| 1. |
- Thorell, Kaisa, 1983, et al.
(författare)
-
In vivo analysis of the viable microbiota and Helicobacter pylori transcriptome in gastric infection and early stages of carcinogenesis
- 2017
-
Ingår i: Infection and Immunity. - 1098-5522 .- 0019-9567. ; 85:10
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Emerging evidence shows that the human microbiota plays a larger role in disease progression and health than previously anticipated. Helicobacter pylori, the causative agent of gastric cancer and duodenal and gastric ulcers, was early associated with gastric disease, but it has also been proposed that the accompanying microbiota in Helicobacter pylori-infected individuals might affect disease progression and gastric cancer development. In this study, the composition of the transcriptionally active microbial community and H. pylori gene expression were determined using metatranscriptomic RNA sequencing of stomach biopsy specimens from individuals with different H. pylori infection statuses and premalignant tissue changes. The results show that H. pylori completely dominates the microbiota not only in infected individuals but also in most individuals classified as H. pylori uninfected using conventional methods. Furthermore, H. pylori abundance is positively correlated with the presence of Campylobacter, Deinococcus, and Sulfurospirillum. Finally, we quantified the expression of a large number of Helicobacter pylori genes and found high expression of genes involved in pH regulation and nickel transport. Our study is the first to dissect the viable microbiota of the human stomach by metatranscriptomic analysis, and it shows that metatranscriptomic analysis of the gastric microbiota is feasible and can provide new insights into how bacteria respond in vivo to variations in the stomach microenvironment and at different stages of disease progression.
|
|
| 2. |
- Amisten, Stefan, et al.
(författare)
-
Gene expression profiling for the identification of G-protein coupled receptors in human platelets
- 2008
-
Ingår i: Thrombosis Research. - : Elsevier BV. - 1879-2472 .- 0049-3848. ; 122:1, s. 47-57
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- INTRODUCTION AND MATERIALS AND METHODS: G-protein coupled receptors (GPCRs) play an important role in platelet aggregation. To identify new platelet GPCRs, a platelet gene expression profile was generated and validated using quantitative real-time PCR. RESULTS: In total, mRNA of 28 GPCR genes was detected in human platelets. The 12 most abundant platelet GPCR transcripts were: thrombin receptor PAR1 (1865+/-178%), ADP receptor P2Y(12) (459+/-88%), succinate receptor 1 (257+/-48%), ADP receptor P2Y(1) (100%), orphan P2RY(10) (68.2+/-3.3%), lysophosphatidic acid receptors GPR23 (48.2+/-11%) and GPR92 (26.1+/-3.3%), adrenergic receptor alpha(2A) (18.4+/-4.4%), orphan EBI2 (6.31+/-0.42), adenosine receptors A(2A) (2.94+/-0.24%) and A(2B) (2.88+/-0.16%) and lysophosphatidic acid receptor LPA(1) (2.59+/-0.39%) (% relative to the chosen calibrator P2Y(1)). A surprising G-protein coupled receptor redundancy was found: two ADP receptors (P2Y(1) and P2Y(12)), three adenosine receptors (A(2A), A(2B), and A(1)), four lysophosphatidic acid receptors (LPA(1), LPA(3), GPR23 and GPR92), two l-glutamate receptors (mGlu(3) and mGlu(4)) and two serotonin receptors (5-HT(1F) and 5-HT(4)). The adenosine receptor A(2B) gene expression was validated with protein expression and functional studies. Western blot confirmed A(2B) receptor protein expression and platelet flow cytometry demonstrated inhibition of the effect of NECA by the adenosine A(2B)-antagonist MRS1754. CONCLUSIONS: We have detected several GPCRs not previously known to be expressed in platelets, including a functional adenosine A(2B) receptor. The findings could improve our understanding of platelet aggregation and provide new targets for drug development.
|
|
| 3. |
- Björnstig, Ulf, et al.
(författare)
-
Tågolyckan på Once station, Buenos Aires 2012
- 2019
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Händelsen: Tågolyckan inträffade på morgonen den 22 februari 2012 när ett lokaltåg okontrollerat körde in i stoppanordningen i slutet av perrongen på Once station, i centrala Buenos Aires. Hastigheten var mellan 20 och 27 km i timmen, men stoppet var så kraftigt att vagn nummer två trängde sex meter in i vagn nummer ett. Sammanlagt skadades cirka 850 personer varav 51 avled, de flesta omkom i samband med att de två första vagnarna klämdes ihop. Bidragande faktorer till att så många skadades var, ett överfullt tåg av äldre modell, som var dåligt underhållet, och kördes av en organisation med låg säkerhetsmedvetenhet. Händelsen visar att en masskadesituation kan uppstå även vid låga hastigheter. Räddningsinsatsen var omfattande: ett hundratal ambulanser, tre helikoptrar och mer än 500 räddningsarbetare engagerades för att omhänderta skadade och fördela dem mellan huvudstadens 13 akutsjukhus. Beredskapen i Buenos Aires var god vid denna händelse, tack vare genomförda risk- och sårbarhetsanalyser, övningar och utbildningsinsatser. Den argentinska akutmedicinska responsorganisationen och sjukhusen arbetade i stor utsträckning enligt samma katastrofmedicinska principer som i Sverige. Händelsen kunde därför analyseras utifrån ett svenskt perspektiv.Erfarenheter: Sverige har varit relativt förskonat från tågolyckor med många svårt skadade. Däremot har tillbuden ökat kraftigt och järnvägssystemet är idag slitet och överbelastat. Det finns därför anledning att studera inträffade tågolyckor i världen för att dra lärdom av internationella erfarenheter av olika skadebegränsande faktorer som kan vara av betydelse för svensk katastrofmedicinsk beredskap. Det går att dra flera lärdomar ifrån tågolyckan på Once-stationen.Nedan redovisas ett antal sammanfattande slutsatser från händelsen med relevans för den svenska beredskapen:• Det finns en risk att händelser med många svårt skadade kan inträffa även vid låga hastigheter.• Tågens konstruktion, utformningen av koppel och deformationszoner, samt materielens förslitningsgrad är av stor betydelse för säkerheten.• Risken att passagerare, bagage och lösa föremål kastas runt i tågvagnen vid en häftig inbromsning är påtaglig.• Buffertstopp som är konstruerade så att de ger upphov till ett abrupt stopp, utgör en riskfaktor för allvarliga deformationsförlopp och skador, även vid låga hastigheter. TÅGOLYCKAN PÅ ONCE STATION, BUENOS AIRES 2012 SOCIALSTYRELSEN 9• Brister i företags och myndigheters kvalitetssäkring av sin verksamhet bidrar till att risken för händelser som tågolyckan på Once-stationen inträffar.• Varningar om tekniska fel som inte tas på allvar i organisationens säkerhetsarbete utgör en riskfaktor.• Bristande träning bland räddningspersonal i de räddningstekniska svårigheter som kan uppstå vid en tågolycka, till exempel att ta loss fastklämda, kan bidra till att hantering av drabbade fördröjs.• Förmågan att bedöma situationen och prioritera bland de drabbade i samråd med medicinskt ansvarig kan sannolikt vara av stor betydelse för att minska insatstiden till de svårast klämda och skadade.• Samtliga sjukhus bör ha en i förväg fastställd förmåga att ta emot patienter vid förstärknings- respektive katastrofläge, så att särskild sjukvårdsledning på regional nivå har möjlighet att snabbt fördela ett stort antal skadade.• En väl fungerande plan för krisstöd och samlad anhörigupplysning underlättar för den somatiska vården. Brister i en sådan plan får stora konsekvenser för allmänhetens förtroende.• För att hantera en lika stor tågolycka i Sverige kan flera regioner behöva engageras, vilket ställer stora krav på ledningsförmågan i den drabbade regionen. Dessutom behövs en effektiv samverkan mellan lokal, regional och nationell nivå. Det är därför nödvändigt med en gemensam nationell ledningsmodell vid särskild händelse, gemensamma kris- och katastrofmedicinska utbildningar och regelbundna övningar.
|
|
| 4. |
- Brorsson, Sofia, et al.
(författare)
-
Maximal strength in one leg squat correlates with acceleration capacity and agility
- 2010
-
Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
- INTRODUCTION: In many intermittent team sports capacities such as speed, agility and explosiveness are important for performance and are evaluated by sprint-, agility- and strength tests. Earlier studies have shown strong correlations between strength in the two leg squat exercise and sprint performance in various distances but not in sprint performance in agility. Studies evaluating squat strength predominantly perform tests on two legs even when they test athletes involved in intermittent sports where sprinting and agility are common features. Thus, the purpose of this study was to investigate the correlation between maximal strength in a one leg squat (Bulgarian split squat) and acceleration capacity in various sprint distances and agility.METHODS: The test group consisted of 19 men (mean age 24 ± 2 years ) with experience in intermittent team sports. Acceleration capacity was assessed by sprint tests at 5, 10 and 20 meters and agility was evaluated using the zigzag agility test. The timing was made using photocells (Muscle lab,Ergotest Technology,Norway). The Bulgarian split squat was performed in a smith machine with the barbell on the shoulders to a depth of 110 degrees between tibia and femur.RESULTS: The results show significant correlation between maximal strength in the Bulgarian split squat and sprint capacity in the 5 and 10 meter sprint test (Rp= -0,56; p<0.01) as well as the agility test. Maximal strength relative to bodyweight showed significant correlation with the 5 and 20 meter sprint (Rp=-0,62; p< 0,01) as well as the agility test. The zigzag agility test also showed significant correlation between all distances in the sprint tests (p<0.01).CONCLUSION: The results from this study show that there maximal strength in one leg correlate significantly with both acceleration capacity and agility. Implementing one leg exercises in the strength and conditioning routine can be useful for athletes in intermittent sports wanting to improve agility and short sprinting capacity. Further implications is that the Bulgarian split squat could be a more functional test for agility performance than the squat on two legs which predominantly is being used today.
|
|
| 5. |
-
- 2019
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)
|
|
