Sökning: WFRF:(Wingfield Michael J.)
> (2014) >
Finding needles in ...
Finding needles in haystacks: linking scientific names, reference specimens and molecular data for Fungi
-
Schoch, Conrad L. (författare)
-
Robbertse, Barbara (författare)
-
Robert, Vincent (författare)
-
visa fler...
-
Vu, Duong (författare)
-
Cardinali, Gianluigi (författare)
-
Irinyi, Laszlo (författare)
-
Meyer, Wieland (författare)
-
- Nilsson, R. Henrik, 1976 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences
-
Hughes, Karen (författare)
-
Miller, Andrew N. (författare)
-
Kirk, Paul M. (författare)
-
Abarenkov, Kessy (författare)
-
Aime, M. Catherine (författare)
-
Ariyawansa, Hiran A. (författare)
-
Bidartondo, Martin (författare)
-
Boekhout, Teun (författare)
-
Buyck, Bart (författare)
-
Cai, Qing (författare)
-
Chen, Jie (författare)
-
Crespo, Ana (författare)
-
Crous, Pedro W. (författare)
-
Damm, Ulrike (författare)
-
Beer, Z. Wilhelm De (författare)
-
Dentinger, Bryn T. M. (författare)
-
Divakar, Pradeep K. (författare)
-
Dueñas, Margarita (författare)
-
Feau, Nicolas (författare)
-
Fliegerova, Katerina (författare)
-
García, Miguel A. (författare)
-
Ge, Zai-Wei (författare)
-
Griffith, Gareth W. (författare)
-
Groenewald, Johannes Z. (författare)
-
Groenewald, Marizeth (författare)
-
Grube, Martin (författare)
-
Gryzenhout, Marieka (författare)
-
Gueidan, Cécile (författare)
-
Guo, Liangdong (författare)
-
Hambleton, Sarah (författare)
-
Hamelin, Richard (författare)
-
- Hansen, Karen (författare)
- Naturhistoriska riksmuseet,Enheten för botanik
-
Hofstetter, Valérie (författare)
-
Hong, Seung-Beom (författare)
-
Houbraken, Jos (författare)
-
Hyde, Kevin D. (författare)
-
Inderbitzin, Patrik (författare)
-
Johnston, Peter R. (författare)
-
Karunarathna, Samantha C. (författare)
-
Kõljalg, Urmas (författare)
-
Kovács, Gábor M. (författare)
-
Kraichak, Ekaphan (författare)
-
Krizsan, Krisztina (författare)
-
Kurtzman, Cletus P. (författare)
-
Larsson, Karl-Henrik, 1948 (författare)
-
Leavitt, Steven (författare)
-
Letcher, Peter M. (författare)
-
Liimatainen, Kare (författare)
-
Liu, Jian-Kui (författare)
-
Lodge, D. Jean (författare)
-
Luangsaard, Janet Jennifer (författare)
-
Lumbsch, H. Thorsten (författare)
-
Maharachchikumbura, Sajeewa S.N. (författare)
-
Manamgoda, Dimuthu (författare)
-
Martín, María P. (författare)
-
Minnis, Andrew M. (författare)
-
Moncalvo, Jean-Marc (författare)
-
Mulè, Giuseppina (författare)
-
Nakasone, Karen K. (författare)
-
Niskanen, Tuula (författare)
-
Olariaga, Ibai (författare)
-
Papp, Tamás (författare)
-
Petkovits, Tamás (författare)
-
Pino-Bodas, Raquel (författare)
-
Powell, Martha J. (författare)
-
Raja, Huzefa A. (författare)
-
Redecker, Dirk (författare)
-
Sarmiento-Ramirez, J. M. (författare)
-
Seifert, Keith A. (författare)
-
Shrestha, Bhushan (författare)
-
Stenroos, Soili (författare)
-
Stielow, Benjamin (författare)
-
Suh, Sung-Oui (författare)
-
Tanaka, Kazuaki (författare)
-
Tedersoo, Leho (författare)
-
Telleria, M. Teresa (författare)
-
Udayanga, Dhanushka (författare)
-
Untereiner, Wendy A. (författare)
-
Uribeondo, Javier Diéguez (författare)
-
Subbarao, Krishna V. (författare)
-
Vágvölgyi, Csaba (författare)
-
Visagie, Cobus (författare)
-
Voigt, Kerstin (författare)
-
Walker, Donald M. (författare)
-
Weir, Bevan S. (författare)
-
Weiß, Michael (författare)
-
Wijayawardene, Nalin N. (författare)
-
Wingfield, Michael J. (författare)
-
Xu, J. P. (författare)
-
Yang, Zhu L. (författare)
-
Zhang, Ning (författare)
-
Zhuang, Wen-ying (författare)
-
Federhen, Scott (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2014-06-30
- 2014
- Engelska.
-
Ingår i: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. - : Oxford University Press (OUP). - 1758-0463. ; 2014:bau061, s. 1-21
- Relaterad länk:
-
https://gup.ub.gu.se... (primary) (free)
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- DNA phylogenetic comparisons have shown that morphology-based species recognition often underestimates fungal diversity. Therefore, the need for accurate DNA sequence data, tied to both correct taxonomic names and clearly annotated specimen data, has never been greater. Furthermore, the growing number of molecular ecology and microbiome projects using high-throughput sequencing require fast and effective methods for en masse species assignments. In this article, we focus on selecting and re-annotating a set of marker reference sequences that represent each currently accepted order of Fungi. The particular focus is on sequences from the internal transcribed spacer region in the nuclear ribosomal cistron, derived from type specimens and/or ex-type cultures. Re-annotated and verified sequences were deposited in a curated public database at the National Center for Biotechnology Information (NCBI), namely the RefSeq Targeted Loci (RTL) database, and will be visible during routine sequence similarity searches with NR_prefixed accession numbers. A set of standards and protocols is proposed to improve the data quality of new sequences, and we suggest how type and other reference sequences can be used to improve identification of Fungi.
Ämnesord
- LANTBRUKSVETENSKAPER -- Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske -- Markvetenskap (hsv//swe)
- AGRICULTURAL SCIENCES -- Agriculture, Forestry and Fisheries -- Soil Science (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biologisk systematik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biological Systematics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Ekologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Ecology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Botanik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Botany (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Datavetenskap (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Computer Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Systemvetenskap, informationssystem och informatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Information Systems (hsv//eng)
Nyckelord
- Diversity of life
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Schoch, Conrad L ...
-
Robbertse, Barba ...
-
Robert, Vincent
-
Vu, Duong
-
Cardinali, Gianl ...
-
Irinyi, Laszlo
-
visa fler...
-
Meyer, Wieland
-
Nilsson, R. Henr ...
-
Hughes, Karen
-
Miller, Andrew N ...
-
Kirk, Paul M.
-
Abarenkov, Kessy
-
Aime, M. Catheri ...
-
Ariyawansa, Hira ...
-
Bidartondo, Mart ...
-
Boekhout, Teun
-
Buyck, Bart
-
Cai, Qing
-
Chen, Jie
-
Crespo, Ana
-
Crous, Pedro W.
-
Damm, Ulrike
-
Beer, Z. Wilhelm ...
-
Dentinger, Bryn ...
-
Divakar, Pradeep ...
-
Dueñas, Margarit ...
-
Feau, Nicolas
-
Fliegerova, Kate ...
-
García, Miguel A ...
-
Ge, Zai-Wei
-
Griffith, Gareth ...
-
Groenewald, Joha ...
-
Groenewald, Mari ...
-
Grube, Martin
-
Gryzenhout, Mari ...
-
Gueidan, Cécile
-
Guo, Liangdong
-
Hambleton, Sarah
-
Hamelin, Richard
-
Hansen, Karen
-
Hofstetter, Valé ...
-
Hong, Seung-Beom
-
Houbraken, Jos
-
Hyde, Kevin D.
-
Inderbitzin, Pat ...
-
Johnston, Peter ...
-
Karunarathna, Sa ...
-
Kõljalg, Urmas
-
Kovács, Gábor M.
-
Kraichak, Ekapha ...
-
Krizsan, Kriszti ...
-
Kurtzman, Cletus ...
-
Larsson, Karl-He ...
-
Leavitt, Steven
-
Letcher, Peter M ...
-
Liimatainen, Kar ...
-
Liu, Jian-Kui
-
Lodge, D. Jean
-
Luangsaard, Jane ...
-
Lumbsch, H. Thor ...
-
Maharachchikumbu ...
-
Manamgoda, Dimut ...
-
Martín, María P.
-
Minnis, Andrew M ...
-
Moncalvo, Jean-M ...
-
Mulè, Giuseppina
-
Nakasone, Karen ...
-
Niskanen, Tuula
-
Olariaga, Ibai
-
Papp, Tamás
-
Petkovits, Tamás
-
Pino-Bodas, Raqu ...
-
Powell, Martha J ...
-
Raja, Huzefa A.
-
Redecker, Dirk
-
Sarmiento-Ramire ...
-
Seifert, Keith A ...
-
Shrestha, Bhusha ...
-
Stenroos, Soili
-
Stielow, Benjami ...
-
Suh, Sung-Oui
-
Tanaka, Kazuaki
-
Tedersoo, Leho
-
Telleria, M. Ter ...
-
Udayanga, Dhanus ...
-
Untereiner, Wend ...
-
Uribeondo, Javie ...
-
Subbarao, Krishn ...
-
Vágvölgyi, Csaba
-
Visagie, Cobus
-
Voigt, Kerstin
-
Walker, Donald M ...
-
Weir, Bevan S.
-
Weiß, Michael
-
Wijayawardene, N ...
-
Wingfield, Micha ...
-
Xu, J. P.
-
Yang, Zhu L.
-
Zhang, Ning
-
Zhuang, Wen-ying
-
Federhen, Scott
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- LANTBRUKSVETENSKAPER
-
LANTBRUKSVETENSK ...
-
och Lantbruksvetensk ...
-
och Markvetenskap
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biologisk system ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Ekologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Botanik
-
visa fler...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Mikrobiologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Datavetenskap
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Systemvetenskap ...
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
Database: The Jo ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Naturhistoriska riksmuseet