Sökning: WFRF:(Sulman Erik P.)
> (2014) >
Integrated Chromoso...
Integrated Chromosome 19 Transcriptomic and Proteomic Data Sets Derived from Glioma Cancer Stem-Cell Lines
-
Lichti, Cheryl F. (författare)
-
Liu, Huiling (författare)
-
Shavkunov, Alexander S. (författare)
-
visa fler...
-
Mostovenko, Ekaterina (författare)
-
Sulman, Erik P. (författare)
-
Ezhilarasan, Ravesanker (författare)
-
Wang, Qianghu (författare)
-
Kroes, Roger A. (författare)
-
Moskal, Joseph C. (författare)
-
Fenyö, David (författare)
-
Oksuz, Betul Akgol (författare)
-
Conrad, Charles A. (författare)
-
Lang, Frederick F. (författare)
-
Berven, Frode S. (författare)
-
- Végvári, Ákos (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
-
- Rezeli, Melinda (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
-
- Marko-Varga, György (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
-
- Hober, Sophia (författare)
- KTH,Proteinteknologi
-
Nilsson, Carol L. (författare)
-
Mostovenko, Elisabet (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2013-12-03
- 2014
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Proteome Research. - : American Chemical Society (ACS). - 1535-3893 .- 1535-3907. ; 13:1, s. 191-199
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- One subproject within the global Chromosome 19 Consortium is to define chromosome 19 gene and protein expression in glioma-derived cancer stem cells (GSCs). Chromosome 19 is notoriously linked to glioma by 1p/19q codeletions, and clinical tests are established to detect that specific aberration. GSCs are tumor-initiating cells and are hypothesized to provide a repository of cells in tumors that can self-replicate and be refractory to radiation and chemotherapeutic agents developed for the treatment of tumors. In this pilot study, we performed RNA-Seq, label-free quantitative protein measurements in six GSC lines, and targeted transcriptomic analysis using a chromosome 19-specific microarray in an additional six GSC lines. The data have been deposited to the ProteomeXchange with identifier PXD000563. Here we present insights into differences in GSC gene and protein expression, including the identification of proteins listed as having no or low evidence at the protein level in the Human Protein Atlas, as correlated to chromosome 19 and GSC subtype. Furthermore, the upregulation of proteins downstream of adenovirus-associated integration site 1 (AAVS1) in GSC11 in response to oncolytic adenovirus treatment was demonstrated. Taken together, our results may indicate new roles for chromosome 19, beyond the 1p/19q codeletion, in the future of personalized medicine for glioma patients.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Medicinteknik (hsv//swe)
- ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Medical Engineering (hsv//eng)
Nyckelord
- Chromosome-centric Human Proteome Project
- proteins
- mRNA
- RNA-Seq
- mass spectrometry
- bioinformatics
- glioma
- glioma stem cells
- cancer proteomics
- chromosome 19
- oncolytic virus
- neurocan core protein
- symplekin
- Chromosome-centric Human Proteome Project
- proteins
- mRNA
- RNA-Seq
- mass spectrometry
- Bioinformatics
- glioma
- glioma stem cells
- cancer proteomics
- chromosome 19
- oncolytic virus
- neurocan core protein
- symplekin
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Lichti, Cheryl F ...
-
Liu, Huiling
-
Shavkunov, Alexa ...
-
Mostovenko, Ekat ...
-
Sulman, Erik P.
-
Ezhilarasan, Rav ...
-
visa fler...
-
Wang, Qianghu
-
Kroes, Roger A.
-
Moskal, Joseph C ...
-
Fenyö, David
-
Oksuz, Betul Akg ...
-
Conrad, Charles ...
-
Lang, Frederick ...
-
Berven, Frode S.
-
Végvári, Ákos
-
Rezeli, Melinda
-
Marko-Varga, Gyö ...
-
Hober, Sophia
-
Nilsson, Carol L ...
-
Mostovenko, Elis ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Medicinteknik
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Prote ...
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Lunds universitet