| 1. |
- Dock, H., et al.
(författare)
-
Maintenance of the E.coli dcm Methylation of the CMV Promoter, in Contrast to Hypomethylation of the Recognition Sequence of Transcription Factor NFkB in Transfected GBM Cells
- 2016
-
Ingår i: Cloning & Transgenesis. - : OMICS Publishing Group. - 2168-9849. ; 5:1
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The human cytomegalovirus (CMV) immediate early promoter has been extensively used to drive target gene expression in transgenic mammalian cells. DNA methylation of the CMV promoter has been shown to be the reason for a reduced promoter activity and silencing of the target gene. We have established an in vitro model system, in which human brain cancer cells (glioblastoma multiforme, GBM) were transfected with pAdTrack-CMV-GFP plasmid, isolated from a dcm positive (dcm+) E. coli strain. We found that in two CCTGG sequences located at position from -304 to -300 nt and from -497 to -493 nt of the CMV promoter region, the internal C was methylated in all analyzed clones, i.e., the E. coli dcm methylation pattern is maintained in the CMV promoter region after its integration into the human genome. In contrast, we found that the recognition sites for the transcription factor NFkB and certain other transcription factors in the enhancer region of the CMV promoter (from -107 to -270 nt) were hypomethylated. This might explain why the CMV promoter maintained an active mode, driving the GFP expression despite the demonstrated methylation of the CMV promoter. We noticed that the CCTGG sequence is also contained in the binding sequence motif of transcription factor NFkB. Hence we have comprehensively studied transcription factors through a database searching, and the responsive elements that contain dcm methylation sequences CCW(A/T)GG. A list of transcription factors and the corresponding regulated genes are presented.
|
|
| 2. |
- Edvardsson, Karin, 1980-, et al.
(författare)
-
Objektiv mätmetod för tillståndsbedömning av grusväglag
- 2015
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Fram tills nu har tillståndsmätningar på grusvägnätet gjorts subjektivt enligt Trafikverkets metodbeskrivning. I denna rapport redovisas en objektiv metodik för kontinuerlig mätning av ojämnheter, löst grus, damm och tvärfall på grusväg. Projektet som redovisas i rapporten syftar till att utveckla en tillförlitlig, objektiv och mobil metodik för kontinuerlig mätning av tillståndsparametrarna på grusväg samt att rekommendera en objektiv inventeringsmetod för dräneringstillståndet i en grusvägskonstruktion. Metodiken har tagits fram för att ge större möjligheter till bedömningar av optimal åtgärd och åtgärdstidpunkt samt för att kunna ligga till grund för nya metod- och standardbeskrivningar samt definition av lägsta acceptabla standard. Resultatet visar att de objektiva tillståndsmått som bäst tycks beskriva efterfrågad funktionalitet på grusväg är acceleration uppmätt med en applikation i en smarttelefon vad gäller jämnhet, samt uppmätt med laserutrustad mätbil: makrotextur vad gäller löst grus och laserpulsens genomsnittliga reflektionstid över vägens tvärprofil vad gäller damm. Som en objektiv inventeringsmetod för dräneringstillståndet hos en grusväg föreslås dikesmätningar (med sveplaserteknik) som säkerställer tillfredställande dikesdjup, tvärfallsmätningar (med laserutrustad mätbil), mätningar av stödremsan (med sveplaserteknik) som säkerställer att det inte förekommer kanthäng etc. som i sin tur förhindrar vattenavrinning från vägen, samt mätning av återkommande och/eller snabbt tillväxande ojämnheter. Eftersom grusväglagstillståndet är så snabbt föränderligt på en grusväg behövs en snabb och förenklad variant av vägytemätning om det ska vara kostnadseffektivt med dessa typer av mätningar på vägnätsnivå. Att använda en smarttelefon med en applikation för jämnhetsmätning är ett enkelt och kostnadseffektivt sätt att generera aktuell tillståndsdata för grusvägnätet. Applikationen skulle också kunna kompletteras med en knapp för att allmänheten ska kunna rapportera och märka ut skador på vägen eller kopplas ihop med entreprenörens GPS-uppkopplade inrapporteringssystem för att märka ut speciellt intressanta platser, såsom platser för tjällyftning eller erosion.
|
|
| 3. |
- Gusarova, Viktoria, et al.
(författare)
-
Genetic inactivation of ANGPTL4 improves glucose homeostasis and is associated with reduced risk of diabetes
- 2018
-
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 9, s. 1-11
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Angiopoietin-like 4 (ANGPTL4) is an endogenous inhibitor of lipoprotein lipase that modulates lipid levels, coronary atherosclerosis risk, and nutrient partitioning. We hypothesize that loss of ANGPTL4 function might improve glucose homeostasis and decrease risk of type 2 diabetes (T2D). We investigate protein-altering variants in ANGPTL4 among 58,124 participants in the DiscovEHR human genetics study, with follow-up studies in 82,766 T2D cases and 498,761 controls. Carriers of p.E40K, a variant that abolishes ANGPTL4 ability to inhibit lipoprotein lipase, have lower odds of T2D (odds ratio 0.89, 95% confidence interval 0.85-0.92, p = 6.3 × 10-10), lower fasting glucose, and greater insulin sensitivity. Predicted loss-of-function variants are associated with lower odds of T2D among 32,015 cases and 84,006 controls (odds ratio 0.71, 95% confidence interval 0.49-0.99, p = 0.041). Functional studies in Angptl4-deficient mice confirm improved insulin sensitivity and glucose homeostasis. In conclusion, genetic inactivation of ANGPTL4 is associated with improved glucose homeostasis and reduced risk of T2D.
|
|
| 4. |
- Kajko-Mattsson, Mira, et al.
(författare)
-
Everything is possible to structure-even the software engineering body of knowledge
- 2017
-
Ingår i: Proceedings - 2017 IEEE/ACM 1st International Workshop on Software Engineering Curricula for Millennials, SECM 2017. - : Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE). - 9781538627952 ; , s. 61-67
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- Everything is possible to structure, even the software engineering body of knowledge. In this paper, we suggest a conceptual model of the software engineering body of knowledge. The model is a restructured version of SWEBOK and ACM/IEEE Curriculum Guidelines. It constitutes the first attempt to create an underlying structure that is common to most of the software engineering bodies of knowledge.
|
|
| 5. |
- Lundberg, Thomas, 1965-, et al.
(författare)
-
Makrotexturens möjlighet att identifiera låg friktion : tillståndsmätning av vägytan
- 2015
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Trafikverket vill kunna beskriva friktionen för hela det statliga vägnätet. En rikstäckande friktionsmätning är praktiskt svår att hantera och mycket kostsam medan vi redan idag mäter vägytans makrotextur. I projektet testar vi om makrotexturen (MPD, Mean Profile Depth) kan användas för att beskriva friktionstillståndet på vägnätet. Vi har inte kunnat visa på detta samband men vi redovisar andra intressanta iakttagelser som ger en pusselbit till hur Trafikverket kan och bör hantera friktionsfrågan. Vi ser bland annat att risken för låg friktion är större på vägavsnitt som har låga MPD-värden speciellt på lappade ytbehandlade vägar med blödningar. Vidare beskriver vi vilka friktionsrisker det finns med olika beläggningar och hur dessa kan hanteras.
|
|
| 6. |
- Lundberg, Thomas, 1965-, et al.
(författare)
-
New technology for road surface measurement : transverse profile and rut depth
- 2018
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- The condition of the national coated road network is measured annually in Sweden and Finland. The measuring technology has been unchanged over a long period of time, which has its benefits. As the measurements are performed using the same technology, trends and measurement series are retained without any disruption. In addition, the technology currently used is reliable and can be procured at a price level that has fallen rather than risen over the years. The principal area of use for condition measurement is to provide maintenance work with an objective basis for the planning of surfacing, but when it is found that current objective condition data can only explain between 40 and 75 percent (depending on class of traffic) of the action actually taken on the road network, consideration must be given to whether new condition data need to be added. The information that is lacking is thought to be information on surface damage and cracks. This requires new measuring technology.If new technology will be adopted, for the collection of condition data, the dependability of the basic measured quantities must be ensured before new options and measured quantities are examined. This study is therefore focused only on transverse-profile measurement and measures of unevenness in the transverse direction (rut depth and ridge height).The study has examined two of the leading new technologies that operate with scanning lasers, LCMS from Pavemetrics and PPF from Fraunhofer. The outcome of the study shows that the technology is good, and that accuracy and repeatability are comparable to the present-day point-laser systems. It is also deemed possible to retain criteria and requirements for the procurement of measurement services when the new technology is used.
|
|
| 7. |
- Lundberg, Thomas, 1965-, et al.
(författare)
-
Ny teknik för vägytemätning : tvärprofil och spårdjup
- 2018
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- I Sverige och Finland mäts tillståndet på det statliga belagda vägnätet årligen. Mättekniken har varit densamma under en lång tid vilket har sina fördelar. I och med att mätningarna utförs med samma mätteknik bibehålls trender och mätserier utan störningar. Den nuvarande tekniken är dessutom driftsäker och kan handlas upp till en prisnivå som genom åren snarare sjunkit än ökat. Det huvudsakliga användningsområdet för tillståndsmätningen är att förse underhållsverksamheten med ett objektivt underlag för beläggningsplaneringen, men när det visar sig att nuvarande objektiva tillståndsdata endast kan förklara mellan 40 och 75 procent (beroende av trafikklass) av de åtgärder som verkligen görs på vägnätet, måste det övervägas om denna ska kompletteras med nya tillståndsdata. Den information som saknas tros vara information om ytskador och sprickor. Detta kräver ny mätteknik.Om ny teknik ska börja anammas, för insamling av tillståndsdata, måste först de grundläggande mätstorheternas tillförlitlighet säkerställas, innan nya möjligheter och mätstorheter undersöks. Denna studie är därför endast inriktad på tvärprofilmätning och mått för ojämnhet i tvärled (spårdjup och spårrygg).I studien har två av de ledande nya teknikerna som arbetar med skannande laser undersökts, LCMS från Pavemetrics och PPS från Fraunhofer. Resultatet av studien visar att tekniken är bra, noggrannhet och repeterbarhet går att jämföra med de nuvarande punktlasersystemen. Kriterier och krav för upphandling av mättjänster där den nya tekniken används bedöms också kunna bibehållas.
|
|
| 8. |
- Lundberg, Thomas, 1965-, et al.
(författare)
-
Svenska vägtillståndsmått, då, nu och i morgon : del 3: i morgon – år 2010 och framåt
- 2015
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- På uppdrag av Trafikverket har VTI gjort ett arbete med att utveckla och föreslå mått som på ett bättre sätt beskriver skador eller felaktigt konstruerade vägavsnitt utifrån data insamlade med vägytemätbilar. Måtten ska kunna användas för att karakterisera vägnätets tillstånd och förändringen när detta trafikeras och belastas. I denna rapport föreslås fyra nya mått samt förändring i användningen och beräkning av ytterligare två mått. Dessa nya mått kan komplettera dagens mått med ytterligare information om vägens tillstånd. Huvudprincipen vid utvecklingen av de nya måtten har varit att utnyttja befintliga data och skapa ett nytt enskilt mått eller ett nytt mått byggt på en kombination av andra mått så att det nya måttet svarar mot en specifik effekt eller egenskap, till exempel säkerhetsrisk. I samband med utvecklingen av de nya måtten har även gränsvärden för dessa föreslagits som kan användas i underhållsstandarden. De mått som är framtagna i denna sista fas av projektet ”Nya mått” och vilka kan komplettera dagens underhållsstandard är: • mått för ytskador (små och större ytskador). • tvärfallsvariation. • lokala ojämnheter (ny definition). • vattenarea. • kantdjup (ny definition). • IRI vänster (komplement till IRI höger).Denna rapport beskriver nya vägtillståndsmått för perioden 2010 och framåt. Två tidigare rapporter i denna serie beskriver mått för perioden 1987–2005 (R717, 2013) respektive år 2006–2009 (R718, 2011).
|
|
| 9. |
- Lundberg, Thomas, 1965-, et al.
(författare)
-
Trafikverkets upphandling av vägytemättjänsten för vägnät 2014 för perioden 2015–2018 (2019) : vägnätsmätning med mätbil
- 2017
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Trafikverket följer årligen upp tillståndet på det statliga belagda vägnätet med mätbil. Det är en verksamhet som fortfarande i grunden har samma tekniska lösning som vid starten 1986. Under åren har dock antalet mätstorheter ökat, mätkvaliteten förbättrats och metoderna förfinats. Syftet med mätningarna är, förutom att följa det övergripande tillståndet på vägnätet, att få ett underlag för beläggningsplanering och val av åtgärdsobjekt. Vi kan se tillståndsmätningen som en första skanning att välja åtgärdskandidater vilka ofta kompletteras av, och slutligen väljs ut med kunskap hos Trafikverkets projektledare. Trafikverket vill i förlängningen kunna beskriva tillståndet från vägytemätningen ännu mer tillförlitligt för att projektledarnas val ska underlättas och bli än mer objektivt underbyggt.Med tekniskt stöd av VTI upphandlas mättjänsten av Trafikverket. Upphandlingen av vägytemättjänsten för perioden 2015 till 2018 (plus optionsår 2019) genomfördes som en selektiv upphandling där sex deltagande företag (leverantörer) bjöds in till upphandlingen. Tre av företagen valde att delta i de tekniska testerna och därmed fullfölja upphandlingen. De tekniska testerna går ut på att undersöka leverantörernas förmåga att under produktionsliknande förhållanden utföra mätningar enligt i förväg beskrivna förhållanden och uppställda kravgränser. Denna rapport sammanfattar utfallet av de tekniska testerna.
|
|
| 10. |
- Sjögren, Leif, 1953-
(författare)
-
Data quality management related to road infrastructure condition and safety
- 2016
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- When doing safety and accident studies related to road surface characteristics the quality of the used data are of extreme importance. The definition, the techniques and strategy of collection of both condition as accident data can differ a lot between and within countries. An example of such confusion is the data considering pavement friction and skid resistance. In Europe currently more than 15 measuring devices for skid resistance are covered in the CEN standards. The availability of enough friction is the most essential road characteristic for safety issues. Other examples is the use of expressions of road condition such as rut depth. No standard exist and different calculations are used implying that they need careful consideration before exchange of accident analysis results are done. Most road surface indicators are developed for indication of road wear, not accident analysis. The Road Administration in Sweden have paid attention to this and made a number of actions to improve the quality of data. There are many quality aspects on data and data collection such as reliability, robustness, suitability for the purpose (relevant), performance, safe to collect, easy to maintain and costs. This presentation will present some actions and quality improvements for data and data collection that has been done in Sweden.
|
|
| 11. |
- Sjögren, Leif, 1953-
(författare)
-
Friction requirements on roads, paths and cycleways in summer road condition in Sweden : a pilot study
- 2018
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- The Swedish Transport Agency is working to achieve good accessibility, high quality, secure andenvironmentally aware rail, air, sea and road transport. They have overall responsibility for drawing upregulations. Recently they commissioned VTI to review and give recommendations on friction/skidresistance measurements in Sweden (dry road condition). Up to now, no common rules for frictiontesting exist for all roads and paths. The present rules only applies to governmental owned andmaintained road. The new challenge is to include urban roads, cycleways and walking paths as well. Wehave studied used methods and rules, mainly in the Nordic countries and especially looked atmotivations of requirements, measured friction levels and the desired thresholds. Finally, after analysisof the review results we have recommended methods and assessed risks of the suggestions. The reviewhave resulted in a set of recommendations such as what measurement methods to use, practical thresholdtriggers but also what needs to be further investigated. This paper will present the results from thereview.
|
|
| 12. |
|
|
| 13. |
- Sjögren, Leif, 1953-
(författare)
-
Kvalitet hos vägytedata
- 2015
-
Ingår i: Transportforum 2015.
-
Konferensbidrag (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 14. |
|
|
| 15. |
- Sjögren, Leif, 1953-, et al.
(författare)
-
Safety, friction and monitoring to fit under infrastructure
- 2018
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- This special session is organized in order to share the knowledge about the safety, friction, and monitoring to fit under infrastructure. While considering a big trend of the society such as aged-society, rapid change of climate, more populated city living, the safety of vehicle users, bicyclists and pedestrians is getting important. This special session has a focus on the relationship between the safety service provided by infrastructure with related to the pavement for vehicular movement and walking and riding surface for the bicyclists and pedestrians. Through the special session, the organizers hope to share the international practice about this topic, and more safety and sustainable infrastructure can be reached.
|
|
| 16. |
- Sjögren, Leif, 1953-, et al.
(författare)
-
State of the art in monitoring road condition and road/vehicle interaction : Technical Committee 4.2 Road Pavements
- 2016
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- This report summarises the current state of the art regarding the collection of road condition and road/vehicle interaction data, providing an overview of current practice and emerging technologies. Technologies in the development and experimental stages are generally not discussed. The document is intended to concisely inform the reader of the range of technologies available, and not to replicate the considerable detail that is available elsewhere for specific technologies. Each of the commonly measured road condition and road/vehicle interaction data parameters is discussed, providing a definition of each of these parameters, a description of the common measurement methods and a description of the condition/interaction indicators that are derived from the measured data. The need for robust quality management in the collection of road condition data is highlighted, and guidance provided.
|
|
| 17. |
|
|
| 18. |
- Sjögren, Vilhelm, et al.
(författare)
-
Safety and efficacy of well managed warfarin : A report from the Swedish quality register Auricula
- 2015
-
Ingår i: Thrombosis and Haemostasis. - 0340-6245 .- 2567-689X. ; 113:6, s. 1370-1377
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The safety and efficacy of warfarin in a large, unselected cohort of warfarin-treated patients with high quality of care is comparable to that reported for non-vitamin K antagonists. Warfarin is commonly used for stroke prevention in atrial fibrillation, as well as for treatment and prevention of venous thromboembolism. While reducing risk of thrombotic/embolic incidents, warfarin increases the risk of bleeding. The aim of this study was to elucidate risks of bleeding and thromboembolism for patients on warfarin treatment in a large, unselected cohort with rigorously controlled treatment. This was a retrospective, registry-based study, covering all patients treated with warfarin in the Swedish national anticoagulation register Auricula, which records both primary and specialised care. The study included 77,423 unselected patients with 100,952 treatment periods of warfarin, constituting 217,804 treatment years. Study period was January 1, 2006 to December 31, 2011. Atrial fibrillation was the most common indication (68%). The mean time in therapeutic range of the international normalised ratio (INR) 2.0-3.0 was 76.5%. The annual incidence of I severe bleeding was 2.24% and of thromboembolism 2.65%. The incidence of intracranial bleeding was 0.37% per treatment year in the whole population, and 0.38% among patients with atrial fibrillation. In conclusion, warfarin treatment where patients spend a high proportion of time in the therapeutic range is safe and effective, and will continue to be a valid treatment option in the era of newer oral anticoagulants.
|
|
| 19. |
- Wright, Alex E., et al.
(författare)
-
Hi-SPEQ : Developing the Technical and Quality Requirements for High-speed Condition Surveys of Road Networks
- 2016
-
Ingår i: Transportation Research Procedia. - : Elsevier BV. - 2352-1465. ; , s. 2956-2965
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- High speed surveys have become a key source of information to support condition assessment and management of pavement assets. These surveys can be applied network wide to obtain data on the surface condition and structural robustness of the pavement. However, these advances bring challenges to road administrations in determining the most appropriate survey to specify for their networks, in selecting the equipment, and in ensuring that the condition parameters delivered will be suitable to support asset management decisions. Although standards have been developed for some of the measurements provided by high speed systems, the focus tends to be highly technical, often not considering the wide ranging needs of routine network level implementation.The HiSPEQ project has the objective of developing guidance and advice to help road administrations to understand high speed road survey equipment, and to help them in specifying the survey requirements, quality regimes and processing procedures. The project has considered high speed survey data that can be used to assess pavement structural robustness. It has investigated the measurement of pavement shape, visual condition, deflection and structure. Via review of current specifications both within and outside the EU, and direct consultation with practitioners and administrations, the project has proposed a set of core requirements for high-speed surveys of pavement surface and structural condition.
|
|
