Sökning: WFRF:(Schadt Eric E.)
> (2018) >
Global analysis of ...
Global analysis of A-to-I RNA editing reveals association with common disease variants
-
- Franzen, Oscar (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Inst, Integrated Cardio Metab Ctr, Huddinge, Sweden.
-
- Ermel, Raili (författare)
- Tartu Univ Hosp, Dept Cardiac Surg, Tartu, Estonia.
-
- Sukhavasi, Katyayani (författare)
- Univ Tartu, Inst Biomed & Translat Med, Dept Pathophysiol, Tartu, Estonia.
-
visa fler...
-
- Jain, Rajeev (författare)
- Univ Tartu, Inst Biomed & Translat Med, Dept Pathophysiol, Tartu, Estonia.
-
- Jain, Anamika (författare)
- Univ Tartu, Inst Biomed & Translat Med, Dept Pathophysiol, Tartu, Estonia.
-
- Betsholtz, Christer (författare)
- Karolinska Institutet,Uppsala universitet,Vaskulärbiologi,Karolinska Inst, Integrated Cardio Metab Ctr, Huddinge, Sweden
-
- Giannarelli, Chiara (författare)
- Icahn Sch Med Mt Sinai, Cardiovasc Res Ctr, New York, NY 10029 USA.;Icahn Sch Med Mt Sinai, Inst Genom & Multiscale Biol, Dept Genet & Genom Sci, New York, NY 10029 USA.
-
- Kovacic, Jason C. (författare)
- Icahn Sch Med Mt Sinai, Cardiovasc Res Ctr, New York, NY 10029 USA.
-
- Ruusalepp, Arno (författare)
- Tartu Univ Hosp, Dept Cardiac Surg, Tartu, Estonia.;Univ Tartu, Inst Biomed & Translat Med, Dept Pathophysiol, Tartu, Estonia.;Clin Gene Networks AB, Stockholm, Sweden.
-
- Skogsberg, Josefin (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Med Biochem & Biophys, Solna, Sweden.
-
- Hao, Ke (författare)
- Icahn Sch Med Mt Sinai, Inst Genom & Multiscale Biol, Dept Genet & Genom Sci, New York, NY 10029 USA.
-
- Schadt, Eric E. (författare)
- Icahn Sch Med Mt Sinai, Inst Genom & Multiscale Biol, Dept Genet & Genom Sci, New York, NY 10029 USA.;Clin Gene Networks AB, Stockholm, Sweden.
-
- Bjoerkegren, Johan L. M. (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Inst, Integrated Cardio Metab Ctr, Huddinge, Sweden.;Univ Tartu, Inst Biomed & Translat Med, Dept Pathophysiol, Tartu, Estonia.;Icahn Sch Med Mt Sinai, Inst Genom & Multiscale Biol, Dept Genet & Genom Sci, New York, NY 10029 USA.;Clin Gene Networks AB, Stockholm, Sweden.
-
visa färre...
-
Karolinska Institutet Karolinska Inst, Integrated Cardio Metab Ctr, Huddinge, Sweden (creator_code:org_t)
- 2018-03-06
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: PeerJ. - : PeerJ. - 2167-8359. ; 6
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.7...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://doi.org/10.7...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.7...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- RNA editing modifies transcripts and may alter their regulation or function. In humans, the most common modification is adenosine to inosine (A-to-I). We examined the global characteristics of RNA editing in 4,301 human tissue samples. More than 1.6 million A-to-I edits were identified in 62% of all protein-coding transcripts. mRNA recoding was extremely rare; only 11 novel recoding sites were uncovered. Thirty single nucleotide polymorphisms from genome-wide association studies were associated with RNA editing; one that influences type 2 diabetes (rs2028299) was associated with editing in ARPIN. Twenty-five genes, including LRP11 and PLIN5, had editing sites that were associated with plasma lipid levels. Our findings provide new insights into the genetic regulation of RNA editing and establish a rich catalogue for further exploration of this process.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- RNA editing
- Gene expression
- Quantitative trait loci
- RNA-seq
- Bioinformatics
- Biostatistics
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
PeerJ
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Franzen, Oscar
-
Ermel, Raili
-
Sukhavasi, Katya ...
-
Jain, Rajeev
-
Jain, Anamika
-
Betsholtz, Chris ...
-
visa fler...
-
Giannarelli, Chi ...
-
Kovacic, Jason C ...
-
Ruusalepp, Arno
-
Skogsberg, Josef ...
-
Hao, Ke
-
Schadt, Eric E.
-
Bjoerkegren, Joh ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
-
PeerJ
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet