| 1. |
- Jonmarker, Sandra, et al.
(författare)
-
Effects of 12 mg vs. 6 mg dexamethasone on thromboembolism and bleeding in patients with critical COVID-19-a post hoc analysis of the randomized, blinded COVID STEROID 2 trial
- 2023
-
Ingår i: Annals of Intensive Care. - : SPRINGER. - 2110-5820. ; 13:1
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- BackgroundThromboembolism is more common in patients with critical COVID-19 than in other critically ill patients, and inflammation has been proposed as a possible mechanism. The aim of this study was to investigate if 12 mg vs. 6 mg dexamethasone daily reduced the composite outcome of death or thromboembolism in patients with critical COVID-19.MethodsUsing additional data on thromboembolism and bleeding we did a post hoc analysis of Swedish and Danish intensive care unit patients enrolled in the blinded randomized COVID STEROID 2 trial comparing 12 mg vs. 6 mg dexamethasone daily for up to 10 days. The primary outcome was a composite outcome of death or thromboembolism during intensive care. Secondary outcomes were thromboembolism, major bleeding, and any bleeding during intensive care.ResultsWe included 357 patients. Whilst in intensive care, 53 patients (29%) in the 12 mg group and 53 patients (30%) in the 6 mg group met the primary outcome with an unadjusted absolute risk difference of - 0.5% (95% CI - 10 to 9.5%, p = 1.00) and an adjusted OR of 0.93 (CI 95% 0.58 to 1.49, p = 0.77). We found no firm evidence of differences in any of the secondary outcomes.ConclusionsAmong patients with critical COVID-19, 12 mg vs. 6 mg dexamethasone daily did not result in a statistically significant difference in the composite outcome of death or thromboembolism. However, uncertainty remains due to the limited number of patients.
|
|
| 2. |
- Kolnes, Anders Jensen, et al.
(författare)
-
TGFBR3L is associated with gonadotropin production in non-functioning gonadotroph pituitary neuroendocrine tumours
- 2023
-
Ingår i: Pituitary. - : Springer. - 1386-341X .- 1573-7403. ; 26:2, s. 227-236
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Purpose Transforming growth factor-beta receptor 3-like (TGFBR3L) is a pituitary enriched membrane protein selectively detected in gonadotroph cells. TGFBR3L is named after transforming growth factor-beta receptor 3 (TGFBR3), an inhibin A co-receptor in mice, due to sequence identity to the C-terminal region. We aimed to characterize TGFBR3L detection in a well-characterized, prospectively collected cohort of non-functioning pituitary neuroendocrine tumours (NF-PitNETs) and correlate it to clinical data.Methods 144 patients operated for clinically NF-PitNETs were included. Clinical, radiological and biochemical data were recorded. Immunohistochemical (IHC) staining for FSH beta and LH beta was scored using the immunoreactive score (IRS), TGFBR3L and TGFBR3 were scored by the percentage of positive stained cells.Results TGFBR3L staining was selectively present in 52% of gonadotroph tumours. TGFBR3L was associated to IRS of LH beta (median 2 [IQR 0-3] in TGFBR3L negative and median 6 [IQR 3-9] in TGFBR3L positive tumours, p < 0.001), but not to the IRS of FSH beta (p = 0.32). The presence of TGFBR3L was negatively associated with plasma gonadotropin concentrations in males (P-FSH median 5.5 IU/L [IQR 2.9-9.6] and median 3.0 [IQR 1.8-5.6] in TGFBR3L negative and positive tumours respectively, p = 0.008) and P-LH (median 2.8 IU/L [IQR 1.9-3.7] and median 1.8 [IQR 1.1-3.0] in TGFBR3L negative and positive tumours respectively, p = 0.03). TGFBR3 stained positive in 22% (n = 25) of gonadotroph tumours with no correlation to TGFBR3L.Conclusion TGFBR3L was selectively detected in half (52%) of gonadotroph NF-PitNETs. The association to LH beta staining and plasma gonadotropins suggests that TGFBR3L may be involved in hormone production in gonadotroph NF-PitNETs.
|
|
| 3. |
- Nilsson, Daniel, et al.
(författare)
-
Patient-specific brain arteries molded as a flexible phantom model using 3D printed water-soluble resin
- 2022
-
Ingår i: Scientific Reports. - : Nature Publishing Group. - 2045-2322. ; 12
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Visualizing medical images from patients as physical 3D models (phantom models) have many roles in the medical field, from education to preclinical preparation and clinical research. However, current phantom models are generally generic, expensive, and time-consuming to fabricate. Thus, there is a need for a cost- and time-efficient pipeline from medical imaging to patient-specific phantom models. In this work, we present a method for creating complex 3D sacrificial molds using an off-the-shelf water-soluble resin and a low-cost desktop 3D printer. This enables us to recreate parts of the cerebral arterial tree as a full-scale phantom model (10×6×410×6×4 cm) in transparent silicone rubber (polydimethylsiloxane, PDMS) from computed tomography angiography images (CTA). We analyzed the model with magnetic resonance imaging (MRI) and compared it with the patient data. The results show good agreement and smooth surfaces for the arteries. We also evaluate our method by looking at its capability to reproduce 1 mm channels and sharp corners. We found that round shapes are well reproduced, whereas sharp features show some divergence. Our method can fabricate a patient-specific phantom model with less than 2 h of total labor time and at a low fabrication cost.
|
|
| 4. |
- Bergenfelz, Anders, et al.
(författare)
-
Impact of autofluorescence for detection of parathyroid glands during thyroidectomy on postoperative parathyroid hormone levels: parallel multicentre randomized clinical trial
- 2023
-
Ingår i: The British journal of surgery. - 1365-2168 .- 0007-1323. ; 110:12, s. 1824-1833
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- BACKGROUND: Techniques for autofluorescence have been introduced to visualize the parathyroid glands during surgery and to reduce hypoparathyroidism after thyroidectomy. METHODS: This parallel multicentre RCT investigated the use of Fluobeam® LX to visualize the parathyroid glands by autofluorescence during total thyroidectomy compared with no use. There was no restriction on the indication for surgery. Patients were randomized 1 : 1 and were blinded to the group allocation. The hypothesis was that autofluorescence enables identification and protection of the parathyroid glands during thyroidectomy. The primary endpoint was the rate of low parathyroid hormone (PTH) levels the day after surgery. RESULTS: Some 535 patients were randomized, and 486 patients received an intervention according to the study protocol, 246 in the Fluobeam® LX group and 240 in the control group. Some 64 patients (26.0 per cent) in the Fluobeam® LX group and 77 (32.1 per cent) in the control group had low levels of PTH after thyroidectomy (P = 0.141; relative risk (RR) 0.81, 95 per cent c.i. 0.61 to 1.07). Subanalysis of 174 patients undergoing central lymph node clearance showed that 15 of 82 (18 per cent) in the Fluobeam® LX group and 31 of 92 (33 per cent) in the control group had low levels of PTH on postoperative day 1 (P = 0.021; RR 0.54, 0.31 to 0.93). More parathyroid glands were identified during operation in patients who had surgery with Fluobeam® LX, and fewer parathyroid glands in the surgical specimen on definitive histopathology. No specific harm related to the use of Fluobeam® LX was reported. CONCLUSION: The use of autofluorescence during thyroidectomy did not reduce the rate of low PTH levels on postoperative day 1 in the whole group of patients. It did, however, reduce the rate in a subgroup of patients.
|
|
| 5. |
- Bobbio, Emanuele, et al.
(författare)
-
Diagnosis, management, and outcome of cardiac sarcoidosis and giant cell myocarditis: a Swedish single center experience.
- 2022
-
Ingår i: BMC cardiovascular disorders. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1471-2261. ; 22
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Cardiac sarcoidosis (CS) and giant cell myocarditis (GCM) are rare diseases that share some similarities, but also display different clinical and histopathological features. We aimed to compare the demographics, clinical presentation, and outcome of patients diagnosed with CS or GCM.We compared the clinical data and outcome of all adult patients with CS (n=71) or GCM (n=21) diagnosed at our center between 1991 and 2020.The median (interquartile range) follow-up time for patients with CS and GCM was 33.5 [6.5-60.9] and 2.98 [0.6-40.9] months, respectively. In the entire cohort, heart failure (HF) was the most common presenting manifestation (31%), followed by ventricular arrhythmias (25%). At presentation, a left ventricular ejection fraction of<50% was found in 54% of the CS compared to 86% of the GCM patients (P=0.014), while corresponding proportions for right ventricular dysfunction were 24% and 52% (P=0.026), respectively. Advanced HF (NYHA≥IIIB) was less common in CS (31%) than in GCM (76%). CS patients displayed significantly lower circulating levels of natriuretic peptides (P<0.001) and troponins (P=0.014). Eighteen percent of patients with CS included in the survival analysis reached the composite endpoint of death or heart transplantation (HTx) compared to 68% of patients with GCM (P<0.001).GCM has a more fulminant clinical course than CS with severe biventricular failure, higher levels of circulating biomarkers and an increased need for HTx. The histopathologic diagnosis remained key determinant even after adjustment for markers of cardiac dysfunction.
|
|
| 6. |
|
|
| 7. |
|
|
| 8. |
|
|
| 9. |
|
|
| 10. |
- Dahlberg, Anders, et al.
(författare)
-
Svampar Fungi
- 2020
-
Ingår i: Rödlistade arter i Sverige 2020. - 9789187853548 ; , s. 67-88
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 11. |
|
|
| 12. |
- Dahlberg, Anders, et al.
(författare)
-
Ten principles for conservation translocations of threatened wood-inhabiting fungi
- 2020
-
Ingår i: Fungal Ecology. - 1754-5048 .- 1878-0083. ; 44
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Unlike for many other organism groups, conservation translocations of fungi are still rare. Encouraged by recent successful translocations, there is a growing interest in applying this conservation tool to threatened wood-inhabiting fungi. When combined with other conservation or restoration measures, translocation can be an effective measure for preventing further population decline in the short term, and species extinctions in the long term. Translocations can be appropriate for rare and specialist fungal species that occur as small local populations in isolated patches across fragmented landscapes, where there is a low likelihood of successful dispersal between distant host trees that have special qualities and are situated in suitable conditions. As species translocations are a controversial topic, the pros and cons of translocation as a conservation tool for threatened fungi need careful consideration. We highlight the uncertainties and risks that are connected to fungal translocations, and propose ten principles adhering to the precautionary principle. (C) 2020 Elsevier Ltd and British Mycological Society. All rights reserved.
|
|
| 13. |
- Dahlberg, Anders
(författare)
-
What Do the First 597 Global Fungal Red List Assessments Tell Us about the Threat Status of Fungi?
- 2022
-
Ingår i: Diversity. - : MDPI AG. - 1424-2818. ; 14
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Fungal species are not immune to the threats facing animals and plants and are thus also prone to extinction. Yet, until 2015, fungi were nearly absent on the IUCN Red List. Recent efforts to identify fungal species under threat have significantly increased the number of published fungal assessments. The 597 species of fungi published in the 2022-1 IUCN Red List update (21 July 2022) are the basis for the first global review of the extinction risk of fungi and the threats they face. Nearly 50% of the assessed species are threatened, with 10% NT and 9% DD. For regions with a larger number of assessments (i.e., Europe, North America, and South America), subanalyses are provided. Data for lichenized and nonlichenized fungi are also summarized separately. Habitat loss/degradation followed by climate change, invasive species, and pollution are the primary identified threats. Bias in the data is discussed along with knowledge gaps. Suggested actions to address these gaps are provided along with a discussion of the use of assessments to facilitate on-the-ground conservation efforts. A research agenda for conservation mycology to assist in the assessment process and implementation of effective species/habitat management is presented.
|
|
| 14. |
|
|
| 15. |
- Djupström, Line, et al.
(författare)
-
Nyttan av naturhänsyn för marksvampar : resultat fem år efter avverkning
- 2022
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Vardagshänsyn är ett viktigt verktyg inom skogsbruket som kan hjälpa många arter att överleva hyggesfasen. Det gäller inte minst den artrika gruppen mykorrhizasvampar med omkring 2000 arter i Sverige, som för sin energiförsörjning är beroende av att leva i symbios med levande träd. Trakthygge resulterar oundvikligen i att merparten av mykorrhizasvamparna dör ut lokalt och behöver återetableras när ny skog växer upp. Knappt 200 av Sveriges mykorrhizasvampar är rödlistade på grund av att de huvudsakligen förekommer i äldre skog eller är ovanliga på grund av speciella miljökrav. Många mykorrhizabildande svamparter, inklusive de rödlistade, har svårt att återetablera sig och missgynnas av trakthyggesbruk. Samtidigt är mykorrhizasvamparnas mycel långlivade och kan leva vidare under många decennier och förmodligen betydligt längre, om det kontinuerligt finns träd på platsen. Enstaka, eller grupper av, hänsynsträd är ett sätt att möjliggöra för rödlistade- och andra mykorrhizasvampar att överleva hyggesfasen och finnas med i det uppväxande beståndet. Senare tids forskning pekar också på att hyggesfasens markeutrofiering selekterar för andra mykorrhizasvampar än de som normalt dominerar i äldre skog. Till exempel verkar vissa skinnsvampar, med sämre förmåga att mobilisera näring från markens organiska material, gynnas på bekostnad av främst spindelskivlingar, som är särskilt effektiva på att frigöra organiskt bundna näringsämnen under fattiga förhållanden.Syftet med studien var att undersöka betydelsen av att lämna olika många hänsynsträd vid avverkning i äldre tallskog för överlevnaden av mykorrhizasvampar, med eller utan kompletterande naturvårdsbränning. Det är en naturvårdsfråga av stor praktisk betydelse, och det är viktigt att kvantifiera vilken effekt olika nivåer och utförande av naturhänsyn kan ha för mängden och artsammansättningen av mykorrhizasvampar på kort och lång sikt, särskilt för naturvårdsintressanta arter.Studien utfördes på Effaråsen, ett storskaligt långtidsexperiment som finns tre mil väster om Mora. Här finns hela skogsbestånd som bränts och/eller avverkats, där den totala nivån av naturhänsyn varierar i en gradient av skötselmetoder som sträcker sig från en allmänt praktiserad nivå till en hög nivå av naturhänsyn. Designen för hänsynen omfattar både lämnade levande träd och skapad död ved, men endast de levande träden, det vill säga intakta träd och katade träd, är av intresse för denna studie.I undersökningen har vi samlat in markprover från varje provyta längs transekter. Den första provtagningen ägde rum 2012 innan avverkning med olika nivåer av naturhänsyn och naturvårdsbränningar genomfördes. Fem år senare, 2017, gjordes en uppföljande undersökning. Markprovernas innehåll av specifika DNA-markörer sekvenserades, identifierades och analyserades med fokus på mykorrhizasvampar. Vi undersökte artsammansättningen, andelen mykorrhizasvamp i det totala svampsamhället samt artantalet i förhållande till avståndet till närmaste träd. Vi lät också utföra en kompletterande studie av fruktkroppsförekomster under hösten 2021, för att bättre kunna undersöka tesen att mycel av rödlistade mykorrhizasvampar och signalarter kan överleva i närheten av hänsynsträd precis som vanligare mykorrhizasvamparter.I markprovsundersökningen identifierades 141 olika arter av mykorrhizasvampar varav fyra rödlistade. Resultaten visar ett starkt samband mellan förekomst av mykorrhiza och närhet till träd. Parallellt med att genomsnittsavståndet till träden på ytorna ökade från i genomsnitt tre meter på kontrollytor utan avverkning till 14 meter vid tre procent naturhänsyn minskade successivt andelen mykorrhizasvamp i förhållande till det totala svampsamhället i marken från 11 procent till 2–4 procent och artantalet av mykorrhizasvampar halverades. Samtidigt förändrades artsammansättningen; förekomster av spindelskivlingar och sandsopp minskade successivt med avtagande hänsyn, medan en speciell skinnsvampsart (Piloderma sphaerosporum, saknar svenskt namn), som sedan tidigare är känd för att dominera svampsamhällen i ungskogar som genomgått en hyggesfas, var mindre påverkad.Överlevnad och förekomst av mykorrhizasvampar efter avverkning är direkt kopplad till mängden rötter i marken och den rumsliga fördelningen av levande rotsystem. Fler kvarlämnade hänsynsträd ledde till högre överlevnad. Naturvårdsbränning i kombination med avverkning gav den största förändringen, det vill säga hade störst påverkan på mykorrhizasvamparnas förekomst, artrikedom och artsammansättning. Den främsta anledningen var hög dödlighet hos kvarlämnade träd på grund av den relativt intensiva bränningen. Inventeringen av fruktkroppar kunde påvisa förekomster av ytterligare fem rödlistade svampar och en signalart vid hänsynsträd och längs kanterna till angränsande trädbärande bestånd eller lämnad kantzon mot vatten.Mykorrhizasamhället med den största naturhänsynen (NS-behandlingen), som motsvarade 50 procent lämnade levande hänsynsträd (inklusive katade träd), skilje sig inte tydligt åt från det på kontrollytor utan avverkning. Här var förekomsten av de dominerande mykorrhizasvamparna mer eller mindre intakt. Det är dessa dominerande arter som svarar för merparten av mykorrhizasvamparnas funktionalitet och driver processer i marken. Vid lägre täthet av kvarlämnade hänsynträd minskar de flesta arternas förekomst successivt med tydligast negativ inverkan på sandsopp och spindelskivlingar, som tros spela en viktig roll för trädens näringsupptag från organiska förråd i måren. En mindre tydlig effekt sågs på skinnsvampar, som tros ha lägre förmåga att mobilisera organiskt bunden näring.Det är oklart vilken betydelse denna förskjutning i dominerande arter kan ha över tid för mykorrhizasvamparnas funktion. Det är också oklart i vilken omfattning återetablering av olika arter sker i brukad skog och om artsammansättningen hinner närma sig den som kännetecknar äldre skogar under en omloppstid. Tidigare undersökningar har visat att tydliga förändringar i svampdiversitet kvarstår minst 50 år efter avverkning av tallskog. Högre nivåer av hänsynsträd är ett sätt att minska effekterna av avverkning på diversiteten av mykorrhizasvampar och troligen också snabba på återgången till ett artrikare samhälle med bevarad funktionalitet.Förmodligen kan de allra flesta rödlistade arter och signalarter av mykorrhizasvampar överleva en avverkning med hjälp av hänsynsträd. Utmaningen är att placera hänsynsträden där naturvårdsintressanta svampar växer. Deras förekomster är oftast inte kända när en skog avverkas och om dom finns i beståndet är deras utbredning väldigt lokal, som regel bara med någon eller några få kvadratmeter stora mycel.Vi bedömer att nyttan blir större för både naturvårdsintressanta och funktionellt mer betydelsefulla arter om hänsynsträd sprids över hygget snarare än att de aggregeras på något sätt eller ställs i grupper. På så sätt bör sannolikheten att hänsynsträdens rotsystem överlappar med mycel från ovanligare arter öka samtidigt som funktionellt viktiga arter, som spindelskivlingar, effektivare kan fortleva och spridas i det uppväxande beståndet.Fler hänsynsträd resulterar otvetydigt i att en större del av det gamla beståndets mykorrhizasvampar kommer att överleva en avverkning och fortleva in i det uppväxande beståndet. Undersökningens fortsättning syftar till att kvantifiera effekterna av olika nivåer av hänsyn som underlag för att bättre kunna göra välgrundade avvägningar mellan produktionsintressen och olika naturvårdsintressen.
|
|
| 16. |
- Felton, Adam, et al.
(författare)
-
Correction to: Keeping pace with forestry : Multi-scale conservation in a changing production forest matrix (vol 49, pg 1050, 2020)
- 2020
-
Ingår i: Ambio. - : Springer. - 0044-7447 .- 1654-7209. ; 49:5, s. 1065-1066
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- In the original published article, the sentence “Nevertheless, semi-natural forest remnants continue to be harvested and fragmented (Svensson et al. 2018; Jonsson et al. 2019), and over 2000 forest-associated species (of 15 000 assessed) are listed as threatened on Sweden’s red-list, largely represented by macro-fungi, beetles, lichens and butterflies (Sandström 2015).”under the section Introduction was incorrect. The correct version of the sentence is “Nevertheless, semi-natural forest remnants continue to be harvested and fragmented (Svensson et al. 2018; Jonsson et al. 2019), and approximately 2000 forest-associated species (of 15 000 assessed) are on Sweden’s red-list, largely represented by macro-fungi, beetles, lichens and butterflies (Sandström 2015).”
|
|
| 17. |
- Felton, Adam, et al.
(författare)
-
Keeping pace with forestry : Multi-scale conservation in a changing production forest matrix
- 2020
-
Ingår i: Ambio. - : Springer. - 0044-7447 .- 1654-7209. ; 49:5, s. 1050-1064
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The multi-scale approach to conserving forest biodiversity has been used in Sweden since the 1980s, a period defined by increased reserve area and conservation actions within production forests. However, two thousand forest-associated species remain on Sweden's red-list, and Sweden's 2020 goals for sustainable forests are not being met. We argue that ongoing changes in the production forest matrix require more consideration, and that multi-scale conservation must be adapted to, and integrated with, production forest development. To make this case, we summarize trends in habitat provision by Sweden's protected and production forests, and the variety of ways silviculture can affect biodiversity. We discuss how different forestry trajectories affect the type and extent of conservation approaches needed to secure biodiversity, and suggest leverage points for aiding the adoption of diversified silviculture. Sweden's long-term experience with multi-scale conservation and intensive forestry provides insights for other countries trying to conserve species within production landscapes.
|
|
| 18. |
-
Glänta
- 2021
-
Samlingsverk (redaktörskap) (populärvet., debatt m.m.)
|
|
| 19. |
- Lindahl, Björn, et al.
(författare)
-
A group of ectomycorrhizal fungi restricts organic matter accumulation in boreal forest
- 2021
-
Ingår i: Ecology Letters. - : Wiley. - 1461-023X .- 1461-0248. ; 24, s. 1341-1351
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Boreal forest soils are important global carbon sinks, with significant storage in the organic topsoil. Decomposition of these stocks requires oxidative enzymes, uniquely produced by fungi. Across Swedish boreal forests, we found that local carbon storage in the organic topsoil was 33% lower in the presence of a group of closely related species of ectomycorrhizal fungi - Cortinarius acutus s.l.. This observation challenges the prevailing view that ectomycorrhizal fungi generally act to increase carbon storage in soils but supports the idea that certain ectomycorrhizal fungi can complement free-living decomposers, maintaining organic matter turnover, nutrient cycling and tree productivity under nutrient-poor conditions. The indication that a narrow group of fungi may exert a major influence on carbon cycling questions the prevailing dogma of functional redundancy among microbial decomposers. Cortinarius acutus s.l. responds negatively to stand-replacing disturbance, and associated population declines are likely to increase soil carbon sequestration while impeding long-term nutrient cycling.
|
|
| 20. |
- Lindahl, Björn, et al.
(författare)
-
DNA-baserad övervakning av biodiversitet i svensk skogsmark : provtagning, provhantering och analysmetoder
- 2023
-
Rapport (refereegranskat)abstract
- Det finns ett ökande intresse att inkludera organismer och biodiversitet i miljöövervakning. Markorganismer spelar en avgörande roll i reglering av kollagring och näringsomsättning i terrestra ekosystem. Det svenska skogsbruket har stor påverkan på markens biodiversitet, med risk för långsiktiga effekter på biologiska processer – något som inte är förenligt med Sveriges miljömål. DNA-baserade metoder ger nya möjligheter till identifiering och övervakning av svampar, bakterier och fauna i marken – organismer som tidigare har varit svåra att studera. Skogsmarken karakteriseras av stor rumslig variation. För att kunna anpassa provtagning så att DNA-extrakt och sekvensdata avspeglar organismsamhället och fångar så mycket biodiversitet som möjligt krävs mer kunskap om marksamhällenas heterogenitet på olika skalor. Det finns också en mängd frågor kring hur markprov hanteras på bästa sätt efter att de har samlats in.I 12 olika skogsområden i Uppland använde vi DNA-baserad metodik för att studera den rumsliga variationen i samhällen av svampar och bakterier på olika skalor från 1 dm till 10 m. Huvudsyftet var att ta fram information som grund för effektiv provtagning inom miljöövervakning. Vi studerade också effekter av lagring och vidare hantering av prover. Dessutom testade vi preliminära protokoll för DNAbaserad analys av markfauna.Både svamp- och bakteriesamhällen var tydligt rumsligt strukturerade inom det undersökta avståndsintervallet. Svampsamhällena hade den tydligaste strukturen med distinkta samhällen i 1 dm till över 3 m stora ”fläckar”. Svamp- och bakteriesamhällena uppvisade tydlig samvariation, men var också länkade till variation i växtsamhällen och markkemiska egenskaper. De mikrobiella samhällena ändrades märkbart under lagring i rumstemperatur – populationer av opportunistiska arter växte medan svampar associerade med levande rötter minskade sin andel av DNApoolen. Bilden av organismsamhällena påverkades också av på vilket sätt delprov slogs samman till samlingsprov, och malning hade oväntat stor effekt. Primrarna som testades för DNA-baserad analys av markfaunan gav en otillförlitlig bild av hoppstjärtssamhället, även om resultaten till viss del var lovande.pstjärtssamhället, även om resultaten till viss del var lovande. Den tydliga heterogeniteten i markbiologiska samhällen innebär att tillförlitlig miljöövervakning av markorganismer i skogsmark (och andra markparametrar) bör baseras på samlingsprov av poolade delprov. Markinventeringens DNA-provtagning är idag baserad på 5 delprov, men mer biodiversitet skulle kunna fångas, och bilden av organismsamhällena skulle bli mindre slumpmässig med ett större antal delprov. Delprover bör spridas ut över hela målområdet, med så stort avstånd som möjligt, helst 5–10 m, mellan provpunkterna. Det är kritiskt att proverna fryses in så snabbt som möjligt efter provtagning. Mer studier krävs för att förstå hur malning av proverna påverkar DNA-baserade resultat för olika organismgrupper. DNA-baserad miljöövervakning av markfauna kräver utveckling av nya primrar med optimerad specificitet.
|
|
| 21. |
- Lindblad, Sverker, 1946, et al.
(författare)
-
School lockdown? Comparative analyses of responses to the COVID-19 pandemic in European countries
- 2021
-
Ingår i: European Educational Research Journal. - : SAGE Publications. - 1474-9041. ; 20:5, s. 564-583
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The purpose of this article is to analyse how education and schooling took part in handling the early phase of the COVID-19 pandemic in eight European countries (Denmark, Finland, Germany, Greece, Italy, Norway, Poland and Sweden). The focus is on primary education and on decisions to close schools, or not. Our research was informed by assemblage theory in order to analyse how different components interacted in developing societal responses to mitigate the pandemic. The research was designed as a comparative case study of practical reasoning in diverse contexts. Data sources were the mass media and statements from governments and authorities. Our analyses showed that decisions to close schools, or not, were based on two alternative discourses on schooling. Closing primary schools was a preventive measure underlined by discourses of schools as places for infection. Keeping primary schools open was underlined by a discourse in which schools were conceived of as a place for social supportive measures and caring. Furthermore, the closing alternative was often combined with attempts to replace school practices by distance learning or computerized instruction. Legal constitutions and lawmaking were of significant importance in selecting discourses and the relative impact of different components, mostly political or medical, in responding to the pandemic.
|
|
| 22. |
- Menkis, Audrius, et al.
(författare)
-
Endophytes dominate fungal communities in six-year-old veteranisation wounds in living oak trunks
- 2022
-
Ingår i: Fungal Ecology. - : Elsevier BV. - 1754-5048 .- 1878-0083. ; 59
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Old trees are rare in the landscape, as are many of their associated species. Veteranisation is a method by which attempts are made to create microhabitats, otherwise found only in old trees, in younger trees at an earlier stage than would occur naturally. Here, we analysed the early fungal succession in 6 y-old veteranisation wounds in ca. 100 y old living oak trunks by DNA-barcoding of the wood at eight sites in Sweden and Norway. We hypothesised basidiomycetes would be most abundant, and exposed sapwood and heartwood would select for different communities. We identified 686 fungal taxa, mainly ascomycetes, with a large overlap in species composition and surprisingly similar species richness, i.e. 325 vs. 308–360, between intact and different types of damaged wood, respectively. Endophytes continued to be present and common in damaged wood. The results demonstrate that damage to sapwood and heartwood partly select for different fungi and that 6 y is too early to evaluate if veteranisation can positively favour fungi of conservation interest.
|
|
| 23. |
|
|
| 24. |
- Niskanen, Tuula, et al.
(författare)
-
Pushing the Frontiers of Biodiversity Research: Unveiling the Global Diversity, Distribution, and Conservation of Fungi
- 2023
-
Ingår i: ANNUAL REVIEW OF ENVIRONMENT AND RESOURCES. - 1543-5938 .- 1545-2050. ; 48, s. 149-176
-
Forskningsöversikt (refereegranskat)abstract
- Fungi comprise approximately 20% of all eukaryotic species and are connected to virtually all life forms on Earth. Yet, their diversity remains contentious, their distribution elusive, and their conservation neglected.We aim to flip this situation by synthesizing current knowledge.We present a revised estimate of 2-3 million fungal species with a "best estimate" at 2.5 million. To name the unknown >90% of these by the end of this century, we propose recognition of species known only from DNA data and call for large-scale sampling campaigns.We present an updated global map of fungal richness, highlighting tropical and temperate ecoregions of high diversity. We call for further Red List assessments and enhanced management guidelines to aid fungal conservation. Given that fungi play an inseparable role in our lives and in all ecosystems, and considering the fascinating questions remaining to be answered, we argue that fungi constitute the next frontier of biodiversity research.
|
|
| 25. |
- Redr, Deanne, et al.
(författare)
-
The mating type system of the rare polypore Hapalopilus croceus
- 2020
-
Ingår i: Fungal Ecology. - : Elsevier BV. - 1754-5048 .- 1878-0083. ; 45
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Hapalopilus croceus is a rare, wood-decay polypore associated with old coarse broadleaf trees, primarily Quercus. It is mainly distributed throughout the temperate zone of the Northern Hemisphere with its main distribution in Europe. Mating systems in fungi influence the probability of in- or outbreeding and may affect the species' fitness. We found the mating system of H. croceus to be bipolar by pairing 18 single spore isolates from one sporocarp. We discuss this finding from the perspective of H. croceus as a threatened species with a very small and fragmented current population associated with a declining habitat and globally red-listed as Vulnerable (VU). (C) 2020 Elsevier Ltd and British Mycological Society. All rights reserved.
|
|
| 26. |
- Schmidt, Tobias, et al.
(författare)
-
Synovial monocytes contribute to chronic inflammation in childhood-onset arthritis via IL-6/STAT signalling and cell-cell interactions
- 2023
-
Ingår i: Frontiers in Immunology. - 1664-3224. ; 14
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- INTRODUCTION: Monocytes are key effector cells in inflammatory processes. We and others have previously shown that synovial monocytes in childhood-onset arthritis are activated. However, very little is known about how they contribute to disease and attain their pathological features. Therefore, we set out to investigate the functional alterations of synovial monocytes in childhood-onset arthritis, how they acquire this phenotype, and whether these mechanisms could be used to tailorize treatment.METHODS: The function of synovial monocytes was analysed by assays believed to reflect key pathological events, such as T-cell activation-, efferocytosis- and cytokine production assays using flow cytometry in untreated oligoarticular juvenile idiopathic arthritis (oJIA) patients (n=33). The effect of synovial fluid on healthy monocytes was investigated through mass spectrometry and functional assays. To characterize pathways induced by synovial fluid, we utilized broad-spectrum phosphorylation assays and flow cytometry, as well as inhibitors to block specific pathways. Additional effects on monocytes were studied through co-cultures with fibroblast-like synoviocytes or migration in transwell systems.RESULTS: Synovial monocytes display functional alterations with inflammatory and regulatory features, e.g., increased ability to induce T-cell activation, resistance to cytokine production following activation with LPS and increased efferocytosis. In vitro, synovial fluid from patients induced the regulatory features in healthy monocytes, such as resistance to cytokine production and increased efferocytosis. IL-6/JAK/STAT signalling was identified as the main pathway induced by synovial fluid, which also was responsible for a majority of the induced features. The magnitude of synovial IL-6 driven activation in monocytes was reflected in circulating cytokine levels, reflecting two groups of low vs. high local and systemic inflammation. Remaining features, such as an increased ability to induce T-cell activation and markers of antigen presentation, could be induced by cell-cell interactions, specifically via co-culture with fibroblast-like synoviocytes. CONCLUSIONS: Synovial monocytes in childhood-onset arthritis are functionally affected and contribute to chronic inflammation, e.g., via promoting adaptive immune responses. These data support a role of monocytes in the pathogenesis of oJIA and highlight a group of patients more likely to benefit from targeting the IL-6/JAK/STAT axis to restore synovial homeostasis.
|
|
