id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:ea08fb53-b4b9-4b70-9bc0-cb80b61b5c17"
Sökning: id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:ea08fb53-b4b9-4b70-9bc0-cb80b61b5c17" > Cell-Type-Specific ...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Cell-Type-Specific Gene Programs of the Normal Human Nephron Define Kidney Cancer Subtypes
-
- Lindgren, David (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
-
- Eriksson, Pontus (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Krawczyk, Krzysztof (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk patologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical pathology, Malmö,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
- visa fler...
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2017
- 2017
- Engelska 14 s.
- Ingår i: Cell Reports. - : Elsevier BV. - 2211-1247. ; 20:6, s. 1476-1489
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Comprehensive transcriptome studies of cancers often rely on corresponding normal tissue samples to serve as a transcriptional reference. In this study, we performed in-depth analyses of normal kidney tissue transcriptomes from the TCGA and demonstrate that the histological variability in cellularity, inherent in the kidney architecture, lead to considerable transcriptional differences between samples. This should be considered when comparing expression profiles of normal and cancerous kidney tissues. We exploited these differences to define renal-cell-specific gene signatures and used these as a framework to analyze renal cell carcinoma (RCC) ontogeny. Chromophobe RCCs express FOXI1-driven genes that define collecting duct intercalated cells, whereas HNF-regulated genes, specific for proximal tubule cells, are an integral part of clear cell and papillary RCC transcriptomes. These networks may be used as a framework for understanding the interplay between genomic changes in RCC subtypes and the lineage-defining regulatory machinery of their non-neoplastic counterparts.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- cell of origin
- FOXI1
- gene expression
- HIF
- kidney
- nephron
- NHF
- RCC
- renal cell carcinoma
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Lindgren, David
- Eriksson, Pontus
- Krawczyk, Krzysz ...
- Nilsson, Helén
- Hansson, Jennife ...
- Veerla, Srinivas
- visa fler...
- Sjölund, Jonas
- Höglund, Mattias
- Johansson, Marti ...
- Axelson, Håkan
- visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
- Cell Reports
- Av lärosätet
- Lunds universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
