Sökning: WFRF:(Supic Gordana)
> (2013) >
Next-generation seq...
Next-generation sequencing identifies microRNAs that associate with pathogenic autoimmune neuroinflammation in rats.
-
Bergman, Petra (författare)
-
- James, Tojo (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Kular, Lara (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa fler...
-
- Ruhrmann, Sabrina (författare)
- Karolinska Institutet
-
Kramarova, Tatiana (författare)
-
- Kvist, Anders (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
Supic, Gordana (författare)
-
Gillett, Alan (författare)
-
- Pivarcsi, Andor (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Jagodic, Maja (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2013-04-15
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Immunology. - : The American Association of Immunologists. - 0022-1767 .- 1550-6606. ; 190:8, s. 4066-75
- Relaterad länk:
-
https://www.jimmunol...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.4...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- MicroRNAs (miRNAs) are known to regulate most biological processes and have been found dysregulated in a variety of diseases, including multiple sclerosis (MS). In this study, we characterized miRNAs that associate with susceptibility to develop experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) in rats, a well-established animal model of MS. Using Illumina next-generation sequencing, we detected 544 miRNAs in the lymph nodes of EAE-susceptible Dark Agouti and EAE-resistant Piebald Virol Glaxo rats during immune activation. Forty-three miRNAs were found differentially expressed between the two strains, with 81% (35 out of 43) showing higher expression in the susceptible strain. Only 33% of tested miRNAs displayed differential expression in naive lymph nodes, suggesting that a majority of regulated miRNAs are EAE dependent. Further investigation of a selected six miRNAs indicates differences in cellular source and kinetics of expression. Several of the miRNAs, including miR-146a, miR-21, miR-181a, miR-223, and let-7, have previously been implicated in immune system regulation. Moreover, 77% (33 out of 43) of the miRNAs were associated with MS and other autoimmune diseases. Target genes likely regulated by the miRNAs were identified using computational predictions combined with whole-genome expression data. Differentially expressed miRNAs and their targets involve functions important for MS and EAE, such as immune cell migration through targeting genes like Cxcr3 and cellular maintenance and signaling by regulation of Prkcd and Stat1. In addition, we demonstrated that these three genes are direct targets of miR-181a. Our study highlights the impact of multiple miRNAs, displaying diverse kinetics and cellular sources, on development of pathogenic autoimmune inflammation.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Immunologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Immunology in the medical area (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Neurologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Neurology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Neurovetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Neurosciences (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Bergman, Petra
-
James, Tojo
-
Kular, Lara
-
Ruhrmann, Sabrin ...
-
Kramarova, Tatia ...
-
Kvist, Anders
-
visa fler...
-
Supic, Gordana
-
Gillett, Alan
-
Pivarcsi, Andor
-
Jagodic, Maja
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Immunologi inom ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Neurologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Neurovetenskaper
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Immun ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Lunds universitet
-
Karolinska Institutet