Sökning: id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:54d70dc0-2154-4a66-a91a-d82193e6cbb2" >
Exome array analysi...
Exome array analysis of ischaemic stroke : results from a southern Swedish study
-
- Söderholm, M (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Epidemiology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
- Almgren, P (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups
-
- Jood, Katarina, 1966 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience and Rehabilitation
-
visa fler...
-
- Stanne, Tara M, 1979 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
- Olsson, Mats (författare)
- University of Gothenburg
-
- Ilinca, A (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital
-
- Lorentzen, Erik, 1974 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Core Facilities, Bioinformatics,Core Facilities, Bioinformatics
-
- Norrving, B (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital
-
- Engström, G (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Epidemiology,Lund University Research Groups
-
- Melander, O (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups
-
- Jern, Christina, 1962 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
- Lindgren, Arne (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Klinisk strokeforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Clinical Stroke Research Group,Lund University Research Groups
-
- Olsson, Maja, 1975 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2016-07-29
- 2016
- Engelska 7 s.
-
Ingår i: European Journal of Neurology. - : Wiley. - 1351-5101 .- 1468-1331. ; 23:12, s. 1722-1728
- Relaterad länk:
-
http://onlinelibrary...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- BACKGROUND AND PURPOSE: Genome-wide association (GWA) studies have identified a few risk loci for ischaemic stroke, but these variants explain only a small part of the genetic contribution to the disease. Coding variants associated with amino acid substitutions or premature termination of protein synthesis could have a large effect on disease risk. We performed an exome array analysis for ischaemic stroke.METHODS: Patients with ischaemic stroke (n = 2385) and control subjects (n = 6077) from three Swedish studies were genotyped with the Illumina HumanOmniExpressExome BeadChip. Single-variant association analysis and gene-based tests were performed of exome variants with minor allele frequency of < 5%. A separate GWA analysis was also performed, based on 700 000 genotyped common markers and subsequent imputation.RESULTS: No exome variant or gene was significantly associated with all ischaemic stroke after Bonferroni correction (all P > 1.8 × 10(-6) for single-variant and >4.15 × 10(-6) for gene-based analysis). The strongest association in single-variant analysis was found for a missense variant in the DNAH11 gene (rs143362381; P = 5.01 × 10(-6) ). In gene-based tests, the strongest association was for the ZBTB20 gene (P = 7.9 × 10(-5) ). The GWA analysis showed that the sample was homogenous (median genomic inflation factor = 1.006). No genome-wide significant association with overall ischaemic stroke risk was found. However, previously reported associations for the PITX2 and ZFHX3 gene loci with cardioembolic stroke subtype were replicated (P = 7 × 10(-15) and 6 × 10(-3) ).CONCLUSIONS: This exome array analysis did not identify any single variants or genes reaching the pre-defined significance level for association with ischaemic stroke. Further studies on exome variants should be performed in even larger, well-defined and subtyped samples.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Neurovetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Neurosciences (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
Nyckelord
- stroke
- exome array
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Söderholm, M
-
Almgren, P
-
Jood, Katarina, ...
-
Stanne, Tara M, ...
-
Olsson, Mats
-
Ilinca, A
-
visa fler...
-
Lorentzen, Erik, ...
-
Norrving, B
-
Engström, G
-
Melander, O
-
Jern, Christina, ...
-
Lindgren, Arne
-
Olsson, Maja, 19 ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Neurovetenskaper
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
- Artiklar i publikationen
-
European Journal ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet
-
Göteborgs universitet