences, Department of Surgery,University of Gothenburg
-
- Kristiansson, Erik, 1978 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Department of Mathematical Sciences,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Nilsson, Ola, 1957 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Cancer Center,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2018
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: Modern Pathology. - : Elsevier BV. - 0893-3952 .- 1530-0285. ; 31, s. 1302-1317
- Relaterad länk:
-
https://www.nature.c...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- © 2018, United States & Canadian Academy of Pathology. The aim of this study was to define the miRNA profile of small intestinal neuroendocrine tumors and to search for novel molecular subgroups and prognostic biomarkers. miRNA profiling was conducted on 42 tumors from 37 patients who underwent surgery for small intestinal neuroendocrine tumors. Unsupervised hierarchical clustering analysis of miRNA profiles identified two groups of tumor metastases, denoted cluster M1 and M2. The smaller cluster M1 was associated with shorter overall survival and contained tumors with higher grade (WHO grade G2/3) and multiple chromosomal gains including gain of chromosome 14. Tumors of cluster M1 had elevated expression of miR-1246 and miR-663a, and reduced levels of miR-488-3p. Pathway analysis predicted Wnt signaling to be the most significantly altered signaling pathway between clusters M1 and M2. Analysis of miRNA expression in relation to tumor proliferation rate showed significant alterations including downregulation of miR-137 and miR-204-5p in tumors with Ki67 index above 3%. Similarly, tumor progression was associated with significant alterations in miRNA expression, e.g. higher expression of miR-95 and miR-210, and lower expression of miR-378a-3p in metastases. Pathway analysis predicted Wnt signaling to be altered during tumor progression, which was supported by decreased nuclear translocation of β-catenin in metastases. Survival analysis revealed that downregulation of miR-375 was associated with shorter overall survival. We performed in situ hybridization on biopsies from an independent cohort of small intestinal neuroendocrine tumors using tissue microarrays. Expression of miR-375 was found in 578/635 (91%) biopsies and survival analysis confirmed that there was a correlation between downregulation of miR-375 in tumor metastases and shorter patient survival. We conclude that miRNA profiling defines novel molecular subgroups of metastatic small intestinal neuroendocrine tumors and identifies miRNAs associated with tumor proliferation rate and progression. miR-375 is highly expressed in small intestinal neuroendocrine tumors and may be used as a prognostic biomarker.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Klinisk laboratoriemedicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Clinical Laboratory Medicine (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- CONSENSUS GUIDELINES UPDATE; WNT/BETA-CATENIN ACTIVATION; CELL-LIKE PHENOTYPE; COLON-CANCER CELLS; MICRORNA EXPRESSION; LUNG-CANCER; COLORECTAL-CANCER; GASTRIC-CANCER; LIVER METASTASES; DOWN-REGULATION
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Arvidsson, Yvonn ...
-
Rehammar, Anna, ...
-
Bergström, Ander ...
-
Andersson, Ellin ...
-
Altiparmak, Güla ...
-
Swärd, Christina ...
-
visa fler...
-
Wängberg, Bo, 19 ...
-
Kristiansson, Er ...
-
Nilsson, Ola, 19 ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Klinisk laborato ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Modern Pathology
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Chalmers tekniska högskola