Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/184822" >
A diagnostic algori...
A diagnostic algorithm to identify paired tumors with clonal origin.
-
- Nemes, Szilard, 1977 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
- Danielsson, Anna, 1973 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
- Parris, Toshima Z, 1978 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
visa fler...
-
- Miao Jonasson, Junmei, 1972 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Enheten för socialmedicin,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology,Social Medicine unit
-
Bülow, Erik (författare)
-
- Karlsson, Per, 1963 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
- Steineck, Gunnar, 1952 (författare)
- Karolinska Institutet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
- Helou, Khalil, 1966 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2013-09-02
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: Genes, chromosomes & cancer. - : Wiley. - 1098-2264 .- 1045-2257. ; 52:11, s. 1007-16
- Relaterad länk:
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Despite practical implications we still lack standardized methods for clonality testing of tumor pairs. Each tumor is characterized by a set of chromosomal abnormalities, nonrandom changes preferentially involving specific chromosomes and chromosomal regions. Although tumors accumulate chromosomal abnormalities during their development, the majority of these alterations is specific and characteristic for each individual tumor is not exhibited at the population level. Assumingly, secondary tumors that develop from disseminated cells from the primary tumor inherit not only chromosomal changes specific for the cancerous process but also random chromosomal changes that accumulate during tumor development. Based on this assumption, we adopted an intuitive index for genomic similarities of paired tumors, which ranges between zero (completely different genomic profiles) and one (identical genomic profiles). To test the assumption that two tumors have clonal origins if they share a higher degree of genomic similarity than two randomly paired tumors, we built a permutation-based null-hypothesis procedure. The procedure is demonstrated using two publicly available data sets. The article highlights the complexities of clonality testing and aims to offer an easy to follow blueprint that will allow researchers to test genomic similarities of paired tumors, with the proposed index or any other index that fits their need. © 2013 Wiley Periodicals, Inc.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Nemes, Szilard, ...
-
Danielsson, Anna ...
-
Parris, Toshima ...
-
Miao Jonasson, J ...
-
Bülow, Erik
-
Karlsson, Per, 1 ...
-
visa fler...
-
Steineck, Gunnar ...
-
Helou, Khalil, 1 ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Genes, chromosom ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Karolinska Institutet