SwePub
Sök i SwePub databas

  Utökad sökning

Träfflista för sökning "WFRF:(Darling Aaron) ;hsvcat:3"

Sökning: WFRF:(Darling Aaron) > Medicin och hälsovetenskap

  • Resultat 1-2 av 2
Sortera/gruppera träfflistan
   
NumreringReferensOmslagsbildHitta
1.
  •  
2.
  • Quince, Christopher, et al. (författare)
  • DESMAN : a new tool for de novo extraction of strains from metagenomes
  • 2017
  • Ingår i: Genome Biology. - : BIOMED CENTRAL LTD. - 1465-6906 .- 1474-760X. ; 18
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • We introduce DESMAN for De novo Extraction of Strains from Metagenomes. Large multi-sample metagenomes are being generated but strain variation results in fragmentary co-assemblies. Current algorithms can bin contigs into metagenome-assembled genomes but are unable to resolve strain-level variation. DESMAN identifies variants in core genes and uses co-occurrence across samples to link variants into haplotypes and abundance profiles. These are then searched for against non-core genes to determine the accessory genome of each strain. We validated DESMAN on a complex 50-species 210-genome 96-sample synthetic mock data set and then applied it to the Tara Oceans microbiome.
  •  
Skapa referenser, mejla, bekava och länka
  • Resultat 1-2 av 2

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy